SVCV感染EPC细胞microRNA表达谱的初步研究

发布时间：2020-06-23 01:28

【摘要】：Micro RNA(微小RNA)是广泛存在于真核生物中的一类长约22 nt的内源性非编码单链RNA,在细胞凋亡、细胞增殖和分化及DNA修复等多种生理过程中都发挥着重要调节作用。大量研究表明,mi RNA还与病毒感染后引起细胞内一系列生理变化相关。鲤春病毒血症病毒(Spring Viremia of Carp Virus,SVCV)能引起鲤春病毒血症(Spring Viremia of Carp,SVC)爆发,给世界水产养殖业造成巨大的经济损失。目前,该病毒感染的致病机理还不清楚。为了研究mi RNA在SVCV感染过程中的作用,本研究采用高通量测序技术对SVCV感染前后EPC细胞中的小RNA文库进行测序。具体研究内容如下:1.构建了病毒感染组小RNA文库(E)和病毒未感染组小RNA文库(M),通过solexa测序技术和后续的生物信息学分析,对每一条小RNA序列进行分类注释,鉴定出161个保守性mi RNA和26个新的mi RNA。2.将M组和E组mi RNA表达水平进行了比较,发现SVCV感染导致10个mi RNA表达上调和4个mi RNA表达下调。3.为了验证高通量测序结果的准确性,通过q RT-PCR对部分mi RNA表达水平进行了验证。4.利用生物学软件对14个显著性差异表达mi RNA的靶基因进行了预测,还预测了可以直接靶向SVCV基因组的mi RNA。5.通过转染mi RNA抑制剂或模拟物,TCID50和q RT-PCR等实验对mi R-15a-5p与SVCV复制的关系进行了初步探讨。目前,尚无鱼类弹状病毒感染相关mi RNA表达谱研究的报道。本研究为从mi RNA角度深入探讨SVCV致病的分子机制奠定了基础。
【学位授予单位】：华中农业大学
【学位级别】：硕士
【学位授予年份】：2015
【分类号】：S941.41
【图文】：

病毒结构,病毒粒子

图 1-1 SVCV 病毒结构 (Ahne et al 2002)(A) 病毒粒子的结构，(B) 基因组的结构Fig 1-1 Spring vir emia of carp virus (Ahne et al 2002)(A) Virion structure, (B) Genomic organization

1.2.2 miRNA 的功能和作用方式图 1-2 miRNA 的产生 (Mack, 2007)Fig 1-2 miRNA biogenesis (Mack, 2007)

【参考文献】