半滑舌鳎三个免疫相关基因克
发布时间：2021-03-06 03:52
半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）,是一种在我国沿海地区均有分布的栖息于底层的鱼类,具有生长快、营养丰富等优点,已成为珍贵的养殖鱼类之一。近年来,随着养殖规模的扩大,水体环境的恶化,半滑舌鳎养殖业面临着一系列严重的细菌病害威胁。水体环境中存在大量病原体可诱发其养殖过程中疾病频发,带来了巨大的经济损失,严重制约了其养殖业的进一步健康发展。因此,为了改变这一困境,对半滑舌鳎免疫相关基因及其免疫机制的探究迫在眉睫。其中肿瘤坏死因子家族（tumor necrosis factor superfamily）与其受体家族作为免疫系统中的重要成员,在半滑舌鳎免疫及炎症反应过程中具有重要的作用。本实验根据已公布的半滑舌鳎全基因组序列结果,从半滑舌鳎中克隆得到TNF-α1、TNF-α2和CD40等3个免疫相关基因,利用实时荧光定量PCR（qRT-PCR）检测了3个免疫相关基因在各组织中的表达模式,分析了哈维氏弧菌（Vibrio harveyi）刺激下三个免疫基因在3个主要免疫组织中的表达规律,并结合基因序列及进化特征,初步揭示了三个基因在半滑舌鳎免疫防御系统中的作用。同时,本文还验...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
半滑舌鳎TNF-α1和TNF-α2cDNA与基因组比对Fig.2-2TheTNF-α1andTNF-α2cDNAsequencesanddeducedaminoacidsinCynoglossus.
上海海洋大学硕士毕业论文x(2)-[QEKHL]-[LIVMGT]-x-PA [LIVMFY] 位于 119-135），TNF-α2 氨基酸则存在 6 个蛋白激酶 C 磷酸化位点（分别位于 26-28，30-32，82-84，101-103，143-145，166-168），3 个酰基化位点（分别位于 93-98，111-116，177-182），和 1 个TNF 超家族标签（位于 128-144）。跨膜预测结果显示 TNF-α1 和 TNF-α1 氨基酸均具有 1 个跨膜结构区（分别位于 35-54 和 33-52）。不同物种 TNF-α 氨基酸同源分析结果显示, TNF-α1 和 TNF-α2 均具有 1 个 TNF-α 转移酶切位点以及 2 个保守的半胱氨酸残基（图 2-3）。同时 TNF-α1 和 TNF-α2 与哺乳类、两栖类以及硬骨鱼类相似性分别为 38%~61%和 35%~68%，两种 TNF-α 均与硬骨鱼类相似性较高。系统进化分析与不同物种氨基酸同源分析相一致，结果显示半滑舌鳎 TNF-α1 和 TNF-α2 与其他硬骨鱼类 TNF-α 聚类为一支，其他物种 TNF-α 与 LT 聚类为一支（图 2-4）。
图 2-4 半滑舌鳎与其他物种 TNF-α 进化树Fig.3 Phylogenetic analysis of Cynoglossus semilaevis CD40 with other reported CD40s注 ： Cynoglossus semilaevis: 半 滑 舌 鳎 ; Dicentrarchus labrax 鲈 鱼 AAZ20770.1,Oplegnathus fasciatus 条石鲷 ACM69339.1, Epinephelus coioides 点带石斑 AEH59795.1 andAEH59794.1, Pagrus major 真鲷 AAP76392.1, Sparus aurata 金头鲷 AJ413189, Larimichthyscrocea 大黄鱼 KKF31855.1, Scophthalmus maximus 大菱鲆 ACN41911.1, Paralichthys olivaceus牙鲆 BAA94969.1, Salmo salar 大西洋鲑 ABG91799.1 and ABG91800.1, Danio rerio 斑马鱼AB183467.1, Homo sapiens 人类 EAX03424 and BAA00064.1, Oryctolagus cuniculus 家兔AAA31483.1, Mus musculus 小鼠 AAC82484.1, Rattus norvegicus 褐鼠 AAI07672.1, Equuscaballus 马 NP001075288.2, Bos Taurus 牛 AAI34756.1, Sus scrofa 野猪 CAN59689.1.2.2.3 TNF-α1 和 TNF-α2 表达模式分析qRT-PCR 表达结果显示，TNF-α1 和 TNF-α2 在半滑舌鳎各组织中都有表达，其中 TNF-α1 在肝脏和脾脏中相对表达量较高，TNF-α2 在脾脏和肾脏中相对表
【参考文献】：
期刊论文
[1]鱼类白介素及其受体的研究[J]. 高珊,余涛,周景祥,王好. 水产学杂志. 2014(03)
[2]CD40-CD40L共刺激途径在体液免疫和细胞免疫中的作用[J]. 杜振兰. 细胞与分子免疫学杂志. 2012(12)
[3]半滑舌鳎皮肤溃疡病病原研究[J]. 陈政强,姚志贤,林茂,常建波. 水产学报. 2012(05)
[4]DNA甲基化与癌症[J]. 韩竞男,鲁昊骋,梁静. 中国生物化学与分子生物学报. 2012(02)
[5]肿瘤坏死因子超家族成员分子结构的研究进展[J]. 熊娟,徐笑红. 医学综述. 2011(22)
[6]水产动物溶菌酶研究的最新进展[J]. 徐永平,汪婷婷,孙永欣,刘文嘉,尤建嵩,金礼吉. 水产科学. 2011(05)
[7]表观遗传学研究进展[J]. 李光雷,喻树迅,范术丽,宋美珍,庞朝友. 生物技术通报. 2011(01)
[8]鱼类免疫球蛋白分子生物学研究进展[J]. 冯建军,关瑞章,林鹏,郭松林. 集美大学学报(自然科学版). 2010(06)
[9]鱼类免疫系统的研究进展[J]. 王俊相,李玉萍,孔令富,李莲军. 四川畜牧兽医. 2010(07)
[10]硬骨鱼免疫系统的组成与免疫应答机制研究进展[J]. 王卫卫,吴谡琦,孙修勤,樊廷俊. 海洋科学进展. 2010(02)
本文编号：3066390
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：68 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
半滑舌鳎TNF-α1和TNF-α2cDNA与基因组比对Fig.2-2TheTNF-α1andTNF-α2cDNAsequencesanddeducedaminoacidsinCynoglossus.
