缢蛏S型凝集素表达特征及免疫功能研究
发布时间：2021-09-30 08:04
缢蛏（Sinonovacula constricta）是国内重要的经济养殖贝类。但是随着养殖面积的扩大和养殖密度的增加,养殖环境不断恶化,缢蛏养殖过程中死亡现象日趋严重。与其它无脊椎动物一样,贝类缺乏免疫球蛋白,仅依靠先天免疫机制识别微生物病原体,其中包括细胞和体液免疫。生产中遇到的问题促使研究人员对贝类先天免疫的研究。有报道生物先天免疫通过相关受体（pattern recognition receptors,PRRs）识别微生物独有病原相关分子模式（pathogen-associated molecular patterns,PAMPs）,来激活免疫应答。近年来,有许多报道称半乳糖凝集素作为模式识别受体参与先天免疫,并且逐渐发现了生物体中的各种作用。在这项研究中,克隆了两个来自缢蛏中的半乳糖凝集素基因,这些基因参与识别和清理入侵微生物,在贝类免疫中起关键作用。1.两个半乳糖凝集素的cDNA全长克隆及序列分析从本实验室之前的缢蛏转录组数据中获得了2个半乳糖凝集素基因ScGal-1和ScGal-2的不完整片段,验证其准确性后通过cDNA末端快速扩增技术（rapid amplificati...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Galectin在脊椎动物（A）和水生软体动物（B）中的分子构型示意图
上海海洋大学硕士学位论文糖结合口袋残基图中以黄色三角形标出。Fig.2-1 Detection of putative conserved domains of Sinonovacula constricta ScGal using the NCBIconserved domain database (CDD). The C-terminus (residues 48-174) is a carbohydrate recognitiondomain (CRD). Residues in the dimerisation interface and sugar binding pocket are indicated bytriangles.通过 NCBI 数据库 Blast 比对显示，ScGal-1 基因与泥蚶（Tegillarca granosa）半乳糖凝集素基因的相似度最高，为 48%；其次是太平洋牡蛎（Crassostreagigas）和牡蛎（Crassostreavirginica）分别是 47%和 46%。多重序列比对结果如图 2-2 所示，其二聚化残基以及结构域在不同物种间具有较高的保守性。
的 ScGal-1 基因进行多重序列比对。图中保守氨基酸残基用深灰色阴影表示，类似氨基酸为浅灰色阴影。 二聚化界面相关残基红色框标出，CRD 区域用黑色框圈出。Fig. 2-2 Multiple sequence alignment ScGal from Sinonovacula constricta and related proteins fromvarious species using sequences obtained from the NCBI database. Conserved amino acid residues areshaded dark grey, and similar amino acids are shaded light grey. Residues involved in the dimerisationinterface are in red boxes, and the CRD is in a black box.通过 SWISS-MODEL 预测 ScGal-1 的蛋白空间结构，预测显示与人 galectin-4有着 40.15%的相似度。空间结构由两个反向平行的 β-折叠束构成的反相平行夹心结构，其中 β 链 F1-F5 形成与分泌相关的 β-夹心结构的凸侧（图 2-3A），β 链 S1-S6 构成夹心结构的凹侧并含有碳水化合物结合位点（图 2-3B）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Al掺杂浓度对CrSi2电子结构及光学性质的影响[J]. 闫万珺,周士芸,谢泉,郭本华,张春红,张忠政. 光学学报. 2012(05)
[2]缢蛏副溶血弧菌的分离与鉴定[J]. 邱晴,谢李珍,傅兴隆,杨受保. 安徽农学通报(下半月刊). 2010(12)
[3]真核细胞非经典蛋白分泌途径[J]. 张楠楠,刘欣,孙晶,吴毓,李庆伟. 遗传. 2009(01)
[4]缢蛏致病菌假单胞菌的分子生物学分析[J]. 曹梅,王兴强,阎斌伦,张庆起. 安徽农学通报. 2008(23)
[5]无脊椎动物先天免疫模式识别受体研究进展[J]. 王金星,赵小凡. 生物化学与生物物理进展. 2004(02)
本文编号：3415452
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：76 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
Galectin在脊椎动物（A）和水生软体动物（B）中的分子构型示意图
上海海洋大学硕士学位论文糖结合口袋残基图中以黄色三角形标出。Fig.2-1 Detection of putative conserved domains of Sinonovacula constricta ScGal using the NCBIconserved domain database (CDD). The C-terminus (residues 48-174) is a carbohydrate recognitiondomain (CRD). Residues in the dimerisation interface and sugar binding pocket are indicated bytriangles.通过 NCBI 数据库 Blast 比对显示，ScGal-1 基因与泥蚶（Tegillarca granosa）半乳糖凝集素基因的相似度最高，为 48%；其次是太平洋牡蛎（Crassostreagigas）和牡蛎（Crassostreavirginica）分别是 47%和 46%。多重序列比对结果如图 2-2 所示，其二聚化残基以及结构域在不同物种间具有较高的保守性。
的 ScGal-1 基因进行多重序列比对。图中保守氨基酸残基用深灰色阴影表示，类似氨基酸为浅灰色阴影。 二聚化界面相关残基红色框标出，CRD 区域用黑色框圈出。Fig. 2-2 Multiple sequence alignment ScGal from Sinonovacula constricta and related proteins fromvarious species using sequences obtained from the NCBI database. Conserved amino acid residues areshaded dark grey, and similar amino acids are shaded light grey. Residues involved in the dimerisationinterface are in red boxes, and the CRD is in a black box.通过 SWISS-MODEL 预测 ScGal-1 的蛋白空间结构，预测显示与人 galectin-4有着 40.15%的相似度。空间结构由两个反向平行的 β-折叠束构成的反相平行夹心结构，其中 β 链 F1-F5 形成与分泌相关的 β-夹心结构的凸侧（图 2-3A），β 链 S1-S6 构成夹心结构的凹侧并含有碳水化合物结合位点（图 2-3B）。
【参考文献】：
期刊论文
[1]Al掺杂浓度对CrSi2电子结构及光学性质的影响[J]. 闫万珺,周士芸,谢泉,郭本华,张春红,张忠政. 光学学报. 2012(05)
[2]缢蛏副溶血弧菌的分离与鉴定[J]. 邱晴,谢李珍,傅兴隆,杨受保. 安徽农学通报(下半月刊). 2010(12)
[3]真核细胞非经典蛋白分泌途径[J]. 张楠楠,刘欣,孙晶,吴毓,李庆伟. 遗传. 2009(01)
[4]缢蛏致病菌假单胞菌的分子生物学分析[J]. 曹梅,王兴强,阎斌伦,张庆起. 安徽农学通报. 2008(23)
[5]无脊椎动物先天免疫模式识别受体研究进展[J]. 王金星,赵小凡. 生物化学与生物物理进展. 2004(02)
本文编号：3415452
本文链接：https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3415452.html
