野生大豆脂肪酸代谢途径相关基因的核苷酸变异与群体遗传的区域差异研究
发布时间：2023-05-05 19:14
野生大豆(Glycine soja)是栽培大豆(Glycinemax)的祖先种。广泛地分布于东亚,包括日本、韩国、俄罗斯远东地区和中国,而中国是野生大豆的分布与多样性中心。野生大豆未经驯化和人工选择,是大豆育种过程中重要的遗传资源。了解野生大豆的遗传多样性和群体遗传结构对野生大豆种质资源的保护和利用意义十分重大。大豆油是人类营养所需脂肪酸的重要来源,脂肪酸代谢途径决定大豆油脂肪酸的组成关乎大豆油的品质和产量的提高。然而,对脂肪酸代谢途径的遗传变异的研究甚少。了解野生大豆脂肪酸代谢途径的核苷酸变异将为有效地保护利用野生大豆种质资源,为提高大豆油产量和品质提供重要的理论依据。本研究中,我们利用119个野生大豆样品,包括59个个体样品和60个来自于四个天然居群的样品作为实验材料,4个脂肪酸代谢途径相关基因片段(ACCase-A,accB-1,GPAT,KASI)作为分子标记,对野生大豆的脂肪酸代谢途径相关基因的核苷酸变异以及其群体遗传结构进行了深入研究。测序并对序列比对后得到的有效片段长度从599到831 bp不等,总长度为2958 bp。在野生大豆的59个个体样品中总共检测到50个多态性位...
【文章页数】：106 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
1.1 野生大豆种质资源概述
1.1.1 野生大豆的分类学地位
1.1.2 野生大豆种质资源的形态特征
1.1.3 野生大豆种质资源分布
1.1.4 野生大豆种质资源的研究意义
1.2 野生大豆种质资源的群体遗传学研究进展
1.2.1 SSR标记在野生大豆群体遗传学研究中的应用
1.2.2 利用RAPD技术研究野生大豆的群体遗传学
1.2.3 同工酶分子标记在野生大豆群体遗传学方面的研究进展
1.2.4 SNP标记与野生大豆群体遗传学研究
1.3 大豆脂肪酸代谢途径及其相关基因
1.3.1 大豆脂肪酸代谢途径
1.3.2 大豆脂肪酸代谢途径相关基因
1.4 本课题研究的内容和意义
第二章 中国野生大豆脂肪酸代谢途径相关基因的核苷酸变异
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 研究材料
2.2.2 野生大豆基因组DNA的提取与纯化
2.2.3 DNA质量的测定
2.2.4 脂肪酸代谢途径相关基因的筛选及引物设计
2.2.5 PCR扩增
2.2.6 数据分析
2.3 结果与讨论
2.3.1 ACCase-A基因片段的核苷酸变异
2.3.2 accB-1基因片段的核苷酸变异
2.3.3 KASI基因片段的核苷酸变异
2.3.4 GPAT基因片段的核苷酸变异
2.3.5 四个脂肪酸代谢途径相关基因片段的核苷酸变异
2.4 本章小结
第三章 中国野生大豆的群体遗传结构研究
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 研究材料
3.2.2 数据收集
3.2.3 数据分析方法
3.3 结果与讨论
3.3.1 群体遗传结构分析
3.3.2 三个生态地理聚类的遗传多样性与遗传分化
3.4 本章小结
第四章 中国三个生态地理区域野生大豆天然居群的遗传多样性与遗传分化
4.1 引言
4.2 材料与方法
4.2.1 研究材料
4.2.2 数据收集
4.2.3 数据分析方法
4.3 结果与讨论
4.3.1 基于KASI基因片段的居群遗传多样性与遗传分化分析
4.3.2 基于accB-1基因片段的居群遗传多样性与遗传分化分析
4.3.3 基于两个基因片段的居群遗传多样性与遗传分化分析
4.4 本章小结
