野生花生全基因组SSR标记的开发与应用

发布时间：2023-03-09 18:01

　　栽培花生(Arachis hypogaea L.)在中国、印度、美国等广泛种植,是世界上重要的油料作物和经济作物。除了用于榨油外,花生也被用做鲜食或被加工成各种食品,花生在我国农民增收、农业结构调整中有着巨大的发展潜力和重要产业地位。目前,分子标记辅助选择(Marker assisted selection,MAS)已经成为作物育种的重要手段。分子标记辅助选择具有快速、准确且不受环境因素的干扰的优点,提升了育种的效率并缩短了育种周期。除了高油酸性状外,花生的其他性状鲜有分子标记辅助育种的报道。和水稻、玉米、小麦等粮食作物相比,花生的MAS还处于起步阶段,其中,分子标记数量少是制约花生分子标记辅助选择发展的重要限制因素。本研究基于花生二倍体祖先种的全基因组测序的序列信息,开发了大量的花生基因组SSR标记,并将花生的SSR分子标记应用到花生杂交种F1真伪鉴定、抗叶斑病QTL分析等工作中,研究结果将为花生高密度遗传图谱构建、重要基因的定位、图位克隆及分子标记辅助选择育种奠定基础,主要研究结果如下:1、花生全基因组SSR分子标记的开发在花生野生祖先种全基因组测序的基础上,从花生祖先种Arach...

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【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
中英文缩略表
1 文献综述
    1.1 分子标记技术的发展
        1.1.1 第一代分子标记
        1.1.2 第二代分子标记
        1.1.3 SSR分子标记原理
        1.1.4 第三代分子标记
    1.2 花生分子标记的开发及应用
        1.2.1 花生分子标记的开发
        1.2.2 花生SSR标记的应用
        1.2.3 本研究的内容和意义
2 实验材料与方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 供试花生材料
        2.1.2 主要试剂盒和成品试剂
        2.1.3 试剂配置
        2.1.4 主要仪器设备
    2.2 实验方法
        2.2.1 花生全基因SSR位点的鉴定的方法
        2.2.2 花生全基因SSR引物的设计
        2.2.3 电子PCR(InSilicoPCR)方法
        2.2.4 基因组DNA提取
3 结果与讨论
    3.1 花生全基因组SSR的位点的鉴定
        3.1.1 花生全基因组SSR位点的数量、种类和统计分析
        3.1.2 花生全基因组SSR位点在花生不同染色体上的分布
    3.2 花生全基因组SSR标记的开发
        3.2.1 花生全基因组SSR引物的设计
        3.2.2 花生全基因组SSR引物的电子PCR分析
        3.2.3 花生SSR引物在花生野生种和栽培种的实际扩增情况
    3.3 花生全基因组SSR标记的应用
        3.3.1 花生SSR标记在花生野生种中的应用
        3.3.2 利用分子标记进行花生杂交F1真伪鉴定
        3.3.3 基因组SSR分子标记对花生种质资源进行鉴定
        3.3.4 利用功能性和基因组SSR分子标记对花生栽培种质资源进行遗传多样性分析
        3.3.5 花生SSR标记在花生QTL定位方面的应用
4 总结
5 参考文献
6 攻读学位期间发表的学术论著
7 致谢



本文编号：3758041