石斑鱼APC相关基因在刺激隐核虫感染后的表达分析
发布时间:2020-04-05 19:43
【摘要】:抗原递呈细胞(Antigen-presenting cell,APC)是一类可在其细胞表面表达主要组织相容性复合体(Major histocompatibility complexes,MHCs)并将加工后的抗原信息通过T细胞受体(T cell receptors,TCR)递呈给T细胞的细胞。专职抗原递呈细胞包括:树突状细胞、巨噬细胞和B细胞。这些细胞通过多种方式获得抗原后,可对抗原进行加工并与MHC II类分子结合后激活T细胞,启动适应性免疫反应。刺激隐核虫作为一种寄生性海水纤毛虫,对热带和亚热带海水鱼类危害极其严重。大量实验证明了刺激隐核虫的感染可引起海水鱼类的适应性免疫应答。为揭示抗原递呈细胞在刺激隐核虫感染过程中可能发挥的作用,本文基于刺激隐核虫感染斜带石斑鱼后的转录组数据库,克隆获得了7个APC相关基因(EcIL-34、EcMCSF2、EcMCSFR2、EcCCR6A、EcCCR6B、EcCD83和EcCD208)的ORF序列。其中巨噬细胞相关基因EcIL-34、EcMCSF2和EcMCSFR2等分子的ORF分别为657 bp、804 bp和3141 bp,分别编码218、267和1046个氨基酸,理论原子质量为25.50 kDa、31.02 kDa和117.72 kDa。树突状细胞相关基因EcCCR6A、EcCCR6B、EcCD83和EcCD208等分子的ORF分别为1134 bp、1089 bp、675 bp和771 bp分别编码377、362、224和256个氨基酸,理论原子质量为43.03 kDa、40.81 kDa、24.78 kDa和28.12kDa。序列的结构,同源性和进化树分析结果认为这7个基因均与在其他物种上报道的同源基因相似。组织分布结果显示APC相关基因虽然存在不同的表达模式,但主要在免疫组织中表达。EcIL-34主要在脑组织表达,紧接着在鳃、脾脏、皮肤和肌肉等部位均有表达,而在肝脏和胸腺则表达较少;EcMCSF2则在头肾和中肾表达量最高,在鳃和胸腺表达量较少;EcMCSFR2在脾脏,头肾和鳃中高表达,而在肌肉、胸腺和心脏中低表达。两个EcCCR6均在鳃上表达量最高,而在心脏、肝脏和肌肉中均没有检测到表达量;在脑中主要表达EcCCR6A而在头肾和中肾中则主要表达EcCCR6B,两者在其余组织中表达量相近。EcCD83在胸腺上表达量最高,在非淋巴组织表达较低;EcCD208在中肾表达量最高,紧接是在鳃、皮肤、脑和心脏表达,而在其余组织表达量很低。对APC相关基因在刺激隐核虫感染后的表达谱分析发现,所有6个表面分子(EcMCSFR1、EcMCSFR2、EcCCR6A、EcCCR6B、EcCD83和EcCD208)均在感染后的皮肤上显著上调,一方面可能是这6个表面分子在其阳性细胞上的表达量上调,另一方面可能是更多该分子的阳性细胞聚积到感染部位的皮肤上。而在感染后的其余部位,虽然各个分子间的表达存在差异,但总体上,在鳃和头肾上也是上调表达较多,而在脾脏上则是普遍下调表达,推测可能是抗原递呈细胞从系统免疫器官迁移到感染部位进行免疫反应的结果。综上所述,初步推测石斑鱼APC相关基因可能参与了抗刺激隐核虫免疫应答过程。
【图文】:
图 1 EcIL-34 氨基酸序列比对“·”表示该处氨基酸缺失,黑色阴影表示蛋白质序列保守部位;灰色阴影表示该位置发现信号肽或结构域序列; “%肌,
本文编号:2615449
【图文】:
图 1 EcIL-34 氨基酸序列比对“·”表示该处氨基酸缺失,黑色阴影表示蛋白质序列保守部位;灰色阴影表示该位置发现信号肽或结构域序列; “%肌,
本文编号:2615449
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/2615449.html