中国东南沿海地区球状伪镖水蚤种群遗传多样性及遗传结构研究
发布时间：2021-08-15 07:14
为了探究球状伪镖水蚤群体的遗传多样性及其遗传结构,本研究以线粒体细胞色素氧化酶Ⅰ（mtCOⅠ）基因作为分子标记,提取了中国东南沿海地区5个采样点135只球状伪镖水蚤个体的基因组DNA并进行分析。结果表明:在获得的580bp的COⅠ基因序列中,碱基A+T的平均含量为63.4%,明显高于G+C的含量（36.6%）,显示出较强的AT偏好性。5个采样群体共检测到49个多态位点和38个单倍型,单倍型多样性指数（h:0.6285—0.9214）和核苷酸多样性指数（π:0.00766—0.02010）均处于较高水平,各群体之间遗传距离为0.009—0.031。系统进化树和单倍型网络图显示:5个采样群体聚成多个支系;除广州与顺德、上海与无锡以外,其他各采样群体之间均具有显著遗传分化; 5个采样群体可以划分为3个种群。中性检验和核苷酸不配对分布显示,各种群均未经历过种群扩张事件。
【文章来源】：海洋与湖沼. 2020,51(06)北大核心CSCD
【文章页数】：9 页
【图文】：
球状伪镖水蚤COⅠ单倍型网络图
球状伪镖水蚤核苷酸不配对分布
本研究中,球状伪镖水蚤mt COⅠ序列的碱基组成显示出较强的AT偏好性(63.4%),与其他桡足类的mt COⅠ基因序列碱基组成特点相同(Huang et al,2014;王兴霞等,2018;王博文等,2019a,b)。在部分鱼类、双壳类和介形类中,COⅠ碱基组成同样也显示出较强的AT偏好性(沈玉帮等,2011;刘连为等,2013;Xu et al,2019)。AT碱基的占比与线粒体DNA进化地位的高低呈正相关(Folmer et al,1994),球状伪镖水蚤的A+T碱基占比高达63.4%,表明其具有较明显的进化优势,这与本研究球状伪镖水蚤高度遗传分化的结果相一致。五个采样群体的单倍型多样性指数在0.6285—0.9214之间,核苷酸多样性指数π在0.00766—0.02010之间,各群体遗传多样性均处于较高水平(表3)。从生物学和生态学的角度来说,维持自然种群较高的遗传多样性需要有大的有效种群、环境异质性以及适于群体快速增长的生活环境作为基础;从历史进化的角度看,种群的高遗传多样性特征通常是由一个大而稳定的有效种群经过长时间进化所产生(Nei,1987)。球状伪镖水蚤在中国东南沿海地区的湖泊、池塘及河流中分布很广,表明其对环境有较强的适应能力,同时广阔的生境使其面临较小的自然选择压力。这些合适的环境条件及自身因素可能是球状伪镖水蚤各群体维持较高的遗传多样性的主要原因。图2 球状伪镖水蚤COⅠ单倍型网络图
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于Cyt b基因的雅鲁藏布江下游墨脱江段及察隅河墨脱裂腹鱼的遗传多样性及种群历史动态分析[J]. 俞丹,张智,张健,林鹏程,熊淑蓉,唐芬莲,刘焕章. 水生生物学报. 2019(05)
[2]九龙江口伪镖水蚤科一新种——沈氏伪镖水蚤[J]. 王博文,郭东晖. 海洋学报. 2019(06)
[3]基于F型mtDNA D-Loop的厚壳贻贝（Mytiluscoruscus）群体遗传多样性研究[J]. 刘硕博,唐祖蓉,申望,叶莹莹,陈晓磊,祁鹏志,郭宝英. 海洋与湖沼. 2019(02)
[4]厦门湾伪镖水蚤科一新种——郑氏伪镖水蚤[J]. 王博文,郭东晖. 厦门大学学报(自然科学版). 2019(03)
[5]基于COⅠ基因序列的长腹剑水蚤系统进化关系[J]. 王兴霞,徐磊,王亮根,陈骁,郑媛媛,王雪辉,杜飞雁. 海洋学报. 2018(06)
[6]基于mtDNACytb基因序列的我国不同水系野生鲇种群遗传多样性与种群历史分析[J]. 徐丹丹,黄燕,曾庆,李斌,彭作刚. 水产学报. 2017(10)
[7]乌鳢群体遗传多样性和遗传结构分析[J]. 周伟,高天翔,王俊,宋娜. 水产学报. 2017(10)
[8]基于线粒体COI序列的洪泽湖河蚬（Corbicula fluminea）遗传多样性和种群结构分析[J]. 李大命,张彤晴,唐晟凯,钟立强,刘小维. 海洋与湖沼. 2015(06)
[9]Molecular phylogeography and population genetic structure of the planktonic copepod Calanus sinicus Brodsky in the coastal waters of China[J]. HUANG Yousong,LIU Guangxing,CHEN Xiaofeng. Acta Oceanologica Sinica. 2014(10)
