群体感应淬灭酶YtnP对草鱼肠道菌群多样性及免疫响应调控作用的研究
发布时间：2021-06-01 21:11
群体感应及其淬灭作用是近年来在微生态领域最为重要的发现之一。微生物间通过群体感应与淬灭作用建立细胞-细胞间的通讯连接,并在微生物间生态竞争与动态平衡中发挥重要作用。目前群体感应淬灭已经成为抗细菌感染研究的热点领域。然而生物体是一个整体系统,微生物与宿主间存在复杂的相互作用关系。群体感应淬灭机制在发挥抗菌作用的同时,对肠道微生态系统的作用规律尚未知晓,亟需进行科学的研究与评价。本论文通过高通量测序与宏基因组技术,研究了外源添加群体感应淬灭酶YtnP对草鱼肠道菌群多样性及其相关功能基因的影响,揭示了群体感应淬灭作用与宿主肠道菌群间的相互关系,为其在水产养殖上应用提供理论依据。1.单一添加群体感应淬灭酶YtnP对草鱼肠道菌群的作用规律选取30条体重25±1g的草鱼随机分为两组,每组三个平行,试验组注射体积100μL浓度为25μg/m L的的重组纯化YtnP,进行了周期48h的急性试验。在试验的24 h、48 h分别采取草鱼肠道及内容物进行16S r RNA测序。结果表明对照组和试验组样品的OTU分别为142±102和143±67;试验组肠道菌群的Alpha多样性指数差异均不显著（P>0...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：93 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
用群体感应限制霍乱弧菌的定植
门分类水平的热图
上海海洋大学硕士学位论文15图2-2门水平上各肠段的优势菌群及相对丰度。分组A、B、C：(24h及48h)对照组前、中、后肠；分组D、E、F：(24h及48h)试验组前、中、后肠。Figure2-2Dominantfloraandrelativeabundanceofeachintestinalsegmentatthelevelofphylum.GroupA、B、C:(24hand48h)anteriorintestine、midintestine、posteriorintestineofcontrolgroup;GroupD、E、F:(24hand48h)anteriorintestine、midintestine、posteriorintestineoftreatmentgroup.2.2.2.2属分类水平的结果分析在属分类水平上取相对丰度最高的前10种OTU相对应的菌群进行统计分析，结果表明：对照组中优势物种为鲸杆菌属(Cetobacterium)、诺卡氏菌属(Nocardia)、未特指消化链球菌属(Unspecified_Peptostreptococcaceae)、劳森菌属(Lawsonia)、红杆菌属(Rhodobacter)、Unspecified_TM7_3、未特指根瘤菌属(Unspecified_Rhizobiales)，其他属占比不足1%。试验组中优势物种为鲸杆菌属(Cetobacterium)、诺卡氏菌属(Nocardia)、分枝杆菌属(Mycobacterium)、未特指根瘤菌属(Unspecified_Rhizobiales)、未特指的微杆菌属(Unspecified_Microbacteriaceae)、红杆菌属(Rhodobacter)、红球菌属(Rhodococcus)，其他属占比不足1%(见表2-4)。不同肠段的菌群丰度在属水平上有差异，主要表现在各组别中肠和后肠的鲸杆菌属的丰度高，前肠低；各组别前肠和中肠的诺卡氏菌属丰度高，后肠低；而对照组前肠和后肠的未特指消化链球菌属的丰度高，试验组各肠段未特指消化链球菌属丰度均较低；其余物种属水平上不同肠段的分布情况见图2-4。
【参考文献】：
期刊论文
[1]群体感应与群体淬灭控制病原菌的研究进展[J]. 李胜利,孙海洲,金鹿,桑丹,张崇志,张春华,郝永清. 中国兽医科学. 2020(01)
[2]解甘露醇罗尔斯顿菌的研究进展[J]. 袁凤丽. 临床医药实践. 2019(06)
[3]纤维单胞菌属放线菌的研究进展[J]. 石云雷,余利岩,张玉琴. 微生物学报. 2019(01)
[4]美洲大蠊肠道内生微杆菌的分离鉴定及其抑菌活性研究[J]. 刘凌燕,陈志宇,曾还雄,林培彬,金小宝. 生物技术通报. 2018(06)
[5]芬氏纤维微菌对雏鸭盲肠微生物的影响[J]. 赵玲,孙然然,朱洛毅,孙铝辉,齐德生. 饲料工业. 2016(13)
[6]益生芽孢杆菌对动物免疫功能影响研究进展[J]. 谷笑笑,王振华,潘康成. 微生物学通报. 2016(09)
[7]中华鳖致病性嗜水气单胞菌的分离鉴定及毒力因子检测[J]. 秦杨蕾,周金松,朱四东,毛芝娟,钱国英. 药物生物技术. 2015(05)
[8]嗜水气单胞菌毒力因子检测及不同毒力基因型菌株对剑尾鱼的致病性研究[J]. 任燕,孙承文,石存斌,潘厚军,陶家发,吴淑勤. 广东农业科学. 2015(17)
[9]红球菌及其生物降解作用研究进展[J]. 邱孜博,汪荣,张杨,吴茜,谢笔钧,杨季芳,陈吉刚,孙智达. 食品科学. 2016(07)
[10]鮸鱼消化道细菌群落结构及多样性初步研究[J]. 陶诗,王健鑫,刘雪珠,何芳芳,俞凯成. 南方水产科学. 2013(04)
