精细定位水稻深根比数量性状位点qRDR-5

发布时间：2023-04-22 08:11

　　水稻(Oryza sativa L.)是最重要的粮食作物之一,全球半数以上的人口以水稻为主食。水资源是水稻生产的核心要素,水稻生产消耗的水资源占农业用水的70%,缺水将严重制约水稻生产。全球变暖持续加剧,干旱程度日益加重,干旱已经成为水稻生产的主要限制因素之一,因此培育和推广节水抗旱稻(water-saving and drought-resistance rice,WDR)具有重大意义。深根比是避旱性的重要内容,定位并克隆水稻深根比基因有助于水稻抗旱分子机制解析和节水抗旱稻育种。本实验室利用水陆稻品种杂交,构建了两个F₂群体(BSA10和BSA9),通过QTL-seq方法在两个群体的5号染色体上(26384379-29957422,3.57 Mb)均定位到一个深根比QTL,且物理位置重合,命名为q RDR-5。本研究将进一步对其进行精细定位,主要结果如下:1. 本实验在目标区间内共预测了277个呈均匀分布的分子标记,通过多态性筛选,获得37对多态性良好的标记用于精细定位。2. 对BSA10和BSA9群体分别进行了两次和一次重组交换单株筛选:2018年利用标记RM...

【文章页数】：103 页

【学位级别】：硕士

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摘要
Abstract
缩写名词表
1 前言
    1.1 节水抗旱稻的研究意义
    1.2 水稻抗旱性研究进展
        1.2.1 水稻适应干旱的机制
        1.2.2 水稻抗旱性鉴定的方法
        1.2.3 水稻抗旱性的评价指标
    1.3 水稻根系研究进展
        1.3.1 水稻根系研究意义
        1.3.2 水稻根系研究方法
        1.3.3 水稻深根比研究进展
    1.4 QTL定位
        1.4.1 分子标记类型
        1.4.2 传统的QTL定位
        1.4.3 关联分析
        1.4.4 QTL-seq
    1.5 本研究目的和意义
2 材料与方法
    2.1 供试材料
    2.2 多态性分子标记的开发
    2.3 重组交换单株的筛选
    2.4 DNA提取及PCR扩增
    2.5 聚丙烯酰氨凝胶电泳检测In Del和 SSR标记
    2.6 高分辨率溶解曲线检测SNP标记
    2.7 深根比的检测
    2.8 数据分析
    2.9 水稻组织取样
    2.10 RNA提取和反转录
    2.11 Real-time PCR
3 结果与分析
    3.1 多态性分子标记的筛选
    3.2 重组交换单株筛选
    3.3 qRDR-5的精细定位
    3.4 候选基因分析
4 讨论
    4.1 候选基因功能预测
    4.2 精细定位数量性状位点
    4.3 根系表型鉴定方法
    4.4 分子标记辅助育种
参考文献
附录
    附录 Ⅰ.重组交换单株列表
    附录 Ⅱ.试剂配方
    附录 Ⅲ.营养液配方
致谢



本文编号：3797261