不同倍性水稻基因组甲基化、基因表达和sRNA的研究

发布时间：2025-01-17 15:10

　　多倍体是指包含超过两套染色体组的细胞、组织或生物。多倍体在植物中很常见,据估计,目前的植物种类中有30-80%是多倍体,有证据显示,许多二倍体植物的基因组曾经历过一次或多次古多倍体的过程,被子植物多样性的大爆炸与许多植物同时发生的古基因组复制事件的时间正好吻合。此外,约有15%的被子植物和31%的蕨类植物物种形成事件伴随着倍性增加的过程。多倍体植物可以通过几种机制自发产生,包括减数分裂和有丝分裂失败,未减数配子融合等。由于多倍体植物具有组织器官增大、生物学产量增加、抗逆性增强等特点,因而广泛应用于作物育种领域。本研究所用材料SARII-628是一个能够自然发生多胚苗的稳定水稻品系,多胚苗包含单倍体、二倍体、三倍体和四倍体,以其中的单倍体、二倍体和三倍体为材料,通过分离其分蘖和合理的栽培管理形成三个倍性株系。用体细胞染色体计数确定倍性,并利用均匀分布于基因组上的6000个SNP标记检测发现,三个倍性材料遗传背景高度一致。进一步评估它们的多种农艺性状,结果表明三个倍性水稻在株高、颖花大小、剑叶长宽等性状方面有较大差异,这意味着基因组加倍引起了巨大的表型变化,由此我们希望了解表观基因组的变化对...

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【部分图文】：

图1.从深度测序文库正确鉴定和注释miRNA的大纲和步骤Fig.1AnoutlineofthecorrectprotocolforidentifyingandannotatingmiRNAsformdeepsequencinglibraries

15图1.从深度测序文库正确鉴定和注释miRNA的大纲和步骤Fig.1AnoutlineofthecorrectprotocolforidentifyingandannotatingmiRNAsformdeepsequencinglibrar....

图2PHB载体物理图谱

GGTGGTGGGTAGTCTCTCTCTTATGGTGAACCCGTGATCATGTTACAGATATGTTGGTGGTTGTTGCTTGCAGGCTGCTATGGAATGGTGGAAGAAGGGGATCGACGCCAATTGTTTGGCGACCTCTACGATAGAATCGT....

图41N和2N,2N和3N基因组SNP6K芯片检测

个单碱基位点有多态度性。1N与2N仅在第11染色体的29753255bp和1151760bp四个位点具有单核苷酸多态度性，属于纯第11染色体291791bp位于基因LOC_Os11g01490上的CDS区表达蛋白，功能是外膜蛋....

图5单倍体、二倍体和三倍体水稻MeDIP-seqreads在染色体上的分布

3.2倍性水稻全基因组甲基化方式具有高度相似性3.2.1单倍体、二倍体和三倍体水稻甲基化图谱高度相似为了回答当基因组复制发生后，甲基化方式是否会受影响的问题，我们利MeDIP-seq分析了单倍体、二倍体和三倍体水稻全基因组甲基化谱。三个样本MeDseq总计产生48.9....

本文编号：4028227