河南省黄颡鱼和鲇自然居群遗传多样性分析
发布时间：2020-12-14 17:29
遗传多样性是指种群内不同群体或同一群体内不同个体的遗传变异的总和,是保护生物学研究的核心之一。ISSR分子标记技术可以快速、高效和灵敏地检测出基因组DNA的多态性,是研究遗传多样性的较好方法之一。本文以河南省境内黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）和鲇（Silurus asotus）的自然居群为研究对象,标本分别采于淇河、信阳南湾水库和丹江口水库,利用ISSR分子标记技术对其遗传多样性和遗传结构进行分析,旨在为其资源保护与开发利用提供理论依据和数据参考。用4种方法对保存于95%乙醇的黄颡鱼和鲇的肌肉组织样本进行预处理,比较其基因组DNA的提取效果。结果表明,用STE缓冲液预处理的样品,基因组DNA条带清晰、整齐,无降解现象,A260/A280值正常,在1.82.0之间,DNA完整性较好,是提取乙醇保存的肌肉组织DNA前较为理想的预处理方法。利用文献法,参考同种和近缘物种,初选引物,再通过实验筛选,最后确定ISSR标记用于分析黄颡鱼和鲇遗传多样性的共用引物15个。利用正交设计,优化了黄颡鱼和鲇的ISSR-PCR反应体系,即25μL最佳的反应体系为...
【文章来源】：河南师范大学河南省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
四种预处理黄颡鱼DNA的电泳图谱
图 3-2 黄颡鱼和鲇基因组 DNA 的电泳图谱：分子量标记（图中第一条带为 23kb），1~9 为黄颡鱼个体，10~17 为鲇个-2 The electrophoresis patterns of DNA of Pelteobagrus fulvidraco and SilurusM：molecular marker(λ-Hind Ⅲ digest DNAMarker)，1~9：Pelteobagrus fulvidraco individuals，10~17：Silurus asotus individual 引物筛选结果
图 3-3 ISSR-PCR 反应体系的 L25（56）正交试验设计电泳图谱1~25 代表表 2-4 中编号Fig.3-3 The electrophoresis patterns of orthogonal experimental design for ISSR-PCR system1~25 represent the number in tab.2-4.2 ISSR-PCR 最佳反应体系
【参考文献】：
期刊论文
[1]不同提取方法和不同组织对中华绒螯蟹DNA提取效果的比较研究[J]. 刘皓,刘青,吴旭干,何杰,董鹏生,李彤,成永旭. 广东农业科学. 2014(24)
[2]野生和养殖黄颡鱼遗传结构的TRAP分析[J]. 薛淑群,孙源,孙中武,卢建国. 水产学杂志. 2014(06)
[3]黄颡鱼属SSR分子鉴定及其遗传多样性[J]. 赵哲霞,蒋珊,王滨花,舒汉鼎,龚瑞玥,毛慧玲. 南昌大学学报(理科版). 2014(05)
[4]生物多样性丧失机制研究进展[J]. 魏辅文,聂永刚,苗海霞,路浩,胡义波. 科学通报. 2014(06)
[5]淮河野生鲇鱼线粒体Cytb基因的序列变异与遗传结构分析[J]. 肖明松,崔峰,康健,张晓红. 动物学杂志. 2013(01)
[6]苦瓜基因组DNA的提取及ISSR扩增体系的优化[J]. 田丽波,谷幸幸,商桑,杨衍. 中国农学通报. 2013(04)
[7]百合属ISSR反应条件优化的研究[J]. 陈名红,李玉,刘多,熊华斌,李成云. 中国农学通报. 2013(04)
[8]鄱阳湖黄颡鱼染色体核型分析及进化地位探讨[J]. 毛慧玲,葛欣琦,刘佳丽,舒汉鼎,陈婷婷. 江西农业大学学报. 2012(06)
[9]云斑尖塘鳢遗传多样性的ISSR分析[J]. 姚俊伟,许爱娱,潘淦,龙程. 广东农业科学. 2012(22)
[10]5个尼罗罗非鱼群体遗传关系的ISSR分析[J]. 钟建兴,李金秋,钟然,黄洪贵,杨盛昌. 福建水产. 2012(05)
硕士论文
[1]河南省3种鲈形目鱼类自然居群的遗传多样性分析[D]. 刘芳.河南师范大学 2015
[2]基于微卫星标记和线粒体cytb基因序列的鲇遗传多样性研究[D]. 徐丹丹.西南大学 2013
[3]信阳南湾水库翘嘴红鲌和青梢红鲌遗传多样性研究[D]. 马云霞.河南师范大学 2013
[4]长江中下游五个地理种群黄颡鱼遗传多样性的分析以及MSTN多态性的研究[D]. 刘朋朋.南京师范大学 2013
[5]丹江口水库鳡鱼野生和养殖群体遗传多样性的ISSR分析[D]. 温树红.河南师范大学 2012
[6]鄱阳湖水系四大家鱼ISSR研究[D]. 邓梦颖.南昌大学 2011
