4个瓦氏黄颡鱼群体遗传多样性的微卫星分析
发布时间：2021-06-23 06:05
为研究嘉陵江、沅江、汉水、赣江4个不同地区瓦氏黄颡鱼群体的遗传多样性及亲缘关系,随机选取80个微卫星位点对来自4个群体的127尾个体进行PCR扩增,成功扩增出48对微卫星引物,筛选得到25个多态性微卫星位点。测得的遗传多样性度量结果表明,4个群体的等位基因数为2～18,平均有效等位基因数2.383～3.578,平均观测杂合度0.460～0.581,平均期望杂合度0.487～0.674,平均多态信息含量0.431～0.627。嘉陵江、沅江、汉水、赣江4个瓦氏黄颡鱼群体表现为高度多态的位点分别为9、11、23、21个,中度多态的位点分别为12、11、3、5个。通过计算4个瓦氏黄颡鱼群体间的遗传相似系数和遗传距离,并构建进化树,发现赣江群体单独聚为一类,嘉陵江、沅江和汉水群体聚为一类,其中,在嘉陵江、沅江和汉水群体这个分支中,沅江和汉水群体聚为一类。用Structure 2.3.4软件对4个瓦氏黄颡鱼群体进行贝叶斯聚类分析验证,结果与进化树分析的结果一致。本研究利用微卫星标记对4个瓦氏黄颡鱼群体进行遗传评估,研究结果可为长江流域瓦氏黄颡鱼的保护、监测和遗传育种提供分子基础资料。
【文章来源】：水产科学. 2020,39(05)北大核心CSCD
【文章页数】：12 页
【部分图文】：
4个瓦氏黄颡鱼群体的地理位置
分子方差分析结果(表5)表明,群体中有31.04%(P<0.01)的遗传变异来自于群体间,68.96%(P<0.01)的遗传变异来自于群体内,表明遗传变异大部分存在于个体之间,群体内的遗传变异大于群体间的遗传变异。4个瓦氏黄颡鱼群体间的遗传分化指数为0.1613～0.4020(表6),属于较高水平遗传分化(遗传分化指数>0.15)。其中嘉陵江瓦氏黄颡鱼群体和赣江瓦氏黄颡鱼群体之间的遗传分化水平最低,遗传分化指数0.1613,属于较大程度的分化(0.15<遗传分化指数<0.25)。而嘉陵江瓦氏黄颡鱼群体和汉水瓦氏黄颡鱼群体之间遗传分化水平最高,遗传分化指数0.4020,两者间的分化程度极大(遗传分化指数>0.25)(表6)。利用Structure 2.3.4软件对4个瓦氏黄颡鱼群体25个微卫星座位等位基因数据进行贝叶斯聚类分析与遗传结构推导分析(图3)。按照文献[13]计算最优K值的方法,得到当K=3时,沅江和汉水群体在遗传结构上相似,可为一类;嘉陵江和赣江各为一类。
利用Structure 2.3.4软件对4个瓦氏黄颡鱼群体25个微卫星座位等位基因数据进行贝叶斯聚类分析与遗传结构推导分析(图3)。按照文献[13]计算最优K值的方法,得到当K=3时,沅江和汉水群体在遗传结构上相似,可为一类;嘉陵江和赣江各为一类。3 讨 论
【参考文献】：
期刊论文
[1]广西稻田养殖金边鲤群体遗传多样性分析[J]. 甘宝江,张盛,韦玲静,黄杰,莫洁琳,甘习军,滕忠作,叶香尘. 水产科学. 2019(05)
[2]杂交黄颡鱼（黄颡鱼♀×瓦氏黄颡鱼♂）及其双亲遗传多样性的微卫星分析[J]. 张佳佳,李杰,张国松,王涛,尹绍武,唐忠林,茆健强,王若然. 水产科学. 2018(05)
[3]普通黄颡鱼、瓦氏黄颡鱼及其杂种一代遗传特征的微卫星分析[J]. 李景芬,采克俊,公翠萍,王曙,周志金. 江苏农业科学. 2018(07)
[4]大口黑鲈LPL基因SNPs及其与适应人工配合饲料能力的相关性研究[J]. 马冬梅,朱择敏,白俊杰,全迎春,樊佳佳,田园园,廖国礼,梁旭方. 农业生物技术学报. 2018(01)
[5]长江中下游湖泊和云南抚仙湖黄颡鱼群体遗传结构研究[J]. 刘红艳,陈校辉,熊飞. 华中师范大学学报(自然科学版). 2016(02)
[6]微卫星分析鲤鱼杂交系F2代家系群体遗传多样性[J]. 陈子桂,王培培,廖愚,覃俊奇,袁宗伟,叶香尘,吕业坚. 水产科技情报. 2016(02)
[7]仿刺参中国群体与韩国群体杂交子代微卫星标记分析[J]. 王鹤,王田田,胡丽萍,赵强,孙国华,孙灵毅. 水产科学. 2016(01)
[8]利用微卫星标记分析3个暗纹东方鲀（Takifugu obscurus）养殖群体的遗传多样性[J]. 邹杰,马爱军,赵艳飞,何伟国,王婷,岳亮,刘大勇,郭正龙. 渔业科学进展. 2015(02)
