玉米果穗不同部位种子的全基因组DNA甲基化研究

发布时间：2024-12-22 07:54

　　DNA甲基化作为表观遗传的主要修饰方式之一,参与细胞的许多生物学过程,在植物生长发育、基因组印记和对逆境胁迫的应答等方面发挥重要作用。本试验利用玉米甲基化免疫共沉淀(MeDIP-seq)技术对玉米杂交种郑单958吸胀0h和24h果穗上部、中部种子全基因组DNA甲基化进行了研究,利用McrBC-PCR对部分差异甲基化基因进行验证,将MeDIP-seq数据和RNA-seq数据结合,对部分差异甲基化基因的表达水平进行检测,从DNA甲基化角度研究影响玉米果穗不同部位种子萌发的调控机理。主要研究结果如下:1.通过MeDIP-seq技术对玉米果穗不同吸胀时间、不同部位种子的全基因组DNA甲基化进行分析,吸胀0h种子的差异甲基化基因数量远多于吸胀24h种子;吸胀0h中部与上部种子相比,甲基化上调基因的数量多于下调基因的数量,而吸胀24h中部与上部的种子比较,甲基化下调基因的数量多于上调基因的数量。2.MeDIP-seq结果分析发现启动子区的甲基化修饰要多于基因区,基因区内含子的甲基化修饰多于外显子。通过对吸胀0h和24h中部和上部种子的差异甲基化基因进行分析,在吸胀0h种子中共检测到7264个差异甲基...

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【学位级别】：硕士

【部分图文】：

图2玉米果穗不同部位甲基化Peaks在染色体上的分布

图2玉米果穗不同部位甲基化Peaks在染色体上的分布Fig.2DistributionofmethylationPeaksindifferentchromosomesinmaize图3Peaks在基因不同区域上的分布统计Figure3Distr....

图4Peaks差异甲基化统计分析结果

图2玉米果穗不同部位甲基化Peaks在染色体上的分布Fig.2DistributionofmethylationPeaksindifferentchromosomesinmaize图3Peaks在基因不同区域上的分布统计Figure3Distr....

图7吸胀0h、24h种子差异基因的DNA甲基化水平验证D表示DNA经过McrBC酶切N表示DNA未经过McrBC酶切

图7吸胀0h、24h种子差异基因的DNA甲基化水平验证D表示DNA经过McrBC酶切N表示DNA未经过McrBC酶切Figure7Estimationofthemethylationleveloftheseedgerminat....

本文编号：4019688