基于细胞色素b的中国9个大银鱼群体遗传多样性研究
发布时间：2021-03-25 20:48
大银鱼（Protosalanx hyalocranius）是东亚特有一年生小型鱼类,有河海洄游和淡水定居2种生态型,是我国重要的出口创汇鱼类。近年来受自然和人为因素影响,土著大银鱼资源枯竭,同时全国范围内广泛移植使很多水体的大银鱼来源复杂。本文测定了6水系9群体180尾大银鱼的线粒体Cytb序列,旨在了解中国大银鱼的遗传背景,为种质资源的有效保护和合理利用提供理论依据,结果如下:1、大银鱼Cytb序列全长1141bp,多态位点26个,简约信息位点16个,单倍型27个,其中单倍型1、5、6、14为优势单倍型,单倍型1在全部流域均有分布,单倍型5和单倍型6主要分布在移植区,其余局域分布。2、中国大银鱼单倍型多样性高而核苷酸多样性低（Hd=0.789±0.021,π=0.0014±0.0001）,总体遗传多样性偏低,也没有明显的谱系结构和地理结构。就土著群体而言,洄游型的辽河口、鸭绿江口和长江口群体间不存在明显分化（Fst=0.0544-0.0834,P>0.05）;长江流域陆封型巢湖和太湖群体间存在显著分化（Fst=0.1394,P<0.01）;洄游型和陆封型大银鱼不存在显著分...
【文章来源】：暨南大学广东省 211工程院校
【文章页数】：75 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
-1中国大银鱼的采样地点分布示意图（中国地图出版社，2003）
ddH2O 22.2 μL2.6.3 PCR 反应程序大银鱼线粒体各基因序列 PCR 扩增反应程序如下:94℃预变性 4min；循环 36 次，94℃变性 30s，55℃退火 30s，72℃延伸 45s；最后延伸 5min。2.6.4 琼脂糖凝胶检测PCR 扩增产物用 1%-1.2%的琼脂糖凝胶水平型电泳检测,电压为 100V,电泳时间约分钟。电泳完后将凝胶置于 EB 溶液中染色 30min,双蒸水漂洗后用凝胶成像系统观察结若电泳图谱和预期的片段大小相符，则表明本次扩增结果较为可靠。然后选择带型单规则且亮度与 DNA Marker 相当的 PCR 产物送去测序，如图 2.6.4-1。
暨南大学硕士学位论文表 3.1.1-1 大银鱼 Cytb 序列核苷酸替换率Table3.1-1 The pattern of nucleotide substitution of P. hyalocranius Cytb sequenA T C G - 3.38 3.37 26.512.53 - 8.03 1.92 2.53 7.27 - 1.92 35.08 3.38 3.73 -1.2 大银鱼 Cytb 序列的密码子偏倚性分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]大银鱼线粒体DNA细胞色素b序列的研究[J]. 肖明松,夏海武,鲍方印,康健. 安徽科技学院学报. 2014(05)
[2]基于回归分析的巢湖银鱼数量变化因素[J]. 吕云鹏,魏红晶,金梓建,陶有田. 科技视界. 2014(14)
[3]基于线粒体DNA D-loop序列分析养殖刀鲚与湖鲚的遗传多样性[J]. 徐钢春,魏广莲,李建林,徐跑,张呈祥,顾若波. 大连海洋大学学报. 2012(05)
[4]叉尾斗鱼遗传多样性的RAPD分析[J]. 刘宏毅,黎明星,肖俊,黄愉淋,张明,甘西. 大连海洋大学学报. 2012(02)
[5]3个地理群体大银鱼营养成分的分析与评价[J]. 周彦锋,徐东坡,单俊峰,尤洋. 上海海洋大学学报. 2011(05)
[6]基于四个线粒体基因片段的银鱼科鱼类系统发育[J]. 郭立,李隽,王忠锁,傅萃长. 水生生物学报. 2011(03)
[7]我国银鱼资源的分布及加工概况[J]. 胡骏,倪瑞芳,王开洋. 河北渔业. 2010(09)
[8]乔氏新银鱼基于细胞色素b序列的种群遗传结构和种群历史[J]. 赵亮,张洁,刘志瑾,许木启,李明. 生物多样性. 2010(03)
[9]太湖新银鱼线粒体D-loop和Cyt b片段序列结构与进化速率比较[J]. 赵亮,谢本贵,刘志瑾,许木启,李明. 动物学杂志. 2010(02)
