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哲罗鲑胰岛素样生长因子Ⅱ原核表达、多克隆抗体的制备及组织表达分析

发布时间:2020-12-09 01:27
  在鱼类胚胎发育过程中,胰岛素样生长因子-II(insulin-like growth factors-II,IGF-II)起着关键的作用。哲罗鲑(Hucho taimen)是鲑科鱼类中最大的个体,其细嫩的肉质、鲜美的味道具有很高的食用与经济价值,目前国内还没有关于哲罗鲑的IGF-II基因的研究。本研究根据Gen Bank里收录的鲑鳟鱼IGF-II基因序列设计引物P1、P2,以哲罗鲑肝脏RNA提取物为模板,利用RT-PCR方法扩增出哲罗鲑IGF-II基因开放阅读框。首先本研究利用生物学软件对成功克隆出的哲罗鲑IGF-II基因开放阅读框进行了生物信息学分析,其中利用Meg Align软件中默认的Clustal W模式对IGF-II核苷酸序列与氨基酸序列进行同源性分析。利用DNAMAN翻译获得IGF-II氨基酸序列,利用Protean软件进行IGF-II蛋白分子量及等电点进行了预测,采用Clustalx 1.83软件和MEGA 5.0软件构建了IGF-II核酸序列系统进化树。其次,本研究根据哲罗鱼IGF-II基因开放阅读框序列,利用Primer软件设计了一对用于做荧光实时定量PCR的引物IG... 

【文章来源】:上海海洋大学上海市

【文章页数】:67 页

【学位级别】:硕士

【部分图文】:

哲罗鲑胰岛素样生长因子Ⅱ原核表达、多克隆抗体的制备及组织表达分析


IGF-II基因扩增产物电泳图

重组质粒,酶切鉴定,哲罗鲑,信息学


4-2 IGF-II 重组质粒酶切鉴定 双酶切后的 IGF-II 重组质粒;II 重组质粒;M. DL2000 分子量标准dentification of IGF-II by dual-digestionigestion of recombinant plasmid IGF-II;nt plasmid IGF-II; M. DL2000 DNAmark信息学分析析序结果,经 Blast 与 GenBank 里MAN 分析结果显示,哲罗鲑 IGF-;利用 Protean 软件预测确定 IGF 9.92。与鳜鱼、虹鳟的 IGF-II 结构

氨基酸序列,哲罗鲑,氨基酸序列


图 4-3 哲罗鲑 IGF-II ORF 的 cDNA 和氨基酸序列Fig.4-3 The cDNAand deduced amino acid sequence in Hucho taimen IGF-II ORF注: 大写字母对应下面部分为氨基酸序列,大写字母部分为编码区;黑字浅灰色底部分信号肽;黑字深灰色底部分表示成熟肽;白字黑色底部分表示 E 肽;*表示终止密码子。Note: The opposites of the capital letters show the amino acids and capital letters repreding regions; Black letters and light gray background indicate the signal peptide; Black lettersrk gray background indicate the mature peptide; White letters and black background indicate tptide; * indicates the stop codon..2.2 哲罗鲑 IGF-II 同源性的分析应用 MegAlign 软件中默认的 Clustal W 模式,将哲罗鲑 IGF-II 基因 ORF 核序列及其编码的氨基酸序列与其他 17 个物种进行同源性分析,结果发现,哲的 IGF-II 与大西洋鲑的核苷酸及氨基酸同源性分别为 98.6%和 98.4%。而与金、牙鲆、鳜鱼、鲈鱼、点蓝子鱼、斑马宫丽鱼的 IGF-II 的相似度在 88%-85


本文编号:2906014

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