卵形鲳鲹MHCⅡβ和GILT基因的表达调控及其多态性与抗菌性状的关联分析

发布时间：2021-06-28 23:53

　　卵形鲳鲹（Trachinotus ovatus）肉质鲜美,生长速度快,可摄食人工配合饲料,是我国热带、亚热带海域重要的网箱养殖鱼类之一。然而近年来由于病害频发,给卵形鲳鲹养殖产业造成了极大的经济损失。因此,研究卵形鲳鲹免疫基因与抗病性状关联性,确定免疫分子标记,建立免疫防控技术,对支撑卵形鲳鲹养殖产业的健康发展具有重要意义。本研究从实验室前期测序获得的卵形鲳鲹基因组和转录组数据库中获取了主要组织相容性复合体Ⅱβ（majorhistocompatibility complexⅡβ,MHCⅡβ）和γ-干扰素诱导的溶酶体巯基还原酶（interferon-γ-inducible lysosomal thiol reductase,GILT）的部分序列,利用RACE技术克隆获得MHCⅡβ和GILT基因cDNA全序列,以此为基础比对基因组数据库,获得了MHCⅡβ和GILT基因组全序列,分析了其组织表达和细菌感染前后表达谱特征,筛选了基因多态性位点,分析了基因多态性与抗菌性状的相关性,取得的主要结果如下:一、卵形鲳鲹MHCⅡβ表达调控及其基因多态性与抗菌性状的关联分析结论:ToMHCⅡβcDNA全长... 

【文章来源】：上海海洋大学上海市

【文章页数】：90 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
ABSTRACT
前言
    1.1 卵形鲳鲹简介
        1.1.1 卵形鲳鲹形态特征及生活习性简介
        1.1.2 卵形鲳鲹研究进展
    1.2 鱼类的免疫防御
        1.2.1 免疫器官和组织
        1.2.2 免疫细胞
        1.2.3 体液免疫因子
    1.3 主要组织相容性复合体(MHC)
        1.3.1 主要组织相容性复合体简介
        1.3.2 MHC基因功能结构
    1.4 MHC基因的遗传变异与鱼类抗病性
        1.4.1 MHC基因的遗传变异
    1.5 Γ-干扰素诱导的溶酶体巯基还原酶(GILT)
        1.5.1 溶酵体简介
        1.5.2 Γ-干扰素简介
        1.5.3 GILT的发现
        1.5.4 GILT在MHCⅡ类抗原加工中的作用
        1.5.5 GILT的活性特征
        1.5.6 GILT研究概况和发展趋势
    1.6 研究目的、意义及技术路线
        1.6.1 研究目的与意义
        1.6.2 技术方案
第二章 卵形鲳鲹MHCⅡB基因的表达调控及其多态性与抗菌性状的关联分析
    2.1 实验材料
        2.1.1 实验菌种
        2.1.2 实验用鱼
        2.1.3 实验仪器
        2.1.4 实验试剂与配制
    2.2 实验用品预处理
        2.2.1 实验动物处理及取样
        2.2.2 卵形鲳鲹总RNA提取
        2.2.3 卵形鲳鲹CDNA的合成
        2.2.4 TOMHCⅡB基因CDNA全长的克隆
        2.2.5 TOMHCⅡΒ 基因序列分析
        2.2.6 TOMHCⅡΒ 基因表达分析
    2.3 TOMHCⅡΒ 基因多态性
        2.3.1 卵形鲳鲹基因组DNA的提取
        2.3.2 基因克隆链接转化
    2.4 结果与分析
        2.4.1 TOMHCⅡΒ 的CDNA序列特征
        2.4.2 TOMHCⅡΒ 基因系统进化分析
        2.4.3 MHCⅡΒ 基因组结构比较
        2.4.4 TOMHCⅡΒMRNA组织表达分析
        2.4.5 TOMHCⅡΒ MRNA的时空表达
        2.4.6 美人鱼发光杆菌感染卵形鲳鲹
        2.4.7 DNA提取结果和测序分析
        2.4.8 TOMHCⅡΒ 基因的多态性分析
        2.4.9 TOMHCⅡΒ 基因与美人鱼发光杆菌易感性/抗性的关联性分析
    2.5 讨论
第三章 卵形鲳鲹GILT基因的表达调控及其多态性与抗菌性状的关联分析
    3.1 实验材料
        3.1.1 实验菌种
        3.1.2 实验用鱼
        3.1.3 实验仪器
        3.1.4 实验试剂与配制
    3.2 实验用品预处理
        3.2.1 实验动物处理及取样
        3.2.2 总RNA提取卵形鲳鲹RNA的提取
        3.2.3 卵形鲳鲹CDNA的合成
        3.2.4 TOGILT基因CDNA全长的克隆
        3.2.5 TOGILT基因序列分析
        3.2.6 TOGILT基因表达分析
    3.3 结果与分析
        3.3.1 TOGILT的DNA序列特征
        3.3.2 TOGILT基因系统进化分析
        3.3.3 TOGILT基因组结构比较
        3.3.4 TOGILT MRNA组织表达分析
        3.3.5 TOGILT MRNA的时空表达
        3.3.6 美人鱼发光杆菌感染卵形鲳鲹
        3.3.7 DNA提取结果和测序分析
        3.3.8 TOGILT基因SNP位点分析
        3.3.9 TOGILT基因型与美人鱼发光杆菌易感性/抗性的关联性分析
    3.4 讨论
小结
参考文献
附录
致谢


