太平洋中部黄鳍金枪鱼种群遗传多样性研究
发布时间：2021-03-28 23:48
黄鳍金枪鱼（Thunnus albacares）是一种高度洄游的大洋性鱼类，广泛分布于热带和亚热水的温暖水域，遍及太平洋、大西洋和印度洋。其较高的经济价值使其成为远洋渔业重要的捕捞对象，现已有研究指出，中西太平洋黄鳍金枪鱼已经处于过度捕捞的状态，呼吁对其进行合理的管理，确保太平洋黄鳍金枪鱼渔业的可持续发展。清楚认识太平洋中部黄鳍金枪鱼种群遗传现状，有助于合理提出黄鳍金枪鱼渔业资源的管理策略，实现金枪鱼渔业的可持续发展。为此，本文采用线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ（COⅠ）、线粒体细胞色素b（Cytb）基因和线粒体DNA控制区D-Loop（mtDNA D-Loop）三个分子标记对太平洋中部黄鳍金枪鱼种群遗传多样性和遗传结构做深入研究，取得以下研究结论：（1）通过对太平洋中部11个黄鳍金枪鱼采样群体203个样本研究发现，203个样本获得的203条黄鳍金枪鱼线粒体细胞色素c氧化酶Ⅰ（COⅠ）基因序列，得到38个变异位点，定义61个单倍型。序列多样性分析结果显示：11个采样群体单倍型多样指数为0.650，核苷酸多样性指数为0.00364。分子方差分析揭示了94.13%的变异来源种群内，只有5.87%...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：64 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
黄鳍金枪鱼采样位点分布图
18 图 2-2 核苷酸不配对曲线A 东部太平洋黄鳍金枪鱼核苷酸不配对曲线B 西部太平洋黄鳍金枪鱼核苷酸不配对曲线Fig2-2. Mismatch distribution for the sampling locations of T.albacoreA as mismatch distribution for the East Pacific Ocean populationB as mismatch distribution for the West Pacific Ocean population
图 2-3 黄鳍金枪鱼单倍型进化网络图Fig. 2-3 Haplotypes evolutionary network of T.albacore2.3 讨论2.3.1 群体遗传多样性合理掌握太平洋黄鳍金枪鱼种群的遗传多样性、遗传结构有助于太平洋渔业管理组织对黄鳍金枪鱼渔业管理策略的制定以及实施，而关于太平洋黄鳍金枪鱼种群遗传结构的研究，不同的学者提出不同的研究结论，为此，本文将采用线粒体 COI 基因对太平洋去黄鳍金枪鱼的种群遗传结构做合理的探讨。π 是表征群体内遗传多样性的的重要指标[71]，π 值和 h 值越大,表明种群的遗传多样性越高,也即遗传多样性越丰富[72]。但是，标记的基因以及基因序列的大小，可以导致研究群体遗传多样性和核苷酸多样性的结果[73]。表 2-2 结果显示，本研究的 11 个太平洋中部黄鳍金枪鱼群体， h =0.650±0.040 和 π = 0.00364±0.00044 具有较高的单倍型多样性和较低的核苷酸多
【参考文献】：
期刊论文
[1]南太平洋所罗门群岛海域黄鳍金枪鱼的渔业生物学特性[J]. 陈峰,郭爱,朱文斌,张洪亮,周永东,徐汉祥,徐开达. 渔业科学进展. 2013(03)
[2]基于COI部分序列探讨南海鲳属鱼类系统进化与种群遗传结构[J]. 孙鹏,尹飞,施兆鸿,彭士明. 海洋科学. 2012(06)
[3]马绍尔群岛海域和吉尔伯特群岛海域黄鳍金枪鱼生物学特性比较[J]. 宋利明,惠明明. 海洋渔业. 2012(02)
[4]长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼种群遗传结构及种群历史分析[J]. 刘至治,杨金权,王正琦,唐文乔. 动物学研究. 2009(01)
[5]3种鲳属鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化[J]. 张凤英,马凌波,施兆鸿,马春艳. 中国水产科学. 2008(03)
[6]世界主要金枪鱼类资源状况与管理[J]. 黄斌. 现代渔业信息. 2008(01)
