寒地冬小麦膨胀素基因TaEXPB12同源基因的克隆及功能分析

发布时间：2024-05-22 04:33

　　为了进一步研究冬小麦的根系建成,并为今后高寒地区的冬小麦育种奠定基础。以东农冬麦2号为材料,利用PCR技术得到TaEXPB12-A/B/D 3个同源基因的CDS全长。其核酸序列长度均为846 bp,编码281个氨基酸,同源性达到98.46%,分别定位在2AL、2BL、2DL染色体上,蛋白均具备膨胀素基因序列特有的结构域DPBB₁,分别位于142-810 bp,142-834 bp,142-834 bp。启动子分析结果显示,这3段序列中均含有多个与根特异表达相关的作用元件,以及多个激素响应元件和非生物胁迫响应元件。qRT-PCR分析发现TaEXPB12-A/B/D基因在根中特异性表达,低温会抑制TaEXPB12-A/B/D 3个同源基因的表达,而干旱、脱落酸、茉莉酸甲酯及水杨酸等处理会促进它们的表达。洋葱表皮亚细胞定位结果显示,3个基因均定位于细胞壁。TaEXPB12-A/B/D蛋白质在冬小麦根的细胞壁中特异性分布,并参与冬小麦抵御外界多种非生物胁迫的过程,在3个基因响应外界胁迫的过程中,TaEXPB12-A占据表达优势。结果说明,TaEXPB12-A/B/D在冬小...

【文章页数】：7 页

【部分图文】：

图1TaEXPB12基因的菌落PCR扩增结果

目的基因扩增获得846bp左右的目的条带,与预期片段大小相似(图1)。胶回收,连接T3载体,转化大肠杆菌,并进行菌液PCR鉴定(图2)。测序结果与本研究室的转录组测序结果进行对比,成功得到TaEXPB12-A/B/D基因。基因序列提交NCBI注册,GenBank登录号分别为M....

图2TaEXPB12基因的菌液PCR鉴定结果

图1TaEXPB12基因的菌落PCR扩增结果2.2序列生物信息学分析

图3TaEXPB12-A/B/D的氨基酸同源比对

TaEXPB12-A/B/D蛋白质信号肽预测分析显示,该蛋白质的切割点位于氨基酸25-26位,TaEXPB12-A/B/D基因信号肽序列完全相同。除此之外,生物信息学分析结果显示,TaEXPB12-A/B/D蛋白均具备膨胀素基因序列特有的结构域DPBB_1,分别位于142-810....

图4TaEXPB12-A/B/D编码的蛋白质三级结构的预测

图3TaEXPB12-A/B/D的氨基酸同源比对2.3启动子反应元件预测分析

本文编号：3980403