三角帆蚌遗传连锁图谱构建及育珠相关性状QTL定位分析
发布时间：2021-02-23 19:40
三角帆蚌是一种广泛分布于我国的淡水珍珠贝类，并且是我国最具经济价值的淡水贝类。传统的选育工作主要依靠表型来进行选择，往往容易受环境影响。相对于传统育种方法来说，分子标记辅助育种则不易受环境的影响，并且能够提高育种效率和缩短育种周期。本文通过磁珠富集法分离筛选了大量微卫星分子标记，并以这些分离标记构建了三角帆蚌的遗传连锁图谱，然后通过复合区间作图法对其育珠相关性状进行了QTL定位。主要研究内容如下：1．用磁珠富集法构建了三角帆蚌（GA）10和（CA）10微卫星富集文库。利用PrimerSelect软件对得到的微卫星序列进行引物设计并合成得到1970对引物。其中43个四核苷酸重复微卫星中有17对引物呈现多态性，并用36只洞庭湖三角帆蚌扩增。17个微卫星位点等位基因数的范围为6～28。期望杂合度（He）、观测杂合度（Ho）的范围分别为0.6776～0.9464、0.6389～1.0000。多态信息含量（PIC）在0.630～0.929之间。统计分析结果显示，其中有12个微卫星位点满足Hardy–Weinberg平衡条件。与本实验室之前开发的二核苷酸重复微卫星相比，该17条四核甘酸重复微卫星具...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
引物Hcuca0340在部分个体的扩增结果
内壳色指标的测量采用Lovibond-RT200表面色度计来进行。对每个F1代个体的左半壳三个位点（A、B、C）进行测量（如图4-1）。A为左半壳后闭壳肌位置颜色，B 为内脏团痕与纵肋的交叉位置，C 为左壳前闭壳肌位置颜色。每个位置测量的值采用 Lab(CIE1976)颜色系统，测得a、b、 L、dE四个值。Aa、Ab、AL和AdE分别代表测量每个蚌壳三个点（A、B、C）得到的平均a、b、L、dE。a>0时，代表颜色偏红，a<0时，代表颜色偏绿；b>0时，代表颜色偏黄，b<0时
44图 4-2 QTL 在连锁图谱上的定位结果Fig 4-2 The locations of the QTLs on the linkage map of Hyriopsis cumingii图 4-2 （续）Fig 4-2 Continued4.2.2.2 三角帆蚌生长相关性状 QTL 定位结果在三角帆蚌遗传图谱上共定位了17个生长相关的QTL（图4-3）。其中包括2
【参考文献】：
期刊论文
[1]牙鲆亲本对子代贡献率的实验研究[J]. 陈睿毅,王桂兴,刘海金,王玉芬,司飞,姜宏波. 中国水产科学. 2013(04)
[2]皱纹盘鲍微卫星多重PCR体系构建及其在家系鉴定中的应用[J]. 聂鸿涛,李琪,孔令锋. 水产学报. 2013(02)
[3]建鲤（Cyprinus carpio var. Jian）微卫星DNA亲权鉴定[J]. 顾颖,李超,鲁翠云,郑先虎,俞菊华,孙效文. 遗传. 2012(11)
[4]三角帆蚌微卫星位点筛选及多态性分析[J]. 罗明,白志毅,李应森,李家乐. 淡水渔业. 2012(01)
[5]脊尾白虾微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J]. 贾舒雯,刘萍,韩智科,李健,潘鲁青. 水产学报. 2011(12)
[6]镜鲤体长、体高、体厚性状QTL定位分析[J]. 郑先虎,匡友谊,鲁翠云,王宣朋,李文升,吕伟华,孙效文. 遗传. 2011(12)
[7]草鱼三、四核苷酸重复微卫星标记的分离与特征分析[J]. 李文升,刘翠,鲁翠云,李超,孙效文. 中国水产科学. 2011(04)
[8]鲢三、四核苷酸重复微卫星标记的筛选及其特征分析[J]. 谭照君,张天奇,鲁翠云,李超,孙效文. 上海海洋大学学报. 2011(03)
[9]磁珠富集法筛选方正银鲫的三、四核苷酸重复微卫星DNA[J]. 曹柱,鲁翠云,郑先虎,储志远,张天奇,赵元凤,孙效文. 淡水渔业. 2011(01)
[10]背角无齿蚌基因组（GT）n微卫星DNA特征[J]. 汪桂玲,苏翔,李家乐,白志毅. 生态学杂志. 2011(01)
博士论文
[1]鲤连锁图谱及生长、肉质性状QTL定位研究[D]. 郑先虎.上海海洋大学 2012
[2]大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D]. 叶华.湖南农业大学 2010
