罗布麻全基因组测序及基因家族进化分析

发布时间：2023-04-08 03:24

　　罗布麻(Apocynum venetum),又名红麻,夹竹桃科(Apocynaceae)多年生宿根草本植物,是我国宝贵的野生植物资源,作为抗逆性极强的生态经济型植物,其茎杆可制成纤维,叶片可以炒茶,也是蜜源植物。罗布麻的根、茎、叶和花均可入药,主治高血压和高血脂等病症,1977年被《中华人民共和国药典》录入。植物全基因组测序是分析解决基因组成、成分分析、代谢通路等关于其本身的最基本的信息短缺问题,为物种之间的亲缘关系、分化时间和种间进化关系等信息作出科学的分析和支持。而罗布麻关于基因测序方面的相关研究甚少,NCBI数据库中罗布麻Genomes仅有89条序列(截止2020年6月14日),极少数的罗布麻基因组序列,使得其基因组学的研究滞后,罗布麻的全基因组破解亟需开展。本文利用Pacbio Sequel测序平台、通过10X Gemonics测序技术、Hi-C辅助组装等方法,对罗布麻进行全基因组测序、组装以及分析,获得如下结果:1.罗布麻基因组大小初步预估为254.40Mbp,是复杂基因组。全基因组Survey调查调查结果表明,罗布麻基因组大小初步预估为254.40Mbp,其杂合率和重复率分...

【文章页数】：65 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
第一章 绪论
    1.1 研究背景
    1.2 全基因组测序概述
    1.3 植物全基因组测序研究动态
    1.4 罗布麻分子生物学研究进展
    1.5 本研究目的及意义
    1.6 本研究技术路线图
第二章 罗布麻基因组特征调查
    2.1 材料与方法
    2.2 结果和分析
    2.3 讨论
    2.4 小结
第三章 罗布麻全基因组测序及组装
    3.1 材料与方法
    3.2 结果与分析
    3.3 讨论
    3.4 小结
第四章 罗布麻基因家族进化分析
    4.1 材料和方法
    4.2 结果和分析
    4.3 讨论
    4.4 小结
第五章 结论与展望
    5.1 结论
    5.2 展望
参考文献
致谢
个人简介及论文发表情况



本文编号：3785905