绿豆高密度遗传图谱构建及重要农艺性状QTL定位

发布时间：2023-05-23 20:23

　　绿豆是豇豆属中的主要栽培种作物,也是我国重要的食用豆类。作为小宗作物,绿豆研究基础薄弱,遗传图谱数量少、密度低,难以有效用于新基因发掘等深入研究。本课题基于大花叶和冀绿9号变异株杂交衍生的RIL(Recombinant inbred line)群体,利用基因组重测序技术,构建了绿豆SNP高密度遗传连锁图谱,并开展了主要表型性状的QTL分析,主要研究结果如下:(1)绿豆高密度遗传图谱构建亲本间共检测到564449个SNP,将筛选后的SNP划分为Bin标记,构建了包含1946个Bin标记(包含21508个SNP)的高密度遗传连锁图谱,该图谱总长为1060.17 cM,分为11个连锁群(LG),平均图距为0.54 cM。连锁群的长度依次是LG 9(168.03 cM)>LG 6(127.99 cM)>LG 1(114.27 cM)>LG 5(113.37 cM)>LG 8(112.09 cM)>LG 7(95.76 cM)>LG 10(87.85cM)>LG 11(85.60 cM)>LG 2(71.90 cM)>LG 3(44.55 c...

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【学位级别】：硕士

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摘要
abstract
主要符号对照表
第一章 绪论
    1.1 绿豆种植地位及研究意义
    1.2 遗传连锁图谱构建原理及步骤
        1.2.1 遗传连锁图谱构建原理
        1.2.2 遗传标记种类
        1.2.3 遗传连锁图谱构建主要内容
    1.3 绿豆遗传图谱研究现状
        1.3.1 绿豆DNA分子标记的开发
        1.3.2 绿豆遗传图谱的研究进展
    1.4 QTL定位的原理及方法
    1.5 绿豆农艺性状遗传研究进展
    1.6 选题目的意义和研究内容
        1.6.1 选题目的与意义
        1.6.2 主要研究内容
第二章 材料与方法
    2.1 实验材料
    2.2 方法
        2.2.1 DNA文库构建
        2.2.2 绿豆基因组重测序及数据处理
        2.2.3 亲本之间SNP检测
        2.2.4 .高密度遗传图谱的构建
        2.2.5 遗传作图操作方法
        2.2.6 农艺性状的考察
        2.2.7 QTL定位方法与步骤
        2.2.8 候选基因筛选及SNP变异分析
第三章 结果与分析
    3.1 高密度遗传图谱构建
        3.1.1 测序深度及基因组覆盖度分析
        3.1.2 分子标记的开发及筛选
        3.1.3 遗传连锁图谱特征分析
    3.2 共线性分析
    3.3 农艺性状表型分布及遗传分析
        3.3.1 农艺性状分布
        3.3.2 叶形态表型分析
    3.4 农艺性状QTL定位
        3.4.1 QTL位点分布情况
        3.4.2 叶形态QTL定位与候选基因SNP变异分析
        3.4.3 株型相关性状QTL定位
        3.4.4 豆荚形态相关QTL定位
        3.4.5 与籽粒性状相关的QTL定位
        3.4.6 初花期相关QTL定位
        3.4.7 叶片叶绿素含量QTL定位
        3.4.8 幼茎色QTL定位
第四章 讨论
    4.1 Bin标记应用于遗传作图的优势
    4.2 高密度遗传图谱构建
    4.3 农艺性状定位
    4.4 叶缘的遗传机理
第五章 结论
    5.1 绿豆群体基因组重测序及 SNP 标记开发
    5.2 作图群体的选择
    5.3 高密度遗传图谱构建
    5.4 农艺性状表型分析
        5.4.1 叶形态分析
        5.4.2 农艺性状分布情况
    5.5 农艺性状QTL定位
    5.6 叶缘表型候选基因发掘及SNP变异分析
参考文献
附录A
致谢
作者简历



本文编号：3822301