江苏克氏原螯虾典型群体遗传多样性微卫星分析
发布时间：2021-04-16 15:57
克氏原螯虾（Procambarus clarkii）是我国重要的淡水经济甲壳类之一，江苏省是我国克氏原螯虾的主要养殖省份之一。克氏原螯虾种质资源的研究对其保护和利用、提高养殖产量、良种选育等具有重要意义。本研究共收集了江苏9个克氏原螯虾天然群体（太湖群体3个、洪泽湖群体3个、骆马湖群体1个、固城湖群体1个，长江江心镇群体1个）与1个克氏原螯虾圈养群体（盱眙满江红群体）。开发了12个克氏原螯虾的EST-SSR标记，分析了这些克氏原螯虾群体的遗传多样性和遗传结构，主要内容如下：1.克氏原螯虾EST-SSR标记筛选与分析筛选出12个克氏原螯虾微卫星标记，对60个克氏原螯虾基因组DNA进行扩增并分析其多态性水平，结果显示：12对多态性微卫星标记的等位基因数在39之间，平均观测杂合度为0.556，平均期望杂合度值为0.745。经Bonferroni校正后，12个位点均偏离Hardy-Weinberg平衡，多态信息含量（PIC）介于0.5090.875之间，所有位点均为高度多态位点，可较好地分析遗传结构和多样性，这些标记用于克氏原螯虾遗传多样性分析效果较...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：50 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
克氏原螯虾基因组DNA电泳图
10图 2-2 引物 PCSH0007、 PCSH0036、PCSH0038、PCSH0065、PCSH0077 扩增的电泳图谱Fig.4-2 Electrophoretogram of PCSH0007， PCSH0036， PCSH0038，PCSH0065， PCSH0077 locus
上海海洋大学硕士学位论文杂合度为 0.101~0.875，期望杂合度为 0.286~0.850，多态信息含量为 0.253~0.875。3 个群体中，江心镇群体平均等位基因数最大(A=5.125)，盱眙群体最小(A=4.5)；江心镇群体平均有效等位基因数最大(Ne=3.83)，盱眙群体最小(Ne=2.56)；江心镇群体平均观测杂合度(Ho=0.453)最大，西顺河群体最小(Ho=0.581)；江心镇群体平均期望杂合度(Ho=0.743)最大，盱眙群体最小(Ho=0.607)；多态信息含量均值以江心镇群体为最高(PIC=0.608)；盱眙群体最低 (PIC=0.523)；西顺河群体在两者之间(PIC=0.545)。显著性标准经 Bonferroni 校正后，利用 Hardy-Weinberg 平衡检验对 3 个群体中所有 24 个位点基因平衡状态进行检验，除西顺河群体外的 PCSH0052，3 个群体的其余 23 个位点经均偏离 Hardy-Weinberg 平衡此外，除盱眙群体的 PCSH0054位点外，其余位点组合均表现为杂合子缺失。
【参考文献】：
期刊论文
[1]24个泥蚶EST-SSR标记的开发与分析[J]. 史松富,姚韩韩,林志华,周小龙,齐晓艳,董迎辉. 海洋科学. 2013(08)
[2]翘嘴鳜养殖与野生群体及其家系的遗传多样性分析[J]. 杨凯,高银爱,丹成,曾可为,王青云,朱思华,夏儒龙,郑翠华,罗峰,程颖红,王辉,李波. 淡水渔业. 2013(03)
[3]基于公共数据库牙鲆EST-SSR的开发及特征分析[J]. 刘奕,陈伟兴,周丹,陈晓婷,王美玉,王桂兴,刘海金. 海洋渔业. 2013(02)
[4]泥蚶（Tegillarca granosa）基因组SSR和EST-SSR的开发及比较研究[J]. 周小龙,朱靖华,董迎辉,林志华,富凯立,姚韩韩,齐晓艳. 海洋与湖沼. 2013(02)