[10]长江下游铜鱼线粒体DNA（mtDNA）遗传多样性的PCR-RFLP分析[J]. 张敏莹,段金荣,徐东坡,刘凯,施炜纲. 中国农学通报. 2009(22)
硕士论文
[1]银鱼科鱼类的分子系统发育研究[D]. 郭立.复旦大学 2010
[2]中国野生香鱼（Plecoglossus altivelis）遗传多样性分析[D]. 乐小亮.暨南大学 2010
[3]长江流域两种新银鱼分子生态学初步研究[D]. 史洁蔷.首都师范大学 2008
[4]大银鱼遗传多样性的研究[D]. 张颖.天津师范大学 2005
本文编号：3100304
【文章来源】：暨南大学广东省 211工程院校
【文章页数】：75 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
-1中国大银鱼的采样地点分布示意图（中国地图出版社，2003）
ddH2O 22.2 μL2.6.3 PCR 反应程序大银鱼线粒体各基因序列 PCR 扩增反应程序如下:94℃预变性 4min；循环 36 次，94℃变性 30s，55℃退火 30s，72℃延伸 45s；最后延伸 5min。2.6.4 琼脂糖凝胶检测PCR 扩增产物用 1%-1.2%的琼脂糖凝胶水平型电泳检测,电压为 100V,电泳时间约分钟。电泳完后将凝胶置于 EB 溶液中染色 30min,双蒸水漂洗后用凝胶成像系统观察结若电泳图谱和预期的片段大小相符，则表明本次扩增结果较为可靠。然后选择带型单规则且亮度与 DNA Marker 相当的 PCR 产物送去测序，如图 2.6.4-1。
暨南大学硕士学位论文表 3.1.1-1 大银鱼 Cytb 序列核苷酸替换率Table3.1-1 The pattern of nucleotide substitution of P. hyalocranius Cytb sequenA T C G - 3.38 3.37 26.512.53 - 8.03 1.92 2.53 7.27 - 1.92 35.08 3.38 3.73 -1.2 大银鱼 Cytb 序列的密码子偏倚性分析
【参考文献】：
期刊论文
[1]大银鱼线粒体DNA细胞色素b序列的研究[J]. 肖明松,夏海武,鲍方印,康健. 安徽科技学院学报. 2014(05)
[2]基于回归分析的巢湖银鱼数量变化因素[J]. 吕云鹏,魏红晶,金梓建,陶有田. 科技视界. 2014(14)
[3]基于线粒体DNA D-loop序列分析养殖刀鲚与湖鲚的遗传多样性[J]. 徐钢春,魏广莲,李建林,徐跑,张呈祥,顾若波. 大连海洋大学学报. 2012(05)
[4]叉尾斗鱼遗传多样性的RAPD分析[J]. 刘宏毅,黎明星,肖俊,黄愉淋,张明,甘西. 大连海洋大学学报. 2012(02)
[5]3个地理群体大银鱼营养成分的分析与评价[J]. 周彦锋,徐东坡,单俊峰,尤洋. 上海海洋大学学报. 2011(05)
[6]基于四个线粒体基因片段的银鱼科鱼类系统发育[J]. 郭立,李隽,王忠锁,傅萃长. 水生生物学报. 2011(03)
[7]我国银鱼资源的分布及加工概况[J]. 胡骏,倪瑞芳,王开洋. 河北渔业. 2010(09)
[8]乔氏新银鱼基于细胞色素b序列的种群遗传结构和种群历史[J]. 赵亮,张洁,刘志瑾,许木启,李明. 生物多样性. 2010(03)
[9]太湖新银鱼线粒体D-loop和Cyt b片段序列结构与进化速率比较[J]. 赵亮,谢本贵,刘志瑾,许木启,李明. 动物学杂志. 2010(02)
[10]长江下游铜鱼线粒体DNA（mtDNA）遗传多样性的PCR-RFLP分析[J]. 张敏莹,段金荣,徐东坡,刘凯,施炜纲. 中国农学通报. 2009(22)
硕士论文
[1]银鱼科鱼类的分子系统发育研究[D]. 郭立.复旦大学 2010
[2]中国野生香鱼（Plecoglossus altivelis）遗传多样性分析[D]. 乐小亮.暨南大学 2010
[3]长江流域两种新银鱼分子生态学初步研究[D]. 史洁蔷.首都师范大学 2008
[4]大银鱼遗传多样性的研究[D]. 张颖.天津师范大学 2005
本文编号：3100304
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