牙鲆kiss2及其受体gpr54-2基因的分子鉴定及表达分析
【学位单位】:上海海洋大学
【学位级别】:硕士
【学位年份】:2015
【中图分类】:S917.4
【部分图文】:
子量为 13.7 KD。通过 BioEdit 软件分析,在其第五和第十五个氨基酸之间有一个典型的疏水性区域。图2-1 牙鲆kiss2基因序列及其推导的氨基酸序列_表示信号肽;*表示终止密码子;□表示加尾信号和Kisspeptin-10序列;◇表示蛋白水解切割位点Fig.2-1 Nucleotide and deduced amino acids sequences of P. olivaceus kiss2The putative signal peptide is underlined. The stop codon (TGA) is shown by asterisks (*). Thepolyadenylation signal (AATAAA) and putative Kisspeptin-10 region (FNYNPLTLRF) are boxed. Theproteolytic cleavage site (GKR) is marked as diamond.通过氨基酸比对发现,牙鲆 kiss2 与条纹鲈(Morone saxatilis)的同源性最高,为 76%,接着是欧洲海鲈(Dicentrarchus labrax),为 74%;与带点石斑鱼(Epinephelus coioides)、(罗非鱼(Oreochromis niloticus)和塞内加尔鳎(Soleasenegalensis)的同源性依次为 72%、70%和 69%。而其与虹鳟(Oncorhynchus mykiss)、斑马鱼(Danio rerio)、鲫鱼(Casrassius auratus)的同源性较低,依次为为 34%、28%和 25%,与巴西乌龟(Trachemys scripta elegans)和非洲爪蟾(Xenopus siluranatropicalis)的同源性也仅为 24%。然而,Kisspeptin-10 片段区域在脊椎动物中高度
图 2-2 牙鲆 kiss2 氨基酸序列比对分析颜色不同表示保守性不同;Kisspeptin-10区域用红色的方框标示。Fig.2-2 Alignment of amino acid sequences of P. olivaceus kiss2 and other species kiss2The identical, highly and less conserved amino acid residues are indicated by different colors,respectively. The Kisspeptin-10 regions are shown in boxes (color red).系统进化树分析结果显示,脊椎动物 Kisspeptins 分为两支,即 Kisspeptin-1 和Kisspeptin-2。牙鲆 Kisspeptin 与脊椎动物 Kisspeptin-2 聚为一支(图 2-3)。
23图 2-3 kiss1和kiss2氨基酸序列构建的系统进化树Fig.2-3 Phylogenetic analysis of the deduced amino acid sequences of vertebrate kiskiss2 genes..3 牙鲆 gpr54-2 基因的克隆以牙鲆脑组织 RNA 为模板,首先进行 gpr54-2 部分 cDNA 片段的 PCR 到长度分别为 638bp、234bp 和 138bp 的 EST 序列;通过 3'-RACE PCR 得 793 bp 的序列,通过 5'-RACE PCR 得到长度为 1114bp 的序列。经过拼接长度为 2556bp 的牙鲆 gpr54-2 cDNA 全长序列(图 2-4)。该序列包括 1143放阅读框,899bp 的 5'非翻译区(UTR)及 504bp 的 3'非翻译区,编码 380酸。其蛋白具有 7 个跨膜区域。经预测其氨基酸理论等电点为 9.01,分子0KD。
【共引文献】
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本文编号:2817820
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