上海海洋大学硕士毕业论文x(2)-[QEKHL]-[LIVMGT]-x-PA [LIVMFY] 位于 119-135），TNF-α2 氨基酸则存在 6 个蛋白激酶 C 磷酸化位点（分别位于 26-28，30-32，82-84，101-103，143-145，166-168），3 个酰基化位点（分别位于 93-98，111-116，177-182），和 1 个TNF 超家族标签（位于 128-144）。跨膜预测结果显示 TNF-α1 和 TNF-α1 氨基酸均具有 1 个跨膜结构区（分别位于 35-54 和 33-52）。不同物种 TNF-α 氨基酸同源分析结果显示, TNF-α1 和 TNF-α2 均具有 1 个 TNF-α 转移酶切位点以及 2 个保守的半胱氨酸残基（图 2-3）。同时 TNF-α1 和 TNF-α2 与哺乳类、两栖类以及硬骨鱼类相似性分别为 38%~61%和 35%~68%，两种 TNF-α 均与硬骨鱼类相似性较高。系统进化分析与不同物种氨基酸同源分析相一致，结果显示半滑舌鳎 TNF-α1 和 TNF-α2 与其他硬骨鱼类 TNF-α 聚类为一支，其他物种 TNF-α 与 LT 聚类为一支（图 2-4）。
图 2-4 半滑舌鳎与其他物种 TNF-α 进化树Fig.3 Phylogenetic analysis of Cynoglossus semilaevis CD40 with other reported CD40s注 ： Cynoglossus semilaevis: 半 滑 舌 鳎 ; Dicentrarchus labrax 鲈 鱼 AAZ20770.1,Oplegnathus fasciatus 条石鲷 ACM69339.1, Epinephelus coioides 点带石斑 AEH59795.1 andAEH59794.1, Pagrus major 真鲷 AAP76392.1, Sparus aurata 金头鲷 AJ413189, Larimichthyscrocea 大黄鱼 KKF31855.1, Scophthalmus maximus 大菱鲆 ACN41911.1, Paralichthys olivaceus牙鲆 BAA94969.1, Salmo salar 大西洋鲑 ABG91799.1 and ABG91800.1, Danio rerio 斑马鱼AB183467.1, Homo sapiens 人类 EAX03424 and BAA00064.1, Oryctolagus cuniculus 家兔AAA31483.1, Mus musculus 小鼠 AAC82484.1, Rattus norvegicus 褐鼠 AAI07672.1, Equuscaballus 马 NP001075288.2, Bos Taurus 牛 AAI34756.1, Sus scrofa 野猪 CAN59689.1.2.2.3 TNF-α1 和 TNF-α2 表达模式分析qRT-PCR 表达结果显示，TNF-α1 和 TNF-α2 在半滑舌鳎各组织中都有表达，其中 TNF-α1 在肝脏和脾脏中相对表达量较高，TNF-α2 在脾脏和肾脏中相对表
【参考文献】：
期刊论文
[1]鱼类白介素及其受体的研究[J]. 高珊,余涛,周景祥,王好. 水产学杂志. 2014(03)
[2]CD40-CD40L共刺激途径在体液免疫和细胞免疫中的作用[J]. 杜振兰. 细胞与分子免疫学杂志. 2012(12)
[3]半滑舌鳎皮肤溃疡病病原研究[J]. 陈政强,姚志贤,林茂,常建波. 水产学报. 2012(05)
[4]DNA甲基化与癌症[J]. 韩竞男,鲁昊骋,梁静. 中国生物化学与分子生物学报. 2012(02)
[5]肿瘤坏死因子超家族成员分子结构的研究进展[J]. 熊娟,徐笑红. 医学综述. 2011(22)
[6]水产动物溶菌酶研究的最新进展[J]. 徐永平,汪婷婷,孙永欣,刘文嘉,尤建嵩,金礼吉. 水产科学. 2011(05)
[7]表观遗传学研究进展[J]. 李光雷,喻树迅,范术丽,宋美珍,庞朝友. 生物技术通报. 2011(01)
[8]鱼类免疫球蛋白分子生物学研究进展[J]. 冯建军,关瑞章,林鹏,郭松林. 集美大学学报(自然科学版). 2010(06)
[9]鱼类免疫系统的研究进展[J]. 王俊相,李玉萍,孔令富,李莲军. 四川畜牧兽医. 2010(07)
[10]硬骨鱼免疫系统的组成与免疫应答机制研究进展[J]. 王卫卫,吴谡琦,孙修勤,樊廷俊. 海洋科学进展. 2010(02)
本文编号：3066390
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