基于线粒体控制区序列的花斑蛇鲻遗传多态性分析

发布时间：2021-05-26 15:17

　　花斑蛇鲻（Sauridaundosquamis）是一种重要的底层经济鱼类,本研究利用线粒体控制区（D-loop区）序列分析了中国近海分布的花斑蛇鲻的遗传结构和遗传多样性,一共测定了6个地理群体129尾样本的D-loop区全序列。结果显示,全长为921bp的序列包含71个多态性位点,共检测到101个单倍型。花斑蛇鲻总体呈现很高的单倍型多样性（0.9873±0.0048）和较低的核苷酸多样性（0.0132±0.0067）的特征。基于邻接法构建的单倍型系统发育树的拓扑结构很浅,没有形成分化明显的支系。单倍型在各个地理群体中的分布呈分散交叉状态,表明地理群体间没有显著的遗传分化。6个群体的分子方差分析显示,花斑蛇鲻绝大部分的遗传变异（99.87%）来源于群体内的个体之间,而群体间的变异仅占0.13%。大部分地理群体之间的遗传分化指数（FST）均很小,揭示了群体间的基因交流很频繁,存在高度的遗传同质性。这些研究结果表明中国近海的花斑蛇鲻遗传多样性丰富,没有明显的遗传分化,是一个随机交配群,可以作为同一个渔业单元来管理。 

【文章来源】：热带海洋学报. 2020,39(04)北大核心CSCD

【文章页数】：8 页

【文章目录】：
1 材料与方法
    1.1 实验材料
    1.2 基因组DNA提取
    1.3 PCR扩增与测序
    1.4 数据分析
2 结果
    2.1 序列特征及遗传多样性
    2.2 单倍型系统发育关系
    2.3 种群遗传结构
3 讨论


【参考文献】：
期刊论文
[1]基于线粒体控制区的中国近海棘头梅童鱼群体遗传结构研究[J]. 梁述章,宋炜,马春艳,蒋科技,张凤英,赵明,马凌波.  海洋渔业. 2019(02)
[2]南海北部陆架水域多齿蛇鲻与花斑蛇鲻的年龄与生长[J]. 江艳娥,许友伟,范江涛,孙铭帅,杨玉滔,张魁,张俊,黄梓荣,林昭进,陈作志.  中国水产科学. 2019(01)
[3]基于线粒体DNA D-loop序列的黄斑篮子鱼群体遗传多样性分析[J]. 黄小林,李文俊,林黑着,杨育凯,李涛,虞为,黄忠.  热带海洋学报. 2018(04)
[4]南海北部近海渔业资源群落结构及其多样性现状[J]. 蔡研聪,徐姗楠,陈作志,许友伟,江艳娥,杨长平.  南方水产科学. 2018(02)
[5]南海区2种桁杆虾拖网渔获组成调查与分析[J]. 杨炳忠,杨吝,谭永光,晏磊,张鹏,李杰.  南方水产科学. 2017(06)
[6]中国近海细鳞鯻线粒体控制区的遗传多样性[J]. 杨喜书,章群,薛丹,吕金磊,黄镇宇,卢丽锋.  生态学报. 2018(05)
[7]基于线粒体控制区的中国南海海域卵形鲳鲹遗传多样性[J]. 吕金磊,章群,杨喜书,宫亚运,曹艳.  海洋渔业. 2017(03)
[8]基于线粒体控制区部分序列的南海大斑石鲈遗传多样性分析[J]. 郜星晨,章群,薛丹,宫亚运,曹艳,韩博平.  海洋科学. 2016(07)
[9]南沙南部陆架海域渔业资源声学评估[J]. 张俊,陈国宝,陈作志,于杰,范江涛,邱永松.  南方水产科学. 2015(05)
[10]南沙西南陆架海域底拖网渔获物组成及生物多样性[J]. 许友伟,陈作志,范江涛,张俊.  南方水产科学. 2015(05)



本文编号：3206598