第五章 野生大豆与半野生大豆的叶绿体基因组研究
5.1 引言
5.2 研究方法
5.2.1 基因组测序数据的选择
5.2.2 基因组测序数据的预处理与叶绿体基因组reads的提取
5.2.3 叶绿体基因组的拼接和注释
5.3 结果与讨论
5.3.1 野生大豆叶绿体基因组基本结构
5.3.2 半野生大豆叶绿体基因组基本结构
5.3.3 大豆属叶绿体基因组比较分析
5.3.4 基于叶绿体基因组的大豆属系统发育分析
5.4 本章小结
第六章 总结与展望
致谢
参考文献
攻读学位期间发表论文目录
本文编号：3808244
【文章页数】：106 页
【学位级别】：博士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
1.1 野生大豆种质资源概述
1.1.1 野生大豆的分类学地位
1.1.2 野生大豆种质资源的形态特征
1.1.3 野生大豆种质资源分布
1.1.4 野生大豆种质资源的研究意义
1.2 野生大豆种质资源的群体遗传学研究进展
1.2.1 SSR标记在野生大豆群体遗传学研究中的应用
1.2.2 利用RAPD技术研究野生大豆的群体遗传学
1.2.3 同工酶分子标记在野生大豆群体遗传学方面的研究进展
1.2.4 SNP标记与野生大豆群体遗传学研究
1.3 大豆脂肪酸代谢途径及其相关基因
1.3.1 大豆脂肪酸代谢途径
1.3.2 大豆脂肪酸代谢途径相关基因
1.4 本课题研究的内容和意义
第二章 中国野生大豆脂肪酸代谢途径相关基因的核苷酸变异
2.1 引言
2.2 材料与方法
2.2.1 研究材料
2.2.2 野生大豆基因组DNA的提取与纯化
2.2.3 DNA质量的测定
2.2.4 脂肪酸代谢途径相关基因的筛选及引物设计
2.2.5 PCR扩增
2.2.6 数据分析
2.3 结果与讨论
2.3.1 ACCase-A基因片段的核苷酸变异
2.3.2 accB-1基因片段的核苷酸变异
2.3.3 KASI基因片段的核苷酸变异
2.3.4 GPAT基因片段的核苷酸变异
2.3.5 四个脂肪酸代谢途径相关基因片段的核苷酸变异
2.4 本章小结
第三章 中国野生大豆的群体遗传结构研究
3.1 引言
3.2 材料与方法
3.2.1 研究材料
3.2.2 数据收集
3.2.3 数据分析方法
3.3 结果与讨论
3.3.1 群体遗传结构分析
3.3.2 三个生态地理聚类的遗传多样性与遗传分化
3.4 本章小结
第四章 中国三个生态地理区域野生大豆天然居群的遗传多样性与遗传分化
4.1 引言
4.2 材料与方法
4.2.1 研究材料
4.2.2 数据收集
4.2.3 数据分析方法
4.3 结果与讨论
4.3.1 基于KASI基因片段的居群遗传多样性与遗传分化分析
4.3.2 基于accB-1基因片段的居群遗传多样性与遗传分化分析
4.3.3 基于两个基因片段的居群遗传多样性与遗传分化分析
4.4 本章小结
第五章 野生大豆与半野生大豆的叶绿体基因组研究
5.1 引言
5.2 研究方法
5.2.1 基因组测序数据的选择
5.2.2 基因组测序数据的预处理与叶绿体基因组reads的提取
5.2.3 叶绿体基因组的拼接和注释
5.3 结果与讨论
5.3.1 野生大豆叶绿体基因组基本结构
5.3.2 半野生大豆叶绿体基因组基本结构
5.3.3 大豆属叶绿体基因组比较分析
5.3.4 基于叶绿体基因组的大豆属系统发育分析
5.4 本章小结
第六章 总结与展望
致谢
参考文献
攻读学位期间发表论文目录
本文编号：3808244
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/nzwlw/3808244.html
最近更新
教材专著
