WSSV变异分析及wsv089和wsv150酵母双杂交诱饵载体的构建
发布时间：2021-01-27 09:36
白斑综合征病毒（WSSV）是造成全球范围内虾类养殖中经济损失的一个主要原因。为了解我国WSSV的流行变异情况,本研究对5个高变异区ORF14/15、ORF23/24、ORF75、ORF94、ORF125以及wsv089、wsv150进行了变异分析,并构建了wsv089和wsv150的酵母双杂交诱饵载体。具体内容如下:选取2017年中国部分地区的42个WSSV阳性样本,对ORF14/15、ORF23/24、ORF75、ORF94和ORF125共5个可变区进行PCR特异性扩增,分析其序列的缺失情况和重复单元（Ru）中单核苷酸多态性的变化。研究结果显示,在ORF14/15的扩增中各分离株共出现4种缺失片段,各片段之间差异较小;ORF23/24只出现11945bp的缺失片段;ORF75扩增中,总RUs数目为3、4、9,其中45bp的RUs在12、27、80位点发生多核苷酸多态性;ORF94的RUs数目为6,且均在48bp的位置出现单核苷酸多态性;ORF125的RUs数目为4、6、7不等,其各重复单元分别在20、27、50、53、61位发生碱基突变。研究结果表明,在2017年样本中来自我国不同地...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：73 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
ORF14/15的PCR扩增电泳结果
图 2-2 ORF23/24 的 PCR 扩增电泳结果注: M: DNA Marker DL 2000; (+)阳性对照, (–)阴性对照; 1-42: 样品编号Fig. 2-2 PCR amplification electrophoresis results of ORF23/24: M: DNAMarker DL 2000; (+) positive control, (–) negative control; 1-42: number of s在 ORF75 扩增中, 共有 7 份样本检出（7#、9#、11#、14#、27#、37#、率为 16.67%（图 2-3）。
图 2-3 ORF75 的 PCR 扩增电泳结果注: M: DNA Marker DL 2000; (+)阳性对照, (–)阴性对照; 1-42: 样品编号Fig.2- 3 PCR amplification electrophoresis results of ORF75: M: DNAMarker DL 2000; (+) positive control, (–) negative control; 1-42: number of s在 ORF94 扩增中，只有东营（37#）的样本有目的条带检出，其余地区现特异性条带，检出率为 2.38%（图 2-4）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国水产动物病毒学研究概述[J]. 桂朗,张奇亚. 水产学报. 2019(01)
[2]马铃薯StERF5转录因子酵母双杂交诱饵载体的构建及鉴定[J]. 徐萍萍,房宸曦,梁丽娜,王亚鹏,张宁,司怀军. 分子植物育种. 2018(19)
[3]加工番茄PVYN:O HC-Pro、STV RdRp酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活验证[J]. 路遥,周东,郑银英. 江苏农业科学. 2018(17)
[4]南美白对虾养殖现状、存在问题及发展对策[J]. 陈健,李良玉,杨壮志,唐洪,杨马. 渔业致富指南. 2018(16)
[5]2016年中国部分地区白斑综合征病毒高变异区序列的分析比较[J]. 蔡苗,孙新颖,刘庆慧,万晓媛,黄倢. 海洋渔业. 2018(04)
[6]2015年中国典型对虾养殖区WSSV流行株高变异区序列的分析比较[J]. 秦梦雪,孙新颖,万晓媛,刘庆慧,黄倢. 渔业科学进展. 2018(02)
[7]安徽省克氏原螯虾白斑综合征病毒变异区序列分析[J]. 陈红莲,王永杰,蒋业林,程云生,张静,王芬. 安徽农业大学学报. 2017(05)
[8]中国部分地区对虾白斑综合征病毒胶原蛋白基因缺失变异分析[J]. 秦梦雪,刘庆慧,万晓媛,黄捷. 动物医学进展. 2017(01)
[9]2014年中国不同地区对虾白斑综合征病毒ORF14/15和ORF23/24缺失区序列比较[J]. 孙新颖,刘庆慧,万晓媛,黄倢. 渔业科学进展. 2016(04)
[10]白斑综合征病毒2014年中国毒株变异区的序列比较[J]. 孙新颖,万晓媛,刘庆慧,黄倢. 渔业科学进展. 2016(02)
博士论文
[1]利用酵母双杂交解析WSSV感染凡纳滨对虾途径的研究[D]. 谢世筠.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2016
