基于高密度遗传图谱定位新的水稻抽穗期QTLs

发布时间：2024-05-20 22:03

　　【目的】挖掘新的控制水稻抽穗期的QTLs,为水稻花期调控的遗传机理研究和分子育种提供新的基因资源。【方法】以籼稻品种特籼占空间诱变突变体CHA-1和籼稻航恢7号空间诱变突变体H335为亲本进行杂交,构建包含275个株系的重组自交系(RIL)作图群体,利用由两亲本重测序及RIL群体简化基因组测序所构建的高密度遗传图谱,在2个环境下进行水稻抽穗期QTL定位。【结果】经两亲本重测序及RIL群体简化基因组测序,构建了包含2 498个Bin标记的高密度遗传图谱。该图谱覆盖水稻12条染色体,各染色体标记数平均208.17,标记间平均遗传距离为0.95 cM。在2个环境下共定位到4个影响抽穗期的QTLs,分布于第3、第6和第8号染色体,其中qHD-6和qHD-8-1位于前人已报道定位的区域并被克隆,另外2个QTLs(qHD-3和qHD-8-2)尚未见报道,并且qHD-8-2能在2个环境中被重复检测到,贡献率分别为8.30%和10.89%。【结论】通过构建的高密度遗传图谱在2个环境中共检测到4个影响抽穗期的QTLs,其中qHD-3和qHD-8-2是新的抽穗期QTL位点,可用于后续抽穗期调控基因的精细定...

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【部分图文】：

图1籼稻RIL及亲本CHA-1、H335抽穗期表型分布

本研究利用GBS方法对CHA-1/H335的275个株系进行测序,根据子代重组情况进行Bin划分,筛除偏分离标记后构建了一张包含2498个分子标记、全长为2371.84cM(表2)、覆盖水稻全基因组12条染色体(Ch1～Ch12)的连锁图谱(图2)。每条染色体标记数为138....

图2籼稻遗传标记在染色体上的分布及QTL位置

表2籼稻CHA-1/H335的RIL群体连锁图谱的基本信息Table2InformationofmolecularontheRILlinkagemapderivedfromindicaCHA-1/H335连锁群Linkagegroup上图标记数T....

本文编号：3979184