河川沙塘鳢群体遗传多样性及其系统进化研究
发布时间：2021-05-19 06:43
河川沙塘鳢（Odontobutis potamophila）又被称为沙塘鳢、虎头鲨、呆子鱼等。该鱼作为长江中下游特色鱼类,被称为“上海世博第一鱼”。目前为止,有关河川沙塘鳢的研究多集中于生物学、生理、营养代谢、毒理实验等方面,而关于沙塘鳢属鱼类的种质资源研究较少。本文采用线粒体D-loop分子标记技术并结合核基因SRAP标记研究我国河川沙塘鳢群体遗传多样性及5种虾虎鱼类的系统进化关系,在分子层次上探讨其遗传变异水平,对河川沙塘鳢种质资源的遗传多样性进行评估,从而为河川沙塘鳢的遗传多样性监测、不同地理群体之间的遗传分化、物种保护及其人工繁殖等研究工作提供科学依据。本研究结果如下：1、基于线粒体D-loop基因序列研究不同群体河川沙塘鳢遗传多样性采用线粒体D-loop分子标记技术对河川沙塘鳢5个地理群体共150个个体（安徽省当涂（DT）30尾、江苏省射阳（SY）30尾、江苏省太湖东西山（DXS）30尾、浙江省余姚（YY）30尾、福建省闽江（MJ）30尾）进行遗传多样性分析。表明MJ群体与其他四个群体的遗传距离（0.1186-0.1223）大于其他四个群体之间的遗传距离（0.0015-0.0...
【文章来源】：南京师范大学江苏省 211工程院校
【文章页数】：70 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
1.1 河川沙塘鳢的国内外研究进展
1.1.1 河川沙塘鳢分布及其价值
1.1.2 河川沙塘鳢研究现状
1.2 遗传多样性
1.2.1 表型水平
1.2.2 细胞学水平
1.2.3 生化(蛋白质)水平
1.2.4 分子水平
1.3 虾虎鱼类系统进化分析
1.3.1 中国常见的几种虾虎鱼类介绍
1.3.2 中国产沙塘鳢属鱼类争议
1.3.3 有关虾虎鱼系统进化关系
1.4 本研究内容
1.5 本研究目的和意义
第二章 基于线粒体DNA控制区研究河川沙塘鳢的遗传多样性
2.1 实验材料和方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 实验所用试剂、仪器及其溶液配制
2.1.3 基因组DNA的提取
2.1.4 河川沙塘鳢引物的设计与合成
2.1.5 河川沙塘鳢D-loop区扩增和测序
2.1.6 实验结果分析所用软件
2.2 实验结果
2.3 讨论
第三章 利用SRAP分子标记研究河川沙塘鳢群体的遗传多样性
3.1 实验材料和方法
3.1.1 实验材料
3.1.2 基因组DNA提取
3.1.3 SRAP-PCR反应
3.1.4 数据分析
3.2 结果与分析
3.2.1 SRAP引物筛选及扩增图谱
3.2.2 群体遗传多样性分析
3.2.3 群体遗传距离和遗传相似度
3.3 讨论
第四章 基于线粒体D-loop基因序列研究我国5种虾虎鱼类的系统进化关系
4.1 实验材料和方法
4.1.1 实验材料来源
4.1.2 基因组DNA提取
4.1.3 线粒体D-loop区引物设计
4.1.4 PCR体系及反应体系
4.1.5 序列分析及系统发育树的构建
4.2 结果与分析
4.2.1 D-loop序列及其变异
4.2.2 遗传距离
4.2.3 系统树的构建
4.2.4 5种虾虎鱼线粒体DNA控制区结构
4.3 讨论
4.3.1 5种虾虎鱼类系统进化关系
4.3.2 5种虾虎鱼类线粒体DNA控制区结构
第五章 小结
5.1 本论文结论
5.2 本论文不足之处
5.3 今后工作展望
参考文献
在读期间发表的学术论文与研究成果
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]人工配合饲料养殖河川沙塘鳢试验[J]. 赵军. 水产养殖. 2013(02)
[2]太湖流域河川沙塘鳢线粒体12S和16S rRNA基因序列分析[J]. 郁建锋,韩晓磊,郭倩林,徐建荣. 江苏农业科学. 2012(12)