[5]中华绒螯蟹国内外群体遗传变异与适应性进化分析[J]. 成起萱,周陆,王成辉. 上海海洋大学学报. 2013(02)
[6]虾夷扇贝家系群体遗传结构及其微卫星标记与经济性状相关性的分析研究[J]. 张曼,陈蒙,姫南京. 中国农学通报. 2012(20)
[7]不同地区克氏原螯虾遗传多样性的AFLP分析[J]. 宋亮,韩晓磊,夏婵,戴伟,张建平,叶元土,徐建荣. 江苏农业学报. 2012(02)
[8]淮河安徽段日本沼虾野生群体遗传结构的微卫星分析[J]. 姜虎成,冯建彬,丁怀宇,汪桂玲,李家乐. 上海海洋大学学报. 2012(02)
[9]我国克氏原螯虾的进出口贸易实证分析与研究[J]. 王慧慧,董彦岭,苏昕,李振兴. 中国渔业经济. 2012(01)
[10]长江中下游地区6个克氏原螯虾群体遗传多样性分析[J]. 黄羽,戴银根,毕成武,胡成钰. 南昌大学学报(工科版). 2011(03)
博士论文
[1]基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究[D]. 王丽鸳.中国农业科学院 2011
[2]中国主要出口虾类的分子鉴定标记研究[D]. 吴志刚.浙江工商大学 2010
[3]中国沼虾属分子系统学及日本沼虾群体遗传结构的研究[D]. 杨频.华东师范大学 2007
硕士论文
[1]泥蚶微卫星分子标记的开发与应用及生长相关基因HDAC1的克隆[D]. 周小龙.上海海洋大学 2013
[2]鄱阳湖流域克氏原螯虾的资源状况及长江中下游克氏原螯虾遗传多样性研究[D]. 黄羽.南昌大学 2012
[3]淮河流域日本沼虾野生群体分子遗传多样性及系统演化分析[D]. 姜虎成.上海海洋大学 2012
[4]脊尾白虾微卫星引物筛选及群体遗传多样性分析[D]. 贾舒雯.中国海洋大学 2012
[5]克氏原螯虾（Procambarus clarkii）性选择及遗传多样性研究[D]. 宋亮.苏州大学 2012
[6]绒螯蟹的分子遗传变异与进化[D]. 成起萱.上海海洋大学 2011
[7]红螯螯虾（Cherax quadricarinatus）微卫星标记筛选及群体遗传学分析[D]. 谢雁南.华东师范大学 2011
[8]基于微卫星标记的克氏原螯虾遗传多样性研究[D]. 曹玲亮.安徽大学 2010
[9]长江中下游地区克氏原螯虾群体遗传多样性分析[D]. 王长忠.华中农业大学 2009
[10]用线粒体分子标记探讨中国大陆绒螯蟹种群遗传结构[D]. 张代臻.南京师范大学 2006
本文编号：3141730
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：50 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
克氏原螯虾基因组DNA电泳图
10图 2-2 引物 PCSH0007、 PCSH0036、PCSH0038、PCSH0065、PCSH0077 扩增的电泳图谱Fig.4-2 Electrophoretogram of PCSH0007， PCSH0036， PCSH0038，PCSH0065， PCSH0077 locus
上海海洋大学硕士学位论文杂合度为 0.101~0.875，期望杂合度为 0.286~0.850，多态信息含量为 0.253~0.875。3 个群体中，江心镇群体平均等位基因数最大(A=5.125)，盱眙群体最小(A=4.5)；江心镇群体平均有效等位基因数最大(Ne=3.83)，盱眙群体最小(Ne=2.56)；江心镇群体平均观测杂合度(Ho=0.453)最大，西顺河群体最小(Ho=0.581)；江心镇群体平均期望杂合度(Ho=0.743)最大，盱眙群体最小(Ho=0.607)；多态信息含量均值以江心镇群体为最高(PIC=0.608)；盱眙群体最低 (PIC=0.523)；西顺河群体在两者之间(PIC=0.545)。显著性标准经 Bonferroni 校正后，利用 Hardy-Weinberg 平衡检验对 3 个群体中所有 24 个位点基因平衡状态进行检验，除西顺河群体外的 PCSH0052，3 个群体的其余 23 个位点经均偏离 Hardy-Weinberg 平衡此外，除盱眙群体的 PCSH0054位点外，其余位点组合均表现为杂合子缺失。
