四倍体马铃薯高密度分子遗传连锁图谱构建及淀粉含量等重要性状的QTL定位
发布时间:2023-04-30 00:48
马铃薯是重要粮食作物之一。随着国家马铃薯主粮化战略的实施,市场对淀粉、全粉、薯片、薯条加工专用型马铃薯品种的需求量不断增加。为了培育高淀粉、高干物质加工型马铃薯新品种,构建马铃薯高密度分子遗传连锁图谱以及定位重要品质和产量性状的QTL,本试验以四倍体马铃薯“YSP-4”和“MIN-021”为亲本进行杂交,获得了马铃薯杂种F1代182个分离单株,并提取其基因组DNA。采用SRAP和SNP两种分子标记,构建其双亲的高密度遗传连锁图谱,并测定两年两点4个不同环境条件下的杂种F1代分离群体的块茎淀粉含量、干物质含量、单株产量和商品薯率4个重要性状,以定位其相应性状的稳定主效QTL。该研究可为深入开展马铃薯品质及产量等重要性状QTL精细定位,相关基因图位克隆、功能分析及分子标记辅助育种等研究奠定基础。主要研究结果如下:1.试验筛选出适宜SRAP引物组合36对,对马铃薯杂种F1代182个分离单株及其亲本的基因组DNA进行扩增,得到742个SRAP条带位点,其中多态性位点598个,多态性比率为80.59%。2.利用SLAF-seq高通量基因组测序技术,检测得到稳定的用于遗传作图的SNP标记3,001...
【文章页数】:101 页
【学位级别】:博士
【文章目录】:
摘要
Abstract
缩略语表
1 前言
1.1 马铃薯概述
1.1.1 马铃薯加工
1.1.2 马铃薯块茎营养
1.2 马铃薯遗传育种
1.2.1 马铃薯育种方法
1.2.2 马铃薯育种中存在的问题
1.3 分子遗传图谱构建
1.3.1 作图群体亲本
1.3.2 作图群体类型
1.3.3 作图群体大小
1.3.4 遗传标记类型
1.3.5 马铃薯遗传连锁图谱的研究进展
1.4 QTL定位
1.4.1 QTL定位分析方法
1.4.2 马铃薯重要QTL定位研究进展
1.5 研究的目的意义及主要研究内容
1.5.1 研究的目的及意义
1.5.2 研究内容
1.5.3 技术路线
2 四倍体马铃薯分子遗传图谱构建及分析
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 试验地概况
2.1.3 四倍体马铃薯群体构建过程及栽培方式
2.2 试验方法
2.2.1 DNA提取与质量检测
2.2.2 SRAP分子标记筛选及分析
2.2.3 SNP标记开发
2.2.4 四倍体马铃薯分子遗传连锁图谱的构建
2.3 结果分析
2.3.1 四倍体马铃薯基因组DNA质量检测
2.3.2 SRAP分子标记引物筛选及分子标记多态性分析
2.3.3 四倍体马铃薯F1代分离群体SNP标记开发和分析
2.3.4 分子标记分型
2.3.5 分子标记的偏分离分析
2.4 四倍体马铃薯双亲遗传图谱的构建及其重要特征
2.4.1 马铃薯高密度遗传图谱构建
2.4.2 母本“YSP-4”的遗传图谱特征
2.4.3 父本“MIN-021”的遗传图谱特征
2.5 讨论
2.5.1 遗传标记的偏分离现象
2.5.2 SLAF测序与SNP标记开发
2.5.3 马铃薯遗传图谱的构建及应用
2.6 小结
3 四倍体马铃薯重要性状的QTL定位分析
3.1 材料与方法
3.1.1 供试材料
3.1.2 试验方法
3.2 结果分析
3.2.1 四倍体马铃薯F1群体重要性状相关性分析
3.2.2 四倍体马铃薯F1群体重要性状正态分布检测
3.2.3 四倍体马铃薯重要QTL定位分析
3.3 讨论
3.3.1 环境和作图群体对QTL定位的影响
3.3.2 作图群体大小和分子标记对QTL定位的影响
3.3.3 QTL富集现象
3.4 小结
4 结论与主要创新点
4.1 结论
4.2 主要创新点
致谢
参考文献
附图
作者简介
本文编号:3806076
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【学位级别】:博士
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摘要
Abstract
缩略语表
1 前言
1.1 马铃薯概述
1.1.1 马铃薯加工
1.1.2 马铃薯块茎营养
1.2 马铃薯遗传育种
1.2.1 马铃薯育种方法
1.2.2 马铃薯育种中存在的问题
1.3 分子遗传图谱构建
1.3.1 作图群体亲本
1.3.2 作图群体类型
1.3.3 作图群体大小
1.3.4 遗传标记类型
1.3.5 马铃薯遗传连锁图谱的研究进展
1.4 QTL定位
1.4.1 QTL定位分析方法
1.4.2 马铃薯重要QTL定位研究进展
1.5 研究的目的意义及主要研究内容
1.5.1 研究的目的及意义
1.5.2 研究内容
1.5.3 技术路线
2 四倍体马铃薯分子遗传图谱构建及分析
2.1 材料与方法
2.1.1 试验材料
2.1.2 试验地概况
2.1.3 四倍体马铃薯群体构建过程及栽培方式
2.2 试验方法
2.2.1 DNA提取与质量检测
2.2.2 SRAP分子标记筛选及分析
2.2.3 SNP标记开发
2.2.4 四倍体马铃薯分子遗传连锁图谱的构建
2.3 结果分析
2.3.1 四倍体马铃薯基因组DNA质量检测
2.3.2 SRAP分子标记引物筛选及分子标记多态性分析
2.3.3 四倍体马铃薯F1代分离群体SNP标记开发和分析
2.3.4 分子标记分型
2.3.5 分子标记的偏分离分析
2.4 四倍体马铃薯双亲遗传图谱的构建及其重要特征
2.4.1 马铃薯高密度遗传图谱构建
2.4.2 母本“YSP-4”的遗传图谱特征
2.4.3 父本“MIN-021”的遗传图谱特征
2.5 讨论
2.5.1 遗传标记的偏分离现象
2.5.2 SLAF测序与SNP标记开发
2.5.3 马铃薯遗传图谱的构建及应用
2.6 小结
3 四倍体马铃薯重要性状的QTL定位分析
3.1 材料与方法
3.1.1 供试材料
3.1.2 试验方法
3.2 结果分析
3.2.1 四倍体马铃薯F1群体重要性状相关性分析
3.2.2 四倍体马铃薯F1群体重要性状正态分布检测
3.2.3 四倍体马铃薯重要QTL定位分析
3.3 讨论
3.3.1 环境和作图群体对QTL定位的影响
3.3.2 作图群体大小和分子标记对QTL定位的影响
3.3.3 QTL富集现象
3.4 小结
4 结论与主要创新点
4.1 结论
4.2 主要创新点
致谢
参考文献
附图
作者简介
本文编号:3806076
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