[9]河川沙塘鳢、鸭绿沙塘鳢及其杂交子代的微卫星分析[J]. 张丽娟,祝斐,尹绍武,张亚萍,侯新远,胡亚丽. 淡水渔业. 2014(05)
[10]卵形鲳鲹育种群体遗传多样性分析[J]. 孙立元,郭华阳,朱彩艳,马振华,江世贵,张殿昌. 南方水产科学. 2014(02)
硕士论文
[1]黄颡鱼微卫星标记的筛选及群体遗传多样性分析[D]. 孔艺.华中农业大学 2011
本文编号：3244391
【文章来源】：水产科学. 2020,39(05)北大核心CSCD
【文章页数】：12 页
【部分图文】：
4个瓦氏黄颡鱼群体的地理位置
分子方差分析结果(表5)表明,群体中有31.04%(P<0.01)的遗传变异来自于群体间,68.96%(P<0.01)的遗传变异来自于群体内,表明遗传变异大部分存在于个体之间,群体内的遗传变异大于群体间的遗传变异。4个瓦氏黄颡鱼群体间的遗传分化指数为0.1613～0.4020(表6),属于较高水平遗传分化(遗传分化指数>0.15)。其中嘉陵江瓦氏黄颡鱼群体和赣江瓦氏黄颡鱼群体之间的遗传分化水平最低,遗传分化指数0.1613,属于较大程度的分化(0.15<遗传分化指数<0.25)。而嘉陵江瓦氏黄颡鱼群体和汉水瓦氏黄颡鱼群体之间遗传分化水平最高,遗传分化指数0.4020,两者间的分化程度极大(遗传分化指数>0.25)(表6)。利用Structure 2.3.4软件对4个瓦氏黄颡鱼群体25个微卫星座位等位基因数据进行贝叶斯聚类分析与遗传结构推导分析(图3)。按照文献[13]计算最优K值的方法,得到当K=3时,沅江和汉水群体在遗传结构上相似,可为一类;嘉陵江和赣江各为一类。
利用Structure 2.3.4软件对4个瓦氏黄颡鱼群体25个微卫星座位等位基因数据进行贝叶斯聚类分析与遗传结构推导分析(图3)。按照文献[13]计算最优K值的方法,得到当K=3时,沅江和汉水群体在遗传结构上相似,可为一类;嘉陵江和赣江各为一类。3 讨 论
【参考文献】：
期刊论文
[1]广西稻田养殖金边鲤群体遗传多样性分析[J]. 甘宝江,张盛,韦玲静,黄杰,莫洁琳,甘习军,滕忠作,叶香尘. 水产科学. 2019(05)
[2]杂交黄颡鱼（黄颡鱼♀×瓦氏黄颡鱼♂）及其双亲遗传多样性的微卫星分析[J]. 张佳佳,李杰,张国松,王涛,尹绍武,唐忠林,茆健强,王若然. 水产科学. 2018(05)
[3]普通黄颡鱼、瓦氏黄颡鱼及其杂种一代遗传特征的微卫星分析[J]. 李景芬,采克俊,公翠萍,王曙,周志金. 江苏农业科学. 2018(07)
[4]大口黑鲈LPL基因SNPs及其与适应人工配合饲料能力的相关性研究[J]. 马冬梅,朱择敏,白俊杰,全迎春,樊佳佳,田园园,廖国礼,梁旭方. 农业生物技术学报. 2018(01)
[5]长江中下游湖泊和云南抚仙湖黄颡鱼群体遗传结构研究[J]. 刘红艳,陈校辉,熊飞. 华中师范大学学报(自然科学版). 2016(02)
[6]微卫星分析鲤鱼杂交系F2代家系群体遗传多样性[J]. 陈子桂,王培培,廖愚,覃俊奇,袁宗伟,叶香尘,吕业坚. 水产科技情报. 2016(02)
[7]仿刺参中国群体与韩国群体杂交子代微卫星标记分析[J]. 王鹤,王田田,胡丽萍,赵强,孙国华,孙灵毅. 水产科学. 2016(01)
[8]利用微卫星标记分析3个暗纹东方鲀（Takifugu obscurus）养殖群体的遗传多样性[J]. 邹杰,马爱军,赵艳飞,何伟国,王婷,岳亮,刘大勇,郭正龙. 渔业科学进展. 2015(02)
[9]河川沙塘鳢、鸭绿沙塘鳢及其杂交子代的微卫星分析[J]. 张丽娟,祝斐,尹绍武,张亚萍,侯新远,胡亚丽. 淡水渔业. 2014(05)
[10]卵形鲳鲹育种群体遗传多样性分析[J]. 孙立元,郭华阳,朱彩艳,马振华,江世贵,张殿昌. 南方水产科学. 2014(02)
硕士论文
[1]黄颡鱼微卫星标记的筛选及群体遗传多样性分析[D]. 孔艺.华中农业大学 2011
本文编号：3244391
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