玉米秸秆消化率全基因组关联分析

发布时间：2023-04-16 18:06

　　48h体外干物质消化率(48h in vitro dry matter digestibility, 48h IVDMD)是衡量青贮玉米品质的重要指标。为了初步探究玉米秸秆消化率的分子遗传机理,以341份玉米自交系为材料,于2018年在沈阳和通辽种植,收获后测定秸秆48h IVDMD。利用全基因组重测序获得的6 276 612个高质量SNPs进行全基因组关联分析,共检测到153个与玉米秸秆消化率显著相关的SNPs位点(P<1.0×10-6),4个SNPs显著水平在P<1.0×10-8以上;共找到38个秸秆消化率的候选基因,主要涉及细胞生长发育、防御反应和信号转导等生物学功能。

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【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 供试材料及田间设计
    1.2 品质测定方法
    1.3 表型统计方法
    1.4 基因型测定及分析
    1.5 群体结构和亲缘关系
    1.6 秸秆48h IVDMD全基因组关联分析
    1.7 秸秆48h IVDMD定位结果比较分析
    1.8 秸秆48h IVDMD候选基因预测
    1.9 群体变异位点分析
2 结果与分析
    2.1 秸秆48h IVDMD表型分析
    2.2 秸秆48h IVDMD全基因组关联分析
    2.3 候选基因分析
3 讨论
    3.1 GWAS定位结果分析
    3.2 有潜力的候选基因分析
4 结论



本文编号：3791592