博士论文
[1]淬灭酶及沙蒿多糖对绵羊瘤胃微生态和营养代谢及免疫影响研究[D]. 李胜利.内蒙古农业大学 2016
硕士论文
[1]地衣芽孢杆菌T-1群体感应淬灭基因ytnP的克隆表达及其功能研究[D]. 彭孟凡.上海海洋大学 2018
[2]肠道菌群群体感应抑制剂协同解毒祛瘀滋阴方治疗MRL/lpr小鼠的作用研究[D]. 谢朵丽.浙江中医药大学 2018
[3]感染嗜水气单胞菌草鱼肠道菌群结构研究[D]. 李东亮.西北农林科技大学 2016
本文编号：3210160
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：93 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
用群体感应限制霍乱弧菌的定植
门分类水平的热图
上海海洋大学硕士学位论文15图2-2门水平上各肠段的优势菌群及相对丰度。分组A、B、C：(24h及48h)对照组前、中、后肠；分组D、E、F：(24h及48h)试验组前、中、后肠。Figure2-2Dominantfloraandrelativeabundanceofeachintestinalsegmentatthelevelofphylum.GroupA、B、C:(24hand48h)anteriorintestine、midintestine、posteriorintestineofcontrolgroup;GroupD、E、F:(24hand48h)anteriorintestine、midintestine、posteriorintestineoftreatmentgroup.2.2.2.2属分类水平的结果分析在属分类水平上取相对丰度最高的前10种OTU相对应的菌群进行统计分析，结果表明：对照组中优势物种为鲸杆菌属(Cetobacterium)、诺卡氏菌属(Nocardia)、未特指消化链球菌属(Unspecified_Peptostreptococcaceae)、劳森菌属(Lawsonia)、红杆菌属(Rhodobacter)、Unspecified_TM7_3、未特指根瘤菌属(Unspecified_Rhizobiales)，其他属占比不足1%。试验组中优势物种为鲸杆菌属(Cetobacterium)、诺卡氏菌属(Nocardia)、分枝杆菌属(Mycobacterium)、未特指根瘤菌属(Unspecified_Rhizobiales)、未特指的微杆菌属(Unspecified_Microbacteriaceae)、红杆菌属(Rhodobacter)、红球菌属(Rhodococcus)，其他属占比不足1%(见表2-4)。不同肠段的菌群丰度在属水平上有差异，主要表现在各组别中肠和后肠的鲸杆菌属的丰度高，前肠低；各组别前肠和中肠的诺卡氏菌属丰度高，后肠低；而对照组前肠和后肠的未特指消化链球菌属的丰度高，试验组各肠段未特指消化链球菌属丰度均较低；其余物种属水平上不同肠段的分布情况见图2-4。
【参考文献】：
期刊论文
[1]群体感应与群体淬灭控制病原菌的研究进展[J]. 李胜利,孙海洲,金鹿,桑丹,张崇志,张春华,郝永清. 中国兽医科学. 2020(01)
[2]解甘露醇罗尔斯顿菌的研究进展[J]. 袁凤丽. 临床医药实践. 2019(06)
[3]纤维单胞菌属放线菌的研究进展[J]. 石云雷,余利岩,张玉琴. 微生物学报. 2019(01)
[4]美洲大蠊肠道内生微杆菌的分离鉴定及其抑菌活性研究[J]. 刘凌燕,陈志宇,曾还雄,林培彬,金小宝. 生物技术通报. 2018(06)
[5]芬氏纤维微菌对雏鸭盲肠微生物的影响[J]. 赵玲,孙然然,朱洛毅,孙铝辉,齐德生. 饲料工业. 2016(13)
[6]益生芽孢杆菌对动物免疫功能影响研究进展[J]. 谷笑笑,王振华,潘康成. 微生物学通报. 2016(09)
[7]中华鳖致病性嗜水气单胞菌的分离鉴定及毒力因子检测[J]. 秦杨蕾,周金松,朱四东,毛芝娟,钱国英. 药物生物技术. 2015(05)
[8]嗜水气单胞菌毒力因子检测及不同毒力基因型菌株对剑尾鱼的致病性研究[J]. 任燕,孙承文,石存斌,潘厚军,陶家发,吴淑勤. 广东农业科学. 2015(17)
[9]红球菌及其生物降解作用研究进展[J]. 邱孜博,汪荣,张杨,吴茜,谢笔钧,杨季芳,陈吉刚,孙智达. 食品科学. 2016(07)
[10]鮸鱼消化道细菌群落结构及多样性初步研究[J]. 陶诗,王健鑫,刘雪珠,何芳芳,俞凯成. 南方水产科学. 2013(04)
博士论文
[1]淬灭酶及沙蒿多糖对绵羊瘤胃微生态和营养代谢及免疫影响研究[D]. 李胜利.内蒙古农业大学 2016
硕士论文
[1]地衣芽孢杆菌T-1群体感应淬灭基因ytnP的克隆表达及其功能研究[D]. 彭孟凡.上海海洋大学 2018
[2]肠道菌群群体感应抑制剂协同解毒祛瘀滋阴方治疗MRL/lpr小鼠的作用研究[D]. 谢朵丽.浙江中医药大学 2018
[3]感染嗜水气单胞菌草鱼肠道菌群结构研究[D]. 李东亮.西北农林科技大学 2016
本文编号：3210160
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