鲤鱼基质金属蛋白酶-2的基因克
发布时间:2021-03-01 23:04
基质金属蛋白酶(Matrix metalloproteinases, MMPs)是能够降解细胞外基质(Extracellular matrix, ECM)的最重要的金属离子依赖性蛋白酶。MMPs参与许多生理、病理过程,广泛存在于动、植物和微生物体内。研究发现,MMPs参与鱼死后肌肉软化过程中细胞外基质的降解,而胶原酶和明胶酶在此过程中起到关键作用。作为一种重要的蛋白酶,基质金属蛋白酶-2(MMP-2)参与动物胶原蛋白的新陈代谢,但其在水产动物中的存在情况少有报道。本文以淡水鲤鱼为研究对象,克隆得到MMP-2基因序列并利用原核表达系统实现MMP-2催化结构域的体外表达并对重组MMP-2的酶学性质进行深入分析。本研究首先利用RT-PCR和RACE技术从鲤鱼肌肉中克隆得到MMP-2的cDNA全长共2789bp,开放阅读框共1971bp,编码657个氨基酸残基。鲤鱼MMP-2含有四个保守的结构域,包括N端含29个氨基酸残基的信号肽、前肽结构域、含有三个重复Ⅱ型纤连蛋白结构域的催化结构域以及C端的类血红素结构域。利用空间预测软件Swiss-model,对鲤鱼MMP-2进行同源建模,预测其三级结构...
【文章来源】:集美大学福建省
【文章页数】:64 页
【学位级别】:硕士
【文章目录】:
摘要
Abstract
第1章 引言
1.1 基质金属蛋白酶简介
1.1.1 MMPs 家族特征
1.1.2 MMPs 的分类
1.1.3 MMPs 的空间结构
1.1.4 MMPs 的活性调节
1.1.5 MMPs 的内源性抑制剂
1.2 MMPs 在水产品中的研究现状
1.3 MMP-2 的研究
1.4 本研究的目的和意义
第2章 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 动物
2.1.2 主要仪器
2.1.3 主要试剂与材料
2.1.4 常用溶液及培养基配制
2.2 实验方法
2.2.1 基质金属蛋白酶-2 的基因克隆
2.2.2 生物信息学分析
2.2.3 重组蛋白的表达与纯化
2.2.4 重组蛋白的性质分析方法
2.2.5 多克隆抗体的制备
第3章 结果与分析
3.1 鲤鱼基质金属蛋白酶-2 的基因克隆
3.2 鲤鱼 MMP-2 的序列分析
3.2.1 鲤鱼 MMP-2 一级结构分析
3.2.2 鲤鱼 MMP-2 的二级结构分析
3.2.3 鲤鱼 MMP-2 的三级结构分析
3.3 鲤鱼 MMP-2 催化结构域蛋白的原核表达
3.3.1 表达质粒的构建
3.3.2 重组 MMP-2 蛋白的表达与鉴定
3.3.3 重组 MMP-2 蛋白的纯化及活性验证
3.4 重组 MMP-2 的性质分析
3.4.1 重组 MMP-2 最适反应温度和最适 pH
3.4.2 不同蛋白酶抑制剂对重组 MMP-2 活性的影响
3.4.3 不同金属离子对重组 MMP-2 活性的影响
3.5 重组 MMP-2 的降解作用
3.5.1 重组 MMP-2 对Ⅰ型胶原蛋白的降解作用
3.5.2 重组 MMP-2 对肌原纤维蛋白的降解作用
3.5.3 重组 MMP-2 对胶原肽的降解作用
3.6 鲤鱼肌肉中天然 MMP-2 的检测
3.7 Ⅱ型纤连蛋白结构域对重组 MMP-2 活性的影响
3.7.1 Ⅱ型纤连蛋白结构域基因扩增
3.7.2 重组 Fnt 和△Fnt 表达质粒构建
3.7.3 重组△Fnt 和 Fnt 蛋白的表达与鉴定
3.7.4 重组△Fnt 和 Fnt 蛋白的纯化与活性验证
第4章 讨论
第5章 结论与展望
5.1 结论
5.2 展望
致谢
参考文献
在学期间发表的学术论文
本文编号:3058152
【文章来源】:集美大学福建省
【文章页数】:64 页
【学位级别】:硕士
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Abstract
第1章 引言
1.1 基质金属蛋白酶简介
1.1.1 MMPs 家族特征
1.1.2 MMPs 的分类
1.1.3 MMPs 的空间结构
1.1.4 MMPs 的活性调节
1.1.5 MMPs 的内源性抑制剂
1.2 MMPs 在水产品中的研究现状
1.3 MMP-2 的研究
1.4 本研究的目的和意义
第2章 材料与方法
2.1 材料
2.1.1 动物
2.1.2 主要仪器
2.1.3 主要试剂与材料
2.1.4 常用溶液及培养基配制
2.2 实验方法
2.2.1 基质金属蛋白酶-2 的基因克隆
2.2.2 生物信息学分析
2.2.3 重组蛋白的表达与纯化
2.2.4 重组蛋白的性质分析方法
2.2.5 多克隆抗体的制备
第3章 结果与分析
3.1 鲤鱼基质金属蛋白酶-2 的基因克隆
3.2 鲤鱼 MMP-2 的序列分析
3.2.1 鲤鱼 MMP-2 一级结构分析
3.2.2 鲤鱼 MMP-2 的二级结构分析
3.2.3 鲤鱼 MMP-2 的三级结构分析
3.3 鲤鱼 MMP-2 催化结构域蛋白的原核表达
3.3.1 表达质粒的构建
3.3.2 重组 MMP-2 蛋白的表达与鉴定
3.3.3 重组 MMP-2 蛋白的纯化及活性验证
3.4 重组 MMP-2 的性质分析
3.4.1 重组 MMP-2 最适反应温度和最适 pH
3.4.2 不同蛋白酶抑制剂对重组 MMP-2 活性的影响
3.4.3 不同金属离子对重组 MMP-2 活性的影响
3.5 重组 MMP-2 的降解作用
3.5.1 重组 MMP-2 对Ⅰ型胶原蛋白的降解作用
3.5.2 重组 MMP-2 对肌原纤维蛋白的降解作用
3.5.3 重组 MMP-2 对胶原肽的降解作用
3.6 鲤鱼肌肉中天然 MMP-2 的检测
3.7 Ⅱ型纤连蛋白结构域对重组 MMP-2 活性的影响
3.7.1 Ⅱ型纤连蛋白结构域基因扩增
3.7.2 重组 Fnt 和△Fnt 表达质粒构建
3.7.3 重组△Fnt 和 Fnt 蛋白的表达与鉴定
3.7.4 重组△Fnt 和 Fnt 蛋白的纯化与活性验证
第4章 讨论
第5章 结论与展望
5.1 结论
5.2 展望
致谢
参考文献
在学期间发表的学术论文
本文编号:3058152
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3058152.html