[3]海湾扇贝遗传图谱构建及壳色基因、生长相关QTL的定位研究[D]. 秦艳杰.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2006
[4]皱纹盘鲍遗传图谱构建及生长相关性状的QTL定位[D]. 刘贤德.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2005
硕士论文
[1]皱纹盘鲍遗传多样性的研究及遗传图谱构建[D]. 徐艳虹.中国海洋大学 2007
本文编号：3048121
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：80 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
引物Hcuca0340在部分个体的扩增结果
内壳色指标的测量采用Lovibond-RT200表面色度计来进行。对每个F1代个体的左半壳三个位点（A、B、C）进行测量（如图4-1）。A为左半壳后闭壳肌位置颜色，B 为内脏团痕与纵肋的交叉位置，C 为左壳前闭壳肌位置颜色。每个位置测量的值采用 Lab(CIE1976)颜色系统，测得a、b、 L、dE四个值。Aa、Ab、AL和AdE分别代表测量每个蚌壳三个点（A、B、C）得到的平均a、b、L、dE。a>0时，代表颜色偏红，a<0时，代表颜色偏绿；b>0时，代表颜色偏黄，b<0时
44图 4-2 QTL 在连锁图谱上的定位结果Fig 4-2 The locations of the QTLs on the linkage map of Hyriopsis cumingii图 4-2 （续）Fig 4-2 Continued4.2.2.2 三角帆蚌生长相关性状 QTL 定位结果在三角帆蚌遗传图谱上共定位了17个生长相关的QTL（图4-3）。其中包括2
【参考文献】：
期刊论文
[1]牙鲆亲本对子代贡献率的实验研究[J]. 陈睿毅,王桂兴,刘海金,王玉芬,司飞,姜宏波. 中国水产科学. 2013(04)
[2]皱纹盘鲍微卫星多重PCR体系构建及其在家系鉴定中的应用[J]. 聂鸿涛,李琪,孔令锋. 水产学报. 2013(02)
[3]建鲤（Cyprinus carpio var. Jian）微卫星DNA亲权鉴定[J]. 顾颖,李超,鲁翠云,郑先虎,俞菊华,孙效文. 遗传. 2012(11)
[4]三角帆蚌微卫星位点筛选及多态性分析[J]. 罗明,白志毅,李应森,李家乐. 淡水渔业. 2012(01)
[5]脊尾白虾微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J]. 贾舒雯,刘萍,韩智科,李健,潘鲁青. 水产学报. 2011(12)
[6]镜鲤体长、体高、体厚性状QTL定位分析[J]. 郑先虎,匡友谊,鲁翠云,王宣朋,李文升,吕伟华,孙效文. 遗传. 2011(12)
[7]草鱼三、四核苷酸重复微卫星标记的分离与特征分析[J]. 李文升,刘翠,鲁翠云,李超,孙效文. 中国水产科学. 2011(04)
[8]鲢三、四核苷酸重复微卫星标记的筛选及其特征分析[J]. 谭照君,张天奇,鲁翠云,李超,孙效文. 上海海洋大学学报. 2011(03)
[9]磁珠富集法筛选方正银鲫的三、四核苷酸重复微卫星DNA[J]. 曹柱,鲁翠云,郑先虎,储志远,张天奇,赵元凤,孙效文. 淡水渔业. 2011(01)
[10]背角无齿蚌基因组（GT）n微卫星DNA特征[J]. 汪桂玲,苏翔,李家乐,白志毅. 生态学杂志. 2011(01)
博士论文
[1]鲤连锁图谱及生长、肉质性状QTL定位研究[D]. 郑先虎.上海海洋大学 2012
[2]大黄鱼SSR遗传连锁图谱的构建及生长相关性状的QTL定位[D]. 叶华.湖南农业大学 2010
[3]海湾扇贝遗传图谱构建及壳色基因、生长相关QTL的定位研究[D]. 秦艳杰.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2006
[4]皱纹盘鲍遗传图谱构建及生长相关性状的QTL定位[D]. 刘贤德.中国科学院研究生院（海洋研究所） 2005
硕士论文
[1]皱纹盘鲍遗传多样性的研究及遗传图谱构建[D]. 徐艳虹.中国海洋大学 2007
本文编号：3048121
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