髭鲷属鱼类分类地位研究以及鲈形目分化时间估算

发布时间：2021-05-12 04:56

　　髭鲷属（Hapalogenys）鱼类隶属于鲈形目，鲈亚目，石鲈科，是世界性温热带近海鱼类。髭鲷属具有明显的地域分布特征，已经成为研究鱼类系统发生关系、起源与进化的良好材料，而到目前为止髭鲷属鱼类在鲈亚目中的分类地位仍然没有明确。因此，本研究测定4种鲈形目鱼类线粒体全序列，并分析其基因组编码区和非编码区序列特征，同时我们基于62条线粒体基因组全序列应用最大似然法和贝叶斯法来讨论髭鲷属在鲈亚目的分类地位问题，并结合松散分子钟推算鲈形目鱼类的起源时间，期望为鲈形目鱼类起源分化积累理论材料。主要研究结果如下：（1）本文测定4种鲈形目代表鱼类（横带髭鲷，六带线纹鱼，花瓣鯧和矛尾虾虎鱼）线粒体基因组全序列，并对其线粒体基因组进行结构分析。结果发现其线粒体基因组中碱基组成及基因排序与大多数的硬骨鱼一致，较为保守，但在横带髭鲷线粒体基因组中缺少tRNA-Pro基因。4种鱼类线粒体基因组长度差异较大，主要是由于控制区长度变化所引起的。轻链复制起始区（OL）均能形成稳定的茎环二级结构，其臂结构存在三种保守序列：5’-GCCGG-3’，5’-TCCGG-3’以及5’-GCGGG-3。多数物种识别了终止结合序... 

【文章来源】：浙江海洋大学浙江省

【文章页数】：56 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
目录
第一章 文献综述
    1.1 分子系统学研究进展
        1.1.1 分子系统学简介
        1.1.2 分子系统学发展
        1.1.3 分子系统学分析方法
        1.1.4 分子数据的特点
        1.1.5 分子钟与分子钟假说
    1.2 鱼类线粒体基因组
        1.2.1 鱼类线粒体基因组的组成和结构特点
        1.2.2 鱼类线粒体基因组的特点
        1.2.3 线粒体遗传标记在鱼类分子系统学中的应用
    1.3 髭鲷属鱼类研究概述
        1.3.1 髭鲷属鱼类简介
        1.3.2 髭鲷属鱼类系统发育关系研究进展
        1.3.3 鲈形目鱼类起源时间研究概况
    1.4 本文研究目的和意义
第二章 4种鲈形目线粒体基因组结构和特征
    2.1 实验材料和方法
        2.1.1 样品的采集与鉴定
        2.1.2 主要仪器
        2.1.3 主要试剂
        2.1.4 实验步骤
    2.2 结果
        2.2.1 横带髭鲷(Hapalogenys analis)线粒体全基因组特征
        2.2.2 花瓣鯧(Psenes pellucidus)线粒体全基因组特征
        2.2.3 六带线纹鱼(Grammi stessexlineatus)线粒体全基因组特征
        2.2.4 矛尾虾虎鱼(Chaeturichthys stigmatias)线粒体全基因组特征
    2.3 讨论
        2.3.1 4种鲈形目鱼类线粒体基因组结构分析
第三章 髭鲷属分类地位研究以及鲈形目鱼类分化时间估计
    3.1 材料与方法
        3.1.1 线粒体基因组全序列数据的获得
        3.1.2 系统发育分析
        3.1.3 分歧时间估算
    3.2 结果
        3.2.1 髭鲷属分类地位研究
    3.3 鲈形目鱼类起源时间的估算
    3.4 讨论
        3.4.1 髭鲷属系统分类地位
        3.4.2 鲈形目起源时间
总结
参考文献
致谢
在读期间发表的学术论文及研究成果


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于髭鲷属鱼类Cyt b基因全序列探讨髭鲷属在鲈总科的分类地位[J]. 徐田军,王健鑫,孙悦娜,石戈,王日昕.  动物分类学报. 2010(03)
[2]鸟类线粒体DNA结构特点及在鸟类研究中的应用[J]. 刘铸,杨春文,金建丽,金志民,戴鹏.  生物技术通报. 2009(12)
[3]中国石鲈属（鲈形目:石鲈科）鱼类一新种[J]. 田明诚.  动物分类学报. 1982(03)

硕士论文
[1]鲟形目部分种类基于线粒体COⅠ基因的分子进化研究[D]. 胡佳.华中农业大学 2010
[2]金属硫蛋白基因的分子进化分析[D]. 姬广超.东北农业大学 2010
[3]斜带石斑鱼和赤点石斑鱼线粒体基因组全序列研究[D]. 庄轩.厦门大学 2007
[4]瓢虫科部分种类基于线粒体COI基因的系统发育与食性演化研究[D]. 付景.陕西师范大学 2007



本文编号：3182774