[7]黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）群体遗传结构分析及性别特异性分子标记的筛选[D]. 孙源.东北林业大学 2011
[8]淇河鲫ISSR和Cytb分子遗传特征的研究[D]. 高丽霞.河南师范大学 2011
[9]赣江赣州江段四大家鱼生物学特性及其遗传多样性研究[D]. 朱日财.南昌大学 2010
[10]长江上游两种铜鱼属鱼类种间特异性ISSR分子标记及遗传多样性研究[D]. 孔焰.西南大学 2010
本文编号：2916734
【文章来源】：河南师范大学河南省
【文章页数】：67 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
四种预处理黄颡鱼DNA的电泳图谱
图 3-2 黄颡鱼和鲇基因组 DNA 的电泳图谱：分子量标记（图中第一条带为 23kb），1~9 为黄颡鱼个体，10~17 为鲇个-2 The electrophoresis patterns of DNA of Pelteobagrus fulvidraco and SilurusM：molecular marker(λ-Hind Ⅲ digest DNAMarker)，1~9：Pelteobagrus fulvidraco individuals，10~17：Silurus asotus individual 引物筛选结果
图 3-3 ISSR-PCR 反应体系的 L25（56）正交试验设计电泳图谱1~25 代表表 2-4 中编号Fig.3-3 The electrophoresis patterns of orthogonal experimental design for ISSR-PCR system1~25 represent the number in tab.2-4.2 ISSR-PCR 最佳反应体系
【参考文献】：
期刊论文
[1]不同提取方法和不同组织对中华绒螯蟹DNA提取效果的比较研究[J]. 刘皓,刘青,吴旭干,何杰,董鹏生,李彤,成永旭. 广东农业科学. 2014(24)
[2]野生和养殖黄颡鱼遗传结构的TRAP分析[J]. 薛淑群,孙源,孙中武,卢建国. 水产学杂志. 2014(06)
[3]黄颡鱼属SSR分子鉴定及其遗传多样性[J]. 赵哲霞,蒋珊,王滨花,舒汉鼎,龚瑞玥,毛慧玲. 南昌大学学报(理科版). 2014(05)
[4]生物多样性丧失机制研究进展[J]. 魏辅文,聂永刚,苗海霞,路浩,胡义波. 科学通报. 2014(06)
[5]淮河野生鲇鱼线粒体Cytb基因的序列变异与遗传结构分析[J]. 肖明松,崔峰,康健,张晓红. 动物学杂志. 2013(01)
[6]苦瓜基因组DNA的提取及ISSR扩增体系的优化[J]. 田丽波,谷幸幸,商桑,杨衍. 中国农学通报. 2013(04)
[7]百合属ISSR反应条件优化的研究[J]. 陈名红,李玉,刘多,熊华斌,李成云. 中国农学通报. 2013(04)
[8]鄱阳湖黄颡鱼染色体核型分析及进化地位探讨[J]. 毛慧玲,葛欣琦,刘佳丽,舒汉鼎,陈婷婷. 江西农业大学学报. 2012(06)
[9]云斑尖塘鳢遗传多样性的ISSR分析[J]. 姚俊伟,许爱娱,潘淦,龙程. 广东农业科学. 2012(22)
[10]5个尼罗罗非鱼群体遗传关系的ISSR分析[J]. 钟建兴,李金秋,钟然,黄洪贵,杨盛昌. 福建水产. 2012(05)
硕士论文
[1]河南省3种鲈形目鱼类自然居群的遗传多样性分析[D]. 刘芳.河南师范大学 2015
[2]基于微卫星标记和线粒体cytb基因序列的鲇遗传多样性研究[D]. 徐丹丹.西南大学 2013
[3]信阳南湾水库翘嘴红鲌和青梢红鲌遗传多样性研究[D]. 马云霞.河南师范大学 2013
[4]长江中下游五个地理种群黄颡鱼遗传多样性的分析以及MSTN多态性的研究[D]. 刘朋朋.南京师范大学 2013
[5]丹江口水库鳡鱼野生和养殖群体遗传多样性的ISSR分析[D]. 温树红.河南师范大学 2012
[6]鄱阳湖水系四大家鱼ISSR研究[D]. 邓梦颖.南昌大学 2011
[7]黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）群体遗传结构分析及性别特异性分子标记的筛选[D]. 孙源.东北林业大学 2011
[8]淇河鲫ISSR和Cytb分子遗传特征的研究[D]. 高丽霞.河南师范大学 2011
[9]赣江赣州江段四大家鱼生物学特性及其遗传多样性研究[D]. 朱日财.南昌大学 2010
[10]长江上游两种铜鱼属鱼类种间特异性ISSR分子标记及遗传多样性研究[D]. 孔焰.西南大学 2010
本文编号：2916734
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