南大西洋可培养细菌多样性分析及其新种分类鉴定

发布时间：2021-03-26 01:17

　　深海具有高盐、高压、极酸、极碱、极冷、寡营养、少光照或无光照等特点。深海微生物的培养以及深海生物资源的获取是人类认识其环境作用、研究其功能潜力的前提。目前,人们对南大西洋深海微生物多样性及其功能的研究报道较少。本研究对采集自南大西洋的59个样品（沉积物、海水、飞鱼、斧头鱼、珊瑚等）进行了细菌的分离鉴定。为了获取更多的菌种资源,我们通过直接涂布平板分离、石油富集、重金属富集分离等方法,经过细菌单菌基因组DNA的提取,16SrRNA基因PCR扩增,16S rRNA基因PCR产物纯化及序列测定等步骤,共分离到581株不同细菌（349株由邵老师分离）,分属于6个纲90个属,其中以Alphaproteobacteria纲和Gammaproteobacteria纲为主,比例分别为40%和29%。90个属中,数量排在前十位的依次为Marinobacter属（13%）、Alcanivorax属（9%）、Erythrobacter属（7%）、Halomonas属（6%）、Sulfitobacter属（5%）、Pseudoalteromonas属（5%）、Alteromonas属（3%）、Oceanico... 

【文章来源】：厦门大学福建省 211工程院校 985工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：132 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 前言
    1.1 海洋微生物资源
    1.2 海洋微生物的重要性
    1.3 海洋细菌及其多样性
    1.4 深海可培养细菌
    1.5 深海重金属抗性细菌
    1.6 细菌的鉴定与分类
    1.7 本文的研究目的及意义
第二章 材料与方法
    2.1 实验材料
        2.1.1 样品来源
        2.1.2 培养基
        2.1.3 主要实验仪器
        2.1.4 工具酶
        2.1.5 试剂盒和试剂条
        2.1.6 常用溶液
        2.1.7 常用引物
        2.1.8 序列分析处理软件
        2.1.9 常用网址
    2.2 基本方法
        2.2.1 细菌的分离纯化
        2.2.2 细菌单菌基因组DNA的提取
        2.2.3 16S rRNA基因序列PCR反应扩增体系
        2.2.4 16S rRNA基因序列PCR扩增程序
        2.2.5 16S rRNA基因序列PCR产物纯化
    2.3 南大西洋可培养细菌的多样性分析方法
        2.3.1 南大西洋可培养细菌的富集和分离鉴定
        2.3.2 南大西洋可培养细菌的系统发育树的构建
    2.4 南大西洋可培养细菌新种的鉴定方法
        2.4.1 16S rRNA基因分析及系统发育树的构建
        2.4.2 生理生化分析
        2.4.3 化学成分分析
        2.4.4 分子生物学分析
第三章 结果与讨论
    3.1 南大西洋可培养细菌的多样性分析
        3.1.1 总菌株资源的获取情况
        3.1.2 南大西洋22航次菌株资源的获取情况
        3.1.3 南大西洋26航次菌株资源的获取情况
        3.1.4 讨论
    3.2 南大西洋可培养细菌新种的鉴定
        3.2.1 Maricoccus atlantica gen. nov. sp. nov.新属分类鉴定
T新种分类鉴定">        3.2.2 Roseivivax atlanticus 22Ⅱ-S10s^T新种分类鉴定
        3.2.3 Oceanicola atlantica sp. nov.新种分类鉴定
        3.2.4 Actibacterium atlanticus sp. nov.新种分类鉴定
T新种分类鉴定">        3.2.5 Aquimarina atlantica sp. nov. 22Ⅱ-S11-z7^T新种分类鉴定
        3.2.6 讨论
第四章 小结与展望
参考文献
附录
致谢



本文编号：3100666