硕士论文
[1]凡纳滨对虾养殖池塘中的微生物调控作用及机制[D]. 李云梦.浙江大学 2018
[2]SPAG6相互作用蛋白的酵母双杂交筛选[D]. 平光伦.武汉科技大学 2015
[3]柔嫩艾美耳球虫子孢子酵母双杂交cDNA文库的构建及EtAMA1相互作用蛋白的初步筛选[D]. 薛璞.上海师范大学 2013
[4]白斑综合症病毒（WSSV）侵染对虾途径的研究[D]. 戴俊逸.国家海洋局第三海洋研究所 2012
[5]应用分子检测技术对养殖对虾病毒性疾病流行情况的初步研究[D]. 王明森.青岛科技大学 2010
本文编号：3002831
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：73 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
ORF14/15的PCR扩增电泳结果
图 2-2 ORF23/24 的 PCR 扩增电泳结果注: M: DNA Marker DL 2000; (+)阳性对照, (–)阴性对照; 1-42: 样品编号Fig. 2-2 PCR amplification electrophoresis results of ORF23/24: M: DNAMarker DL 2000; (+) positive control, (–) negative control; 1-42: number of s在 ORF75 扩增中, 共有 7 份样本检出（7#、9#、11#、14#、27#、37#、率为 16.67%（图 2-3）。
图 2-3 ORF75 的 PCR 扩增电泳结果注: M: DNA Marker DL 2000; (+)阳性对照, (–)阴性对照; 1-42: 样品编号Fig.2- 3 PCR amplification electrophoresis results of ORF75: M: DNAMarker DL 2000; (+) positive control, (–) negative control; 1-42: number of s在 ORF94 扩增中，只有东营（37#）的样本有目的条带检出，其余地区现特异性条带，检出率为 2.38%（图 2-4）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]中国水产动物病毒学研究概述[J]. 桂朗,张奇亚. 水产学报. 2019(01)
[2]马铃薯StERF5转录因子酵母双杂交诱饵载体的构建及鉴定[J]. 徐萍萍,房宸曦,梁丽娜,王亚鹏,张宁,司怀军. 分子植物育种. 2018(19)
[3]加工番茄PVYN:O HC-Pro、STV RdRp酵母双杂交诱饵载体的构建及自激活验证[J]. 路遥,周东,郑银英. 江苏农业科学. 2018(17)
[4]南美白对虾养殖现状、存在问题及发展对策[J]. 陈健,李良玉,杨壮志,唐洪,杨马. 渔业致富指南. 2018(16)
[5]2016年中国部分地区白斑综合征病毒高变异区序列的分析比较[J]. 蔡苗,孙新颖,刘庆慧,万晓媛,黄倢. 海洋渔业. 2018(04)
[6]2015年中国典型对虾养殖区WSSV流行株高变异区序列的分析比较[J]. 秦梦雪,孙新颖,万晓媛,刘庆慧,黄倢. 渔业科学进展. 2018(02)
[7]安徽省克氏原螯虾白斑综合征病毒变异区序列分析[J]. 陈红莲,王永杰,蒋业林,程云生,张静,王芬. 安徽农业大学学报. 2017(05)
[8]中国部分地区对虾白斑综合征病毒胶原蛋白基因缺失变异分析[J]. 秦梦雪,刘庆慧,万晓媛,黄捷. 动物医学进展. 2017(01)
[9]2014年中国不同地区对虾白斑综合征病毒ORF14/15和ORF23/24缺失区序列比较[J]. 孙新颖,刘庆慧,万晓媛,黄倢. 渔业科学进展. 2016(04)
[10]白斑综合征病毒2014年中国毒株变异区的序列比较[J]. 孙新颖,万晓媛,刘庆慧,黄倢. 渔业科学进展. 2016(02)
博士论文
[1]利用酵母双杂交解析WSSV感染凡纳滨对虾途径的研究[D]. 谢世筠.中国科学院研究生院(海洋研究所) 2016
硕士论文
[1]凡纳滨对虾养殖池塘中的微生物调控作用及机制[D]. 李云梦.浙江大学 2018
[2]SPAG6相互作用蛋白的酵母双杂交筛选[D]. 平光伦.武汉科技大学 2015
[3]柔嫩艾美耳球虫子孢子酵母双杂交cDNA文库的构建及EtAMA1相互作用蛋白的初步筛选[D]. 薛璞.上海师范大学 2013
[4]白斑综合症病毒（WSSV）侵染对虾途径的研究[D]. 戴俊逸.国家海洋局第三海洋研究所 2012
[5]应用分子检测技术对养殖对虾病毒性疾病流行情况的初步研究[D]. 王明森.青岛科技大学 2010
本文编号：3002831
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