【参考文献】：
期刊论文
[1]24个泥蚶EST-SSR标记的开发与分析[J]. 史松富,姚韩韩,林志华,周小龙,齐晓艳,董迎辉. 海洋科学. 2013(08)
[2]翘嘴鳜养殖与野生群体及其家系的遗传多样性分析[J]. 杨凯,高银爱,丹成,曾可为,王青云,朱思华,夏儒龙,郑翠华,罗峰,程颖红,王辉,李波. 淡水渔业. 2013(03)
[3]基于公共数据库牙鲆EST-SSR的开发及特征分析[J]. 刘奕,陈伟兴,周丹,陈晓婷,王美玉,王桂兴,刘海金. 海洋渔业. 2013(02)
[4]泥蚶（Tegillarca granosa）基因组SSR和EST-SSR的开发及比较研究[J]. 周小龙,朱靖华,董迎辉,林志华,富凯立,姚韩韩,齐晓艳. 海洋与湖沼. 2013(02)
[5]中华绒螯蟹国内外群体遗传变异与适应性进化分析[J]. 成起萱,周陆,王成辉. 上海海洋大学学报. 2013(02)
[6]虾夷扇贝家系群体遗传结构及其微卫星标记与经济性状相关性的分析研究[J]. 张曼,陈蒙,姫南京. 中国农学通报. 2012(20)
[7]不同地区克氏原螯虾遗传多样性的AFLP分析[J]. 宋亮,韩晓磊,夏婵,戴伟,张建平,叶元土,徐建荣. 江苏农业学报. 2012(02)
[8]淮河安徽段日本沼虾野生群体遗传结构的微卫星分析[J]. 姜虎成,冯建彬,丁怀宇,汪桂玲,李家乐. 上海海洋大学学报. 2012(02)
[9]我国克氏原螯虾的进出口贸易实证分析与研究[J]. 王慧慧,董彦岭,苏昕,李振兴. 中国渔业经济. 2012(01)
[10]长江中下游地区6个克氏原螯虾群体遗传多样性分析[J]. 黄羽,戴银根,毕成武,胡成钰. 南昌大学学报(工科版). 2011(03)
博士论文
[1]基于EST数据库和转录组测序的茶树DNA分子标记开发与应用研究[D]. 王丽鸳.中国农业科学院 2011
[2]中国主要出口虾类的分子鉴定标记研究[D]. 吴志刚.浙江工商大学 2010
[3]中国沼虾属分子系统学及日本沼虾群体遗传结构的研究[D]. 杨频.华东师范大学 2007
硕士论文
[1]泥蚶微卫星分子标记的开发与应用及生长相关基因HDAC1的克隆[D]. 周小龙.上海海洋大学 2013
[2]鄱阳湖流域克氏原螯虾的资源状况及长江中下游克氏原螯虾遗传多样性研究[D]. 黄羽.南昌大学 2012
[3]淮河流域日本沼虾野生群体分子遗传多样性及系统演化分析[D]. 姜虎成.上海海洋大学 2012
[4]脊尾白虾微卫星引物筛选及群体遗传多样性分析[D]. 贾舒雯.中国海洋大学 2012
[5]克氏原螯虾（Procambarus clarkii）性选择及遗传多样性研究[D]. 宋亮.苏州大学 2012
[6]绒螯蟹的分子遗传变异与进化[D]. 成起萱.上海海洋大学 2011
[7]红螯螯虾（Cherax quadricarinatus）微卫星标记筛选及群体遗传学分析[D]. 谢雁南.华东师范大学 2011
[8]基于微卫星标记的克氏原螯虾遗传多样性研究[D]. 曹玲亮.安徽大学 2010
[9]长江中下游地区克氏原螯虾群体遗传多样性分析[D]. 王长忠.华中农业大学 2009
[10]用线粒体分子标记探讨中国大陆绒螯蟹种群遗传结构[D]. 张代臻.南京师范大学 2006
本文编号：3141730
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