不同地区穇子ITS序列比较及穇属物种聚类分析
发布时间:2023-06-16 20:58
穇子作为药食兼用的特色作物,对粮食安全和改善人们健康起着重要作用。为探究快速鉴定穇属物种的方法及确定穇子的亲缘关系,本研究对65个不同产地穇子居群的核糖体DNA内转录间隔区(ITS)序列进行测序及比对,并构建穇属物种系统发育树。结果发现,穇子EC25、EC53和EC59等3个居群的ITS序列存在单碱基的突变体,其他居群无任何差异;穇属物种间ITS存在3~43个碱基的差异;系统聚类表明,穇属物种分为2大类4个亚组,其中穇子与凯芝济穇亲缘关系最近。研究表明,穇子的ITS序列具有高保守性而穇属种间差异性较大,ITS序列不能作为穇子居群的鉴定标记,可作为穇属物种鉴定的参考序列。本研究为穇子的亲缘关系鉴定及杂交育种提供了分子依据。
【文章页数】:11 页
【文章目录】:
1结果与分析
1.1不同穇子居群ITS扩增效率检测
1.2 ITS序列分析
1.3 穇属系统发育树分析
2讨论
3材料与方法
3.1 实验材料
3.2 DNA提取及ITS序列扩增
3.3 扩增产物测序
3.4 序列分析及系统发育树构建
本文编号:3833973
【文章页数】:11 页
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1结果与分析
1.1不同穇子居群ITS扩增效率检测
1.2 ITS序列分析
1.3 穇属系统发育树分析
2讨论
3材料与方法
3.1 实验材料
3.2 DNA提取及ITS序列扩增
3.3 扩增产物测序
3.4 序列分析及系统发育树构建
本文编号:3833973
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