[3]利用SRAP标记研究四个暗纹东方鲀群体的遗传多样性[J]. 程长洪,张敏莹,刘凯,徐东坡,段金荣,周彦锋,施炜纲. 水生生物学报. 2012(05)
[4]生殖季节河川沙塘鳢雌鱼亲鱼卵巢的脂类含量及脂肪酸组成变化[J]. 朱嘉洁,李加敏,杨崴,胡先成. 河北农业科学. 2012(08)
[5]河川沙塘鳢的含肉率及肌肉营养价值分析[J]. 胡亚丽,朱晓平,尹绍武,祝斐. 江苏农业科学. 2012(07)
[6]基于SNP分子标记的凹叶木兰遗传多样性初步研究[J]. 王佳媛,吴传芳,唐亚. 广西植物. 2012(04)
[7]舟山小黄鱼线粒体DNA D-loop区序列变异的遗传多样性分析[J]. 郑文娟,来育洪,尤昕煜,秦茜晗,朱世华. 动物学研究. 2012(03)
[8]云斑尖塘鳢微卫星标记在两种虾虎鱼亚目鱼类群体间的适用性研究[J]. 祝斐,朱晓平,尹绍武,张丽娟,胡静,侯新远,胡亚丽. 海洋渔业. 2012(02)
[9]毒死蜱（CPF）对河川沙塘鳢幼鱼的急性毒性[J]. 丁正峰,薛晖,王晓丰,史阳白,李潇轩. 中国水产科学. 2012(03)
[10]河川沙塘鳢的人工繁殖与集约化苗种培育技术[J]. 赵军,盛劲东. 水产养殖. 2011(06)
硕士论文
[1]河川沙塘鳢（Odontobutis potamophila）雌鱼亲鱼营养代谢研究[D]. 朱嘉洁.重庆师范大学 2013
[2]基于线粒体DNA序列和微卫星标记分析波纹唇鱼不同地理群体的遗传多样性及遗传分化[D]. 胡静.海南大学 2012
[3]云斑尖塘鳢微卫星分子标记的开发与初步应用[D]. 朱晓平.海南大学 2012
[4]2种蝦虎鱼线粒体cytb及CR基因克隆及序列分析[D]. 相瑜.浙江海洋学院 2012
[5]乌苏里拟鲿（Pseudobagrus ussuriensis）不同群体间的遗传多样性比较研究[D]. 徐汗福.苏州大学 2011
[6]大麻哈鱼SRAP体系建立及其遗传多样性研究[D]. 张慧.东北林业大学 2011
[7]线纹尖塘鳢和云斑尖塘鳢的遗传多样性研究[D]. 陈建华.广东海洋大学 2010
[8]河川沙塘鳢细胞培养及胚胎发育研究[D]. 张君.苏州大学 2010
[9]黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）SRAP遗传图谱的构建[D]. 辛文婷.东北林业大学 2009
[10]基于形态学和分子生物学资料探讨中国沿海10种虾虎鱼类的系统发育关系[D]. 孙希福.中国海洋大学 2009
本文编号：3195316
【文章来源】：南京师范大学江苏省 211工程院校
【文章页数】：70 页
【学位级别】：硕士
【文章目录】：
摘要
Abstract
第一章 绪论
1.1 河川沙塘鳢的国内外研究进展
1.1.1 河川沙塘鳢分布及其价值
1.1.2 河川沙塘鳢研究现状
1.2 遗传多样性
1.2.1 表型水平
1.2.2 细胞学水平
1.2.3 生化(蛋白质)水平
1.2.4 分子水平
1.3 虾虎鱼类系统进化分析
1.3.1 中国常见的几种虾虎鱼类介绍
1.3.2 中国产沙塘鳢属鱼类争议
1.3.3 有关虾虎鱼系统进化关系
1.4 本研究内容
1.5 本研究目的和意义
第二章 基于线粒体DNA控制区研究河川沙塘鳢的遗传多样性
2.1 实验材料和方法
2.1.1 实验材料
2.1.2 实验所用试剂、仪器及其溶液配制
2.1.3 基因组DNA的提取
2.1.4 河川沙塘鳢引物的设计与合成
2.1.5 河川沙塘鳢D-loop区扩增和测序
2.1.6 实验结果分析所用软件
2.2 实验结果
2.3 讨论
第三章 利用SRAP分子标记研究河川沙塘鳢群体的遗传多样性
3.1 实验材料和方法
3.1.1 实验材料
3.1.2 基因组DNA提取
3.1.3 SRAP-PCR反应
3.1.4 数据分析
3.2 结果与分析
