金钱鱼MHCⅠ类基因结构、多态性与组织表达分析及其线粒体基因组全序列分析

发布时间：2021-03-11 05:50

　　以金钱鱼为对象，利用RACE-PCR技术，克隆获得其主要组织相容性复合体I类α基因（Major histocompatibility complex，MHC I α）和β2m微球蛋白（β2m-microglobulin）基因的全长序列，并分析其基因结构、组织表达情况及MHCI α的多态性；然后，运用间隔PCR法，获得了金钱鱼的线粒体基因组全长序列。这些研究结果，既为今后探讨MHC基因多态性和抗病性的关系积累了基础资料，又丰富了鱼类的线粒体基因库。论文的主要研究结果如下：1金钱鱼MHC I α基因结构及组织表达分析运用RACE技术，首次成功克隆获得长度为2020bp的金钱鱼MHC I α基因的cDNA全长序列。该基因的开放阅读框（Opening reading frame，ORF）长1068bp，编码一个分子量为40.09KDa并由356个氨基酸组成的前体蛋白，其第1¹9位为信号肽（SP）；5’非编码区（5’-Untranslated Region，UTR）为86bp；3’UTR为866bp，含有典型的多聚腺苷酸加尾信号AATAAA及PolyA尾巴。分析表明：该序列... 

【文章来源】：上海海洋大学上海市

【文章页数】：83 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

金钱鱼

-2金钱鱼总RNA提取电泳图

经 1%电泳检测发现（图1-1-3），DNA 条带明亮清晰，拖尾状况很少，表明 DNA 纯度较高，适用后续的PCR 扩增。图 1-1-3 金钱鱼基因组 DNA 的电泳图Fig. 1-1-3 Electrophoresis results of genomic DNA extraction of the spotted scat2.3 金钱鱼 MHC I α 基因 cDNA 全长、内含子扩增与基因结构分析以金钱鱼肝脏组织的 cDNA 为模板，根据设计的兼并引物 MHC I α-F/R，PCR扩增获得长度为 315bp 的核苷酸片段，克隆、测序后，经 NCBI 的 BLAST 进行同源性分析，发现它与鲈（D. labrax L.）的 MHC I α 基因序列的同源性最高（88%）

【参考文献】：
期刊论文
[1]金钱鱼雌雄个体的形态差异分析[J]. 吴波,张敏智,邓思平,师尚丽,李广丽,朱春华.  上海海洋大学学报. 2014(01)
[2]金钱鱼性腺发育及其组织结构观察[J]. 崔丹,刘志伟,刘南希,张莹莹,张俊彬.  水产学报. 2013(05)
[3]温度对金钱鱼卵巢发育的影响[J]. 张敏智,邓思平,朱春华,李广丽.  中国水产科学. 2013(03)
[4]赤点石斑鱼MHC IA基因的克隆与表达多态性分析[J]. 沈铭辉,郑乐云,杜佳莹,王军.  厦门大学学报(自然科学版). 2013(01)
[5]红笛鲷主要组织相容性复合物Ⅰα抗原基因的克隆与表达分析[J]. 张新中,鲁义善,吴灶和,简纪常.  水产学报. 2012(10)
[6]鲢长江群体与国外移居群体间遗传变异的主要组织相容性复合体分析[J]. 冯维,刘至治,李思发,李雪松,唐文乔,杨金权.  上海海洋大学学报. 2012(05)
[7]金钱鱼幼鱼低温耐受能力和饵料营养需求的研究[J]. 宋郁,苏冒亮,刘南希,张俊彬.  上海海洋大学学报. 2012(05)
[8]圆斑星鲽MHCⅠα基因的克隆与组织表达分析[J]. 王娟,王宏伟,刘星,李宏俊,苏浩,高祥刚,赫崇波.  水产科学. 2011(08)
[9]鱼类线粒体DNA及其研究进展[J]. 陈四海,区又君,李加儿.  生物技术通报. 2011(03)
[10]团头鲂主要组织相容性复合体Ⅰ类基因全长cDNA的克隆及组织表达分析[J]. 马晓茜,刘至治,李思发,唐文乔,杨金权.  上海海洋大学学报. 2011(01)



本文编号：3075971