花鲈cox6a基因与相关miRNA的鉴定及其在盐度适应中的表达调控分析

发布时间：2021-03-06 00:51

　　细胞色素c氧化酶（COX）是线粒体电子传递链的末端酶, COX6A是细胞色素c氧化酶的核编码亚基之一。为丰富花鲈（Latolabrax maculatus）细胞色素c氧化酶的基础研究,进一步了解cox6a基因及相关miRNAs在花鲈渗透调节机制中的潜在作用,本研究开展了花鲈cox6a基因的全基因组鉴定及序列分析、cox6a基因的组织表达谱分析和急性盐度转换后的表达分析。此外,预测了可能靶定花鲈cox6a基因的miRNAs,并对其与cox6a基因的功能相关性进行了分析。结果表明,花鲈具有2个cox6a基因（cox6a1、cox6a2）。系统进化树分析进一步确认了两个花鲈cox6a基因命名的准确性。多序列比对表明cox6a基因具有高度的保守性,尤其是C端。组织表达谱结果显示,花鲈cox6a1在垂体、脑、肝脏和肾脏中的表达量较高, cox6a2在心脏和肾脏中的表达量较高。共获得4个可能靶定cox6a2基因的miRNA:miR-30e-5p、miR-223、miR-200a-3p和miR-155-5p,但没有发现可能靶定cox6a1基因的miRNA。qRT-PCR的结果显示,在花鲈适应低盐和高... 

【文章来源】：中国水产科学. 2020,27(09)北大核心

【文章页数】：12 页

【部分图文】：

花鲈cox6a1(A)及cox6a2(B)基因在不同组织的mRNA相对表达量ep:小脑;gi:鳃;go:性腺;he:心脏;hki:头肾;hyi:垂体;hyu:下丘脑;ki:肾;li:肝;me:延髓;mi:中脑;mu:肌肉;sp:脾;st:胃;te:端脑.

图3 花鲈cox6a1(A)及cox6a2(B)基因在不同组织的mRNA相对表达量ep:小脑;gi:鳃;go:性腺;he:心脏;hki:头肾;hyi:垂体;hyu:下丘脑;ki:肾;li:肝;me:延髓;mi:中脑;mu:肌肉;sp:脾;st:胃;te:端脑.2.5 预测靶向cox6a的miRNA

本研究对4个cox6a2基因相关的miRNA进行了qRT-PCR分析。结果显示,miR-30e-5p、miR-223和miR-200a-3p在FW-SW组、SW-FW组中均表现出了相似的表达变化趋势:在FW-SW组中(图6),相对于淡水对照组(0 h),miR-30e-5p、miR-223和miR-200a-3p在处理12 h后表现出不同程度的上升趋势,表达量分别为0 h的9.9、14.6、23.8倍。其中miR-30e-5p(图6A)、miR-200a-3p(图6C)在1 d仍维持高表达,miR-223(图6B)在1 d后表达量相对于12 h下降了50%。这3个miRNAs在3 d后都迅速下降为接近0 h的表达水平,但在7 d又出现小幅度的上升(0 h的2.7～3.5倍)。而miR-155-5p的表达呈现相反的趋势:在处理12h后迅速下降了89.1%,并在3 d后回升为0 h的水平,在7 d时又下降为12 h的水平(图6D)。在SW-FW组中(图7),相对于海水对照组(0 h),miR-30e-5p(图7A)、miR-223(图7B)和miR-200a-3p(图7C)均在处理12 h后表现出了显著的上升趋势,其表达量分别为0 h的12.2、8.5、19.9倍,并在处理7 d后分别下降为0 h的2.1、2.6、2.2倍,其中miR-200a-3p(图7C)的表达变化最为显著。而miR-155-5p(图7D)在整个过程中没有表现出明显的变化趋势。图6 淡水转海水处理组(FW→SW)花鲈鳃中miRNAs的表达A.miR-30e-5p;B.miR-223;C.miR-200a-3p;D.miR-155-5p.柱形图上方字母不同表示差异显著(P<0.05).


本文编号：3066154