[7]发展中西太平洋金枪鱼围网的问题与对策[J]. 王学锋,卢伙胜,颜云榕. 南方水产. 2007(06)
[8]中西太平洋金枪鱼渔业概况[J]. 张新军,杨军勇,连大军. 齐鲁渔业. 2006(07)
[9]凤鲚两群体线粒体细胞色素b基因片断多态性及进化特征[J]. 程起群,韩金娣,王云龙,卢大儒. 中国水产科学. 2006(03)
[10]藏羚羊mtDNA D-loop区遗传多样性研究[J]. 周慧,李迪强,张于光,易湘蓉,刘毅. 遗传. 2006(03)
硕士论文
[1]基于线粒体细胞色素b的3江水系草鱼群体遗传多样性分析[D]. 朱叶.暨南大学 2012
本文编号：3106474
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：64 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
黄鳍金枪鱼采样位点分布图
18 图 2-2 核苷酸不配对曲线A 东部太平洋黄鳍金枪鱼核苷酸不配对曲线B 西部太平洋黄鳍金枪鱼核苷酸不配对曲线Fig2-2. Mismatch distribution for the sampling locations of T.albacoreA as mismatch distribution for the East Pacific Ocean populationB as mismatch distribution for the West Pacific Ocean population
图 2-3 黄鳍金枪鱼单倍型进化网络图Fig. 2-3 Haplotypes evolutionary network of T.albacore2.3 讨论2.3.1 群体遗传多样性合理掌握太平洋黄鳍金枪鱼种群的遗传多样性、遗传结构有助于太平洋渔业管理组织对黄鳍金枪鱼渔业管理策略的制定以及实施，而关于太平洋黄鳍金枪鱼种群遗传结构的研究，不同的学者提出不同的研究结论，为此，本文将采用线粒体 COI 基因对太平洋去黄鳍金枪鱼的种群遗传结构做合理的探讨。π 是表征群体内遗传多样性的的重要指标[71]，π 值和 h 值越大,表明种群的遗传多样性越高,也即遗传多样性越丰富[72]。但是，标记的基因以及基因序列的大小，可以导致研究群体遗传多样性和核苷酸多样性的结果[73]。表 2-2 结果显示，本研究的 11 个太平洋中部黄鳍金枪鱼群体， h =0.650±0.040 和 π = 0.00364±0.00044 具有较高的单倍型多样性和较低的核苷酸多
【参考文献】：
期刊论文
[1]南太平洋所罗门群岛海域黄鳍金枪鱼的渔业生物学特性[J]. 陈峰,郭爱,朱文斌,张洪亮,周永东,徐汉祥,徐开达. 渔业科学进展. 2013(03)
[2]基于COI部分序列探讨南海鲳属鱼类系统进化与种群遗传结构[J]. 孙鹏,尹飞,施兆鸿,彭士明. 海洋科学. 2012(06)
[3]马绍尔群岛海域和吉尔伯特群岛海域黄鳍金枪鱼生物学特性比较[J]. 宋利明,惠明明. 海洋渔业. 2012(02)
[4]长江口及其南部邻近地区大弹涂鱼种群遗传结构及种群历史分析[J]. 刘至治,杨金权,王正琦,唐文乔. 动物学研究. 2009(01)
[5]3种鲳属鱼类线粒体COI基因序列变异及系统进化[J]. 张凤英,马凌波,施兆鸿,马春艳. 中国水产科学. 2008(03)
[6]世界主要金枪鱼类资源状况与管理[J]. 黄斌. 现代渔业信息. 2008(01)
[7]发展中西太平洋金枪鱼围网的问题与对策[J]. 王学锋,卢伙胜,颜云榕. 南方水产. 2007(06)
[8]中西太平洋金枪鱼渔业概况[J]. 张新军,杨军勇,连大军. 齐鲁渔业. 2006(07)
[9]凤鲚两群体线粒体细胞色素b基因片断多态性及进化特征[J]. 程起群,韩金娣,王云龙,卢大儒. 中国水产科学. 2006(03)
[10]藏羚羊mtDNA D-loop区遗传多样性研究[J]. 周慧,李迪强,张于光,易湘蓉,刘毅. 遗传. 2006(03)
硕士论文
[1]基于线粒体细胞色素b的3江水系草鱼群体遗传多样性分析[D]. 朱叶.暨南大学 2012
本文编号：3106474
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3106474.html
