溶藻弧菌对大黄鱼（Pseudosciaena crocea）粘液的粘附相关基因研究

发布时间：2021-08-18 17:01

　　溶藻弧菌属于革兰氏阴性菌,是一种海生生物重要的条件性致病菌,并且往往与许多包括鱼类、虾类、珊瑚类和甲壳类等在内的海水养殖动物流行性病害有关。溶藻弧菌也是一种人类的致病性细菌,尤其容易通过海产品的感染导致耳炎和伤口感染。在近些年,溶藻弧菌由于引起水产养殖鱼类发病并且造成了重大的经济损失而受到广泛的研究。细菌对鱼类组织表面的粘附是细菌感染致病初始阶段的重要步骤。肠和受伤的表皮是弧菌入侵鱼体的重要门户。由于鱼体表面布满了粘液且细菌对粘液的粘附作用是多种致病菌感染的先决条件,因此,细菌的粘附能力是一种重要的毒力因子。细菌对宿主的粘附能力受到细菌本身、粘附底物和环境因子等诸多的影响。细菌的粘附受到多种基因的调控。尽管已经证实一些基因与细菌粘附有关,但是这种针对粘附的调控机制仍未可知。虽然最近已经获得了溶藻弧菌全基因组,但是其转录组情况仍未可知。本研究通过在胁迫条件下长期培养溶藻弧菌并测定其粘附能力,对获得的粘附弱化菌株进行转录测序和分析,以期望能够更好地理解溶藻弧菌粘附的基因调控机制。通过利用影响粘附能力的理化因子对溶藻弧菌进行胁迫诱导和粘附筛选,我们获得了三种重金属和一种低pH诱导下的粘附显著... 

【文章来源】：集美大学福建省

【文章页数】：55 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
abstract
第1章 引言
    1.1 转录组测序的发展与应用
        1.1.1 转录组与转录组学
        1.1.2 测序技术的发展
        1.1.3 转录组测序的应用
    1.2 溶藻弧菌粘附作用相关研究现状及分析
        1.2.1 溶藻弧菌的生物学特性和流行病学
        1.2.2 粘附研究进展
        1.2.3 细菌粘附研究方法
    1.3 本研究的目的与意义
    1.4 主要研究内容
第2章 胁迫培养条件下致病性溶藻弧菌粘附弱化菌株的筛选
    2.1 实验材料与方法
        2.1.1 实验用菌和鱼
        2.1.2 主要试剂和仪器
    2.2 实验方法与步骤
        2.2.1 大黄鱼表皮粘液的制备和蛋白含量测定
        2.2.2 溶藻弧菌毒力检测
        2.2.3 致病性溶藻弧菌胁迫培养处理
        2.2.4 溶藻弧菌对大黄鱼粘液的粘附作用测定
        2.2.5 数据处理
    2.3 结果与分析
        2.3.1 粘液蛋白含量测定
        2.3.2 溶藻弧菌对大黄鱼的半致死浓度LD50
        2.3.3 初次胁迫培养后溶藻弧菌对大黄鱼粘液粘附作用的影响
        2.3.4 二次和三次胁迫培养后溶藻弧菌对大黄鱼粘液粘附作用的影响
    2.4 讨论
第3章 基于链特异性测序的溶藻弧菌粘附作用转录组学分析
    3.1 实验材料
        3.1.1 测序菌株
        3.1.2 主要试剂和仪器
    3.2 实验方法
        3.2.1 样品准备与文库构建
        3.2.2 Illumina测序和数据处理
        3.2.3 功能注释和DEGs的富集性分析
        3.2.4 实验流程和信息分析流程图
    3.3 结果与分析
        3.3.1 测序质量评估
        3.3.2 Reads的比对参考和差异表达基因的统计检验
        3.3.3 差异基因的基因本体论（Gene ontology，GO）划分
        3.3.4 差异基因的直系同源基因聚簇
        3.3.5 KEGG通路注释
        3.3.6 ABC转运子家族基因与粘附分析
    3.4 讨论
第4章 结论与展望
    4.1 结论
    4.2 展望
致谢
参考文献


【参考文献】：
期刊论文
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[3]重金属胁迫培养对2种细菌生长曲线的影响[J]. 李淑英,苏亚丽,周元清,史云东,别金蓉.  安徽农业科学. 2011(01)
[4]下一代测序技术:技术回顾与展望[J]. 周晓光,任鲁风,李运涛,张猛,俞育德,于军.  中国科学:生命科学. 2010(01)
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硕士论文
[1]拟南芥种子发育过程小RNA深度测序数据的分析[D]. 陈冬菊.福建农林大学 2011



本文编号：3350276