【参考文献】：
期刊论文
[1]亚麻酸对卵形鲳鲹幼鱼生长性能、消化酶活性及抗氧化能力的影响[J]. 戚常乐,林黑着,黄忠,周传朋,杨育凯,虞为,赵书燕.  南方水产科学. 2016(06)
[2]不同糖源饲料对卵形鲳鲹（Trachinotus ovatus）生长、体组成、血糖水平和肝脏糖酵解酶活力的影响[J]. 董兰芳,张琴,程光平,许明珠,童潼,熊向英.  渔业科学进展. 2016(05)
[3]石斑鱼（Epinephelus coioides）MHC基因多态性及其与虹彩病毒抗性的关联分析（英文）[J]. 杨敏,魏京广,李鹏飞,魏世娜,黄友华,秦启伟.  Science Bulletin. 2016(09)
[4]金钱鱼MHC Ⅱ β基因结构、多态性与组织表达分析[J]. 王晓冰,刘至治,李强,张璐菲,张俊彬.  中国水产科学. 2016(01)
[5]大黄鱼在感染刺激隐核虫后MHC IIB基因的表达[J]. 陈健,张东玲,叶坤,王志勇.  安徽农业科学. 2015(07)
[6]尼罗罗非鱼MHC Ⅰα全长cDNA的克隆、多态性及组织表达特征[J]. 黎建平,高风英,卢迈新,曹建萌,朱华平,可小丽,刘志刚.  中国水产科学. 2014(06)
[7]卵形鲳鲹尾部骨骼胚后发育研究[J]. 郑攀龙,马振华,郭华阳,李有宁,张殿昌,江世贵.  南方水产科学. 2014(05)
[8]饲料中硒酵母添加水平对卵形鲳鲹生长、食物利用及鱼体组成的影响[J]. 吴玉波,韩华,王岩.  饲料工业. 2013(12)
[9]卵形鲳鲹的营养需求研究及其配合饲料研发[J]. 唐媛媛,张蕉南,艾春香,胡兵.  饲料工业. 2013(08)
[10]卵形鲳鲹主要病害及其研究进展[J]. 夏立群,黄郁葱,鲁义善.  安徽农学通报(上半月刊). 2012(23)

博士论文
[1]草鱼MHC相关多肽与肿瘤坏死因子受体相关因子的克隆及其表达分析[D]. 徐在言.中国科学院研究生院（水生生物研究所） 2007
[2]重要海水养殖鱼类MHCⅡ基因克隆、表达及多态性分析[D]. 张玉喜.中国海洋大学 2006

硕士论文
[1]卵形鲳鲹ToPrx1和ToTrx1基因的特征和功能研究[D]. 王龙.上海海洋大学 2015
[2]兴国红鲤和荷包红鲤MHC Ⅱ类基因多态性、表达及其与鱼体抗病力关系的分析[D]. 刘俊.上海海洋大学 2014
[3]草鱼MHC II B和组织蛋白酶D基因的克隆、表达及多态性分析[D]. 董忠典.山东农业大学 2013
[4]尼罗罗非鱼MHCII类基因的克隆与表达特征及多态性研究[D]. 庞纪彩.上海海洋大学 2013
[5]罗非鱼T淋巴细胞几种标志基因的克隆及表达研究[D]. 刘冬.西南大学 2012
[6]建鲤MHC基因的克隆与序列分析[D]. 周凯.南京农业大学 2010
[7]大菱鲆受哈维氏弧菌感染后的基因差异表达研究[D]. 王传娟.中国海洋大学 2007



本文编号：3255284