基于matK+rbcL条形码与RAPD分子标记方法的青海唐古特大黄遗传多样性研究

发布时间：2023-11-02 19:22

　　唐古特大黄,蓼科大黄属多年生高大草本植物,野生资源主要分布于平均海拔3000-4000 m以上的果洛地区。近年来因市场需求量过大,野生资源过度采挖,生境破碎化趋于严重,唐古特大黄野生资源已处于易危等级。本研究利用matK+rbc L条形码和RAPD分子标记分析了唐古特大黄遗传多样性和遗传结构等特征,得到以下结论:1.基于高通量测序技术构建唐古特大黄叶绿体全基因组图谱,唐古特大黄叶绿体全基因组长为161 054 bp,包括长为86 441 bp的大单拷贝区(LSC),长为12745 bp的小单拷贝区(SSC)和长均为30 934 bp的反向重复序列A(IRA)和反向重复序列B(IRB)。唐古特大黄叶绿体全基因组共包含164个基因,分为111个蛋白编码基因,45个转运RNA基因,8个核糖体RNA基因三类。2.从唐古特大黄叶绿体全基因组中挑选matK+rbcL联合条形码对唐古特大黄36个种群180个个体进行分析,得到1 634 bp片段长度,共产生10种单倍型,民和峡门3种群(MH XM3)单倍型多样性最高,大通桦林镇(DT HLZ)、互助五峰(HZ WF)等25个种群倍型多样性最低。AMO...

【文章页数】：72 页

【学位级别】：硕士

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中文摘要
Abstract
第一章 文献综述
    1.1 遗传多样性
        1.1.1 遗传多样性的概念
        1.1.2 遗传多样性的检测方法
        1.1.3 遗传多样性的研究意义
    1.2 唐古特大黄研究进展
        1.2.1 唐古特大黄简介
        1.2.2 唐古特大黄化学成分研究
        1.2.3 唐古特大黄药理作用研究
        1.2.4 唐古特大黄分子生物学研究
    1.3 研究目的及意义
    1.4 研究方案及技术路线
第二章 唐古特大黄叶绿体全基因组
    2.1 材料与方法
        2.1.1 材料
        2.1.2 DNA提取
        2.1.3 测序和序列拼接
        2.1.4 基因组序列注释
    2.2 结果
        2.2.1 总DNA提取
        2.2.2 唐古特大黄叶绿体基因大小
        2.2.3 唐古特大黄叶绿体基因注释、基因功能及分类
    2.3 讨论
第三章 基于matK+rbcL条形码对唐古特大黄遗传多样性的研究
    3.1 材料与方法
        3.1.1 样品采集与处理
        3.1.2 器材
        3.1.3 试剂与溶液配制
        3.1.4 DNA提取
        3.1.5 PCR扩增
        3.1.6 总DNA、PCR扩增产物检测及测序
        3.1.7 数据分析
    3.2 结果与分析
        3.2.1 总DNA提取
        3.2.2 PCR扩增
        3.2.3 序列特征及单倍型分布
        3.2.4 遗传多样性和遗传结构
        3.2.5 系统发育分析
        3.2.6 单倍型进化关系
        3.2.7 唐古特大黄进化动态
    3.3 讨论
        3.3.1 唐古特大黄DNA提取
        3.3.2 唐古特大黄PCR扩增
        3.3.3 唐古特大黄单倍型特征分析
        3.3.4 唐古特大黄的遗传多样性及遗传结构
        3.3.5 唐古特大黄的系统发育和进化
第四章 基于RAPD对唐古特大黄遗传多样性的研究
    4.1 材料与方法
        4.1.1 样品采集与处理
        4.1.2 试剂与器材
        4.1.3 DNA提取
        4.1.4 PCR扩增
        4.1.5 数据分析
    4.2 结果与分析
        4.2.1 总DNA提取
        4.2.2 PCR扩增
        4.2.3 扩增产物多态性
        4.2.4 遗传多样性分析
        4.2.5 遗传结构与分化
        4.2.6 聚类分析
    4.3 讨论
        4.3.1 RAPD法DNA扩增
        4.3.2 遗传多样性分析和遗传结构
        4.3.3 系统发育与进化
第五章 总结与展望
    5.1 主要结论
    5.2 保护唐古特大黄物种的启示
    5.3 展望
参考文献
致谢
个人简历
硕士期间主要研究成果



本文编号：3859607