[10]不同地理群体乌鳢线粒体DNA控制区结构分析及遗传多样性[J]. 董新培,穆淑梅,周楠,康现江,罗青,白俊杰. 水产学报. 2014(09)
硕士论文
[1]中国东南9种伪镖水蚤的形态学与系统发育学研究[D]. 王博文.厦门大学 2019
本文编号：3344074
【文章来源】：海洋与湖沼. 2020,51(06)北大核心CSCD
【文章页数】：9 页
【图文】：
球状伪镖水蚤COⅠ单倍型网络图
球状伪镖水蚤核苷酸不配对分布
本研究中,球状伪镖水蚤mt COⅠ序列的碱基组成显示出较强的AT偏好性(63.4%),与其他桡足类的mt COⅠ基因序列碱基组成特点相同(Huang et al,2014;王兴霞等,2018;王博文等,2019a,b)。在部分鱼类、双壳类和介形类中,COⅠ碱基组成同样也显示出较强的AT偏好性(沈玉帮等,2011;刘连为等,2013;Xu et al,2019)。AT碱基的占比与线粒体DNA进化地位的高低呈正相关(Folmer et al,1994),球状伪镖水蚤的A+T碱基占比高达63.4%,表明其具有较明显的进化优势,这与本研究球状伪镖水蚤高度遗传分化的结果相一致。五个采样群体的单倍型多样性指数在0.6285—0.9214之间,核苷酸多样性指数π在0.00766—0.02010之间,各群体遗传多样性均处于较高水平(表3)。从生物学和生态学的角度来说,维持自然种群较高的遗传多样性需要有大的有效种群、环境异质性以及适于群体快速增长的生活环境作为基础;从历史进化的角度看,种群的高遗传多样性特征通常是由一个大而稳定的有效种群经过长时间进化所产生(Nei,1987)。球状伪镖水蚤在中国东南沿海地区的湖泊、池塘及河流中分布很广,表明其对环境有较强的适应能力,同时广阔的生境使其面临较小的自然选择压力。这些合适的环境条件及自身因素可能是球状伪镖水蚤各群体维持较高的遗传多样性的主要原因。图2 球状伪镖水蚤COⅠ单倍型网络图
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于Cyt b基因的雅鲁藏布江下游墨脱江段及察隅河墨脱裂腹鱼的遗传多样性及种群历史动态分析[J]. 俞丹,张智,张健,林鹏程,熊淑蓉,唐芬莲,刘焕章. 水生生物学报. 2019(05)
[2]九龙江口伪镖水蚤科一新种——沈氏伪镖水蚤[J]. 王博文,郭东晖. 海洋学报. 2019(06)
[3]基于F型mtDNA D-Loop的厚壳贻贝（Mytiluscoruscus）群体遗传多样性研究[J]. 刘硕博,唐祖蓉,申望,叶莹莹,陈晓磊,祁鹏志,郭宝英. 海洋与湖沼. 2019(02)
[4]厦门湾伪镖水蚤科一新种——郑氏伪镖水蚤[J]. 王博文,郭东晖. 厦门大学学报(自然科学版). 2019(03)
[5]基于COⅠ基因序列的长腹剑水蚤系统进化关系[J]. 王兴霞,徐磊,王亮根,陈骁,郑媛媛,王雪辉,杜飞雁. 海洋学报. 2018(06)
[6]基于mtDNACytb基因序列的我国不同水系野生鲇种群遗传多样性与种群历史分析[J]. 徐丹丹,黄燕,曾庆,李斌,彭作刚. 水产学报. 2017(10)
[7]乌鳢群体遗传多样性和遗传结构分析[J]. 周伟,高天翔,王俊,宋娜. 水产学报. 2017(10)
[8]基于线粒体COI序列的洪泽湖河蚬（Corbicula fluminea）遗传多样性和种群结构分析[J]. 李大命,张彤晴,唐晟凯,钟立强,刘小维. 海洋与湖沼. 2015(06)
[9]Molecular phylogeography and population genetic structure of the planktonic copepod Calanus sinicus Brodsky in the coastal waters of China[J]. HUANG Yousong,LIU Guangxing,CHEN Xiaofeng. Acta Oceanologica Sinica. 2014(10)
[10]不同地理群体乌鳢线粒体DNA控制区结构分析及遗传多样性[J]. 董新培,穆淑梅,周楠,康现江,罗青,白俊杰. 水产学报. 2014(09)
硕士论文
[1]中国东南9种伪镖水蚤的形态学与系统发育学研究[D]. 王博文.厦门大学 2019
本文编号：3344074
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3344074.html
