玉米吐丝期叶绿素指数全基因组关联分析

发布时间：2024-02-27 00:28

　　叶绿素是植物形成产量的重要因子。为了探究吐丝期叶绿素的遗传机理和代谢机制,本研究以榆林、杨凌两地126份玉米自交系为材料,采用全基因组关联分析的方法将简化基因组测序填充过滤筛选后得到31 561个SNP (Single nucleotide polymorphism)标记,结合叶绿素指数SPAD (Soil and plant analyzer develotrnent)值以及BLUP (Best linear unbiased prediction)值进行分析,共检测到37个显著性关联SNP标记;在LD (Linkage disequilibrium)衰退有效距离上下150 kb内检测到201个候选基因,进一步进行GO富集注释和分析,将叶绿素相关候选基因主要锚定在过氧化氢代谢过程、受体活性、活性氧代谢过程和氮化合物代谢过程的负调控等18个代谢途径上。本研究进一步探究了叶绿素相关代谢遗传机理,对高光效育种和提高作物产量有重要意义。

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【部分图文】：

图1AM126SPAD值频率分布

为了更好地分析叶绿素指数的代谢基础，对37个关联位点置信区间的候选基因进行基因搜索，共得到201个候选基因(表5)。用AgriGOV2.0对所在的201个候选基因进行功能注释，按照p≤0.05标准，筛选出18个富集程度较好的生物途径，包括5个分子功能：分子换能器活性、受体活性....

图2AM126叶绿素指数全基因组关联分析曼哈顿和分位数-分位数图(QQ图)

前人利用经典遗传分析法定位了自然条件下不同生育期叶绿素QTL(王爱玉和张春庆,2008;譒imicetal.,2014)、不同处理下叶绿素QTL(Hundetal.,2004;Caietal.,2012)和不同处理下不同部位叶片QTL(Chanetal.,2....

本文编号：3912093