3.2.1 SRAP引物筛选及扩增图谱
3.2.2 群体遗传多样性分析
3.2.3 群体遗传距离和遗传相似度
3.3 讨论
第四章 基于线粒体D-loop基因序列研究我国5种虾虎鱼类的系统进化关系
4.1 实验材料和方法
4.1.1 实验材料来源
4.1.2 基因组DNA提取
4.1.3 线粒体D-loop区引物设计
4.1.4 PCR体系及反应体系
4.1.5 序列分析及系统发育树的构建
4.2 结果与分析
4.2.1 D-loop序列及其变异
4.2.2 遗传距离
4.2.3 系统树的构建
4.2.4 5种虾虎鱼线粒体DNA控制区结构
4.3 讨论
4.3.1 5种虾虎鱼类系统进化关系
4.3.2 5种虾虎鱼类线粒体DNA控制区结构
第五章 小结
5.1 本论文结论
5.2 本论文不足之处
5.3 今后工作展望
参考文献
在读期间发表的学术论文与研究成果
致谢
【参考文献】：
期刊论文
[1]人工配合饲料养殖河川沙塘鳢试验[J]. 赵军. 水产养殖. 2013(02)
[2]太湖流域河川沙塘鳢线粒体12S和16S rRNA基因序列分析[J]. 郁建锋,韩晓磊,郭倩林,徐建荣. 江苏农业科学. 2012(12)
[3]利用SRAP标记研究四个暗纹东方鲀群体的遗传多样性[J]. 程长洪,张敏莹,刘凯,徐东坡,段金荣,周彦锋,施炜纲. 水生生物学报. 2012(05)
[4]生殖季节河川沙塘鳢雌鱼亲鱼卵巢的脂类含量及脂肪酸组成变化[J]. 朱嘉洁,李加敏,杨崴,胡先成. 河北农业科学. 2012(08)
[5]河川沙塘鳢的含肉率及肌肉营养价值分析[J]. 胡亚丽,朱晓平,尹绍武,祝斐. 江苏农业科学. 2012(07)
[6]基于SNP分子标记的凹叶木兰遗传多样性初步研究[J]. 王佳媛,吴传芳,唐亚. 广西植物. 2012(04)
[7]舟山小黄鱼线粒体DNA D-loop区序列变异的遗传多样性分析[J]. 郑文娟,来育洪,尤昕煜,秦茜晗,朱世华. 动物学研究. 2012(03)
[8]云斑尖塘鳢微卫星标记在两种虾虎鱼亚目鱼类群体间的适用性研究[J]. 祝斐,朱晓平,尹绍武,张丽娟,胡静,侯新远,胡亚丽. 海洋渔业. 2012(02)
[9]毒死蜱（CPF）对河川沙塘鳢幼鱼的急性毒性[J]. 丁正峰,薛晖,王晓丰,史阳白,李潇轩. 中国水产科学. 2012(03)
[10]河川沙塘鳢的人工繁殖与集约化苗种培育技术[J]. 赵军,盛劲东. 水产养殖. 2011(06)
硕士论文
[1]河川沙塘鳢（Odontobutis potamophila）雌鱼亲鱼营养代谢研究[D]. 朱嘉洁.重庆师范大学 2013
[2]基于线粒体DNA序列和微卫星标记分析波纹唇鱼不同地理群体的遗传多样性及遗传分化[D]. 胡静.海南大学 2012
[3]云斑尖塘鳢微卫星分子标记的开发与初步应用[D]. 朱晓平.海南大学 2012
[4]2种蝦虎鱼线粒体cytb及CR基因克隆及序列分析[D]. 相瑜.浙江海洋学院 2012
[5]乌苏里拟鲿（Pseudobagrus ussuriensis）不同群体间的遗传多样性比较研究[D]. 徐汗福.苏州大学 2011
[6]大麻哈鱼SRAP体系建立及其遗传多样性研究[D]. 张慧.东北林业大学 2011
[7]线纹尖塘鳢和云斑尖塘鳢的遗传多样性研究[D]. 陈建华.广东海洋大学 2010
[8]河川沙塘鳢细胞培养及胚胎发育研究[D]. 张君.苏州大学 2010
[9]黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）SRAP遗传图谱的构建[D]. 辛文婷.东北林业大学 2009
[10]基于形态学和分子生物学资料探讨中国沿海10种虾虎鱼类的系统发育关系[D]. 孙希福.中国海洋大学 2009
本文编号：3195316
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