日本沼虾硫氰酸生成酶抗氧化功能的初步研究
发布时间:2021-03-11 05:47
日本沼虾(Macrobrachium nipponense)是重要的淡水养殖虾类,因其经常遭到病原体侵染而造成巨大的经济损失,因此对日本沼虾的免疫系统中免疫机制的研究具有重要的意义。本实验室研究过一条日本沼虾硫氰酸生成酶序列(MnRHOD1),利用该序列在日本沼虾转录组中检索到4条相似序列,分别命名为MnRHOD2、MnRHOD3、MnRHOD4、MnRHOD5。本研究成功诱导并表达了日本沼虾硫氰酸生成酶MnRHOD2--MnRHOD5,并检测其对应的融合蛋白的活性,4个成功诱导表达的蛋白都有酶活特性。4条基因的表达模式各不相同,MnRHOD2、MnRHOD3、MnRHOD5基因在肝胰腺中相对表达量最高,而MnRHOD4在鳃中表达量最高;MnRHOD2、MnRHOD4、MnRHOD5这三个基因在维氏气单胞菌刺激后都呈现出上调趋势,MnRHOD3呈现出下调的趋势。为验证日本沼虾硫氰酸生成酶基因是否与氧化应激相关,我们用RNAi的方式将MnRHOD2敲低,MnRHOD2敲低后ROS(活性氧)和MDA(丙二醛)的水平都升高了。进一步在细菌中验证日本沼虾硫氰酸生成酶2是否有抗氧化性,在对抗吩嗪...
【文章来源】:河北大学河北省
【文章页数】:48 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
细胞内氧化还原平衡的示意图(Trachoothametal.,2009)
图 2 硫氰酸生成酶核酸序列及其推导的氨基酸序列 A.MnRHOD2基因 B.MnRHOD3基因 C.RHOD4 基因 D.MnRHOD5 基因Fig. 2 The nucleotide and deduced amino acid sequences of MnRHODs.2.2 硫氰酸生成酶序列的蛋白质理化性质分析序列用蛋白质分析网站(http://web.expasy.org/protparam/)对 ORF 进行理化性质分果如表 1:表 1 硫氰酸生成酶序列的蛋白质分析结果Tab. 1 The protein analysis result of rhodanase sequencesMnRHOD1 MnRHOD2 MnRHOD3 MnRHOD4 MnRHOD5ORF(bp) 351 504 453 372 471氨基酸残基117 168 151 124 157分子量12490 19183 17057 13921 17619信号肽 无 有 无 无 无理论 PI 5.38 4.96 8.9 5.27 7.71
第 2 章 日本沼虾硫氰酸生成酶基因序列生物信息学分析带负电荷氨基酸(Asp+Glu)19 30 17 21 19带正电荷氨基酸(Arg+Lys)16 22 20 17 20亚细胞定位预测 细胞质 细胞外 细胞质 细胞质 细胞质2.2.3 日本沼虾硫氰酸生成酶蛋白序列比对CLC Main Workbench 5 软件进行序列比对结果,红色框中是 6 个氨基酸的活性位点如图 3:
【参考文献】:
期刊论文
[1]青虾“软壳综合症”病原及其特性[J]. 潘晓艺,沈锦玉,李建应,贺宝祥,尹文林,郝贵杰,徐洋,姚嘉赟. 微生物学通报. 2009(10)
[2]养殖青虾“红鳃病”病原的研究[J]. 沈锦玉,钱冬,刘问,尹文林,沈智华,曹铮,吴颖蕾,张念慈. 浙江海洋学院学报(自然科学版). 2000(03)
本文编号:3075967
【文章来源】:河北大学河北省
【文章页数】:48 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
细胞内氧化还原平衡的示意图(Trachoothametal.,2009)
图 2 硫氰酸生成酶核酸序列及其推导的氨基酸序列 A.MnRHOD2基因 B.MnRHOD3基因 C.RHOD4 基因 D.MnRHOD5 基因Fig. 2 The nucleotide and deduced amino acid sequences of MnRHODs.2.2 硫氰酸生成酶序列的蛋白质理化性质分析序列用蛋白质分析网站(http://web.expasy.org/protparam/)对 ORF 进行理化性质分果如表 1:表 1 硫氰酸生成酶序列的蛋白质分析结果Tab. 1 The protein analysis result of rhodanase sequencesMnRHOD1 MnRHOD2 MnRHOD3 MnRHOD4 MnRHOD5ORF(bp) 351 504 453 372 471氨基酸残基117 168 151 124 157分子量12490 19183 17057 13921 17619信号肽 无 有 无 无 无理论 PI 5.38 4.96 8.9 5.27 7.71
第 2 章 日本沼虾硫氰酸生成酶基因序列生物信息学分析带负电荷氨基酸(Asp+Glu)19 30 17 21 19带正电荷氨基酸(Arg+Lys)16 22 20 17 20亚细胞定位预测 细胞质 细胞外 细胞质 细胞质 细胞质2.2.3 日本沼虾硫氰酸生成酶蛋白序列比对CLC Main Workbench 5 软件进行序列比对结果,红色框中是 6 个氨基酸的活性位点如图 3:
【参考文献】:
期刊论文
[1]青虾“软壳综合症”病原及其特性[J]. 潘晓艺,沈锦玉,李建应,贺宝祥,尹文林,郝贵杰,徐洋,姚嘉赟. 微生物学通报. 2009(10)
[2]养殖青虾“红鳃病”病原的研究[J]. 沈锦玉,钱冬,刘问,尹文林,沈智华,曹铮,吴颖蕾,张念慈. 浙江海洋学院学报(自然科学版). 2000(03)
本文编号:3075967
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