半滑舌鳎性别大小异形的转录组学研究

发布时间：2021-10-10 08:59

　　鱼类的个体生长性状是与鱼类养殖产量息息相关的重要经济性状,在水产基础研究中具有较高的关注度。生长和生殖是生物体最基本的特征。脊椎动物的生长受“下丘脑-垂体-肝”轴的调节。脊椎动物繁殖主要受“脑/下丘脑-垂体-性腺”轴的调控。生长与生殖密切相关但又相互区别。一方面,在发育过程中,性腺的发育与身体的发育有着密切联系。鱼类生长激素受体,类胰岛素样生长因子等在多种组织中表达,并且在性腺中也有表达。这意味着垂体分泌的生长激素可以影响身体的生长和性腺的发育,从而协调两者的生长发育。另一方面,在雌鱼产卵周期中,卵巢的生长又与身体的生长相关。性腺分化伴随着细胞分化和组织生长,因此,性腺中也存在生长激素、生长激素受体、类胰岛素样生长因子生长调控轴和一些局部调节因子,从而准确地调控卵巢发育和成熟。因此,鱼类个体的生长表现是体内生长调控轴与生殖调控轴相互作用和影响所产生的结果。半滑舌鳎（Cynoglossus semilaevis）属于鲽形目（Pleuronectiformes）、舌鳎科（Cynoglossidae）、舌鳎属（Cynoglossus）,主要分布在我国黄海和渤海的近海区,是一种我国特有的珍贵经... 

【文章来源】：上海海洋大学上海市

【文章页数】：84 页

【学位级别】：硕士

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摘要
ABSTRACT
第一章 引言
    1.1. 鱼类生长调控轴研究现状
        1.1.1 生长激素(GH)
        1.1.2 胰岛素样生长因子(IGFs)
        1.1.3 生长激素促释放素(GHRH)
        1.1.4 垂体腺苷酸环化酶活化肽(PACAP)
        1.1.5 生长抑素(SST)
        1.1.6 其他神经多肽(neuropeptides)和神经介质(neurotransmitters)
    1.2. 鱼类生殖调控轴研究现状
        1.2.1 促性腺激素释放激素(Gn RH)
        1.2.2 多巴胺
        1.2.3 性类固醇激素
    1.3. 生长生殖轴调控网络研究
第二章 材料方法和实验内容
    2.1 组织准备和总RNA的抽提
        2.1.1 组织准备
        2.1.2 半滑舌鳎总RNA的提取过程
    2.2 RNA-seq测序，基因注释和新基因鉴定
    2.3 差异表达基因的分析
    2.4 相关性分析和主成分分析
    2.5 基因共表达网络的构建
    2.6 模块特征关系和关键基因鉴定
    2.7 实时荧光定量核酸扩增检测系统（q PCR）验证高通量转录组测序数据
    2.8 关键基因的半定量和定量分析及时空表达模式分析
        2.8.1 关键基因在各组织中表达模式的半定量分析实验
        2.8.2 关键基因在各组织中表达模式的实时荧光定量分析实验
    2.9 基因染色体定位分析
第三章 实验结果及分析
    3.1 高通量测序数据
    3.2 差异表达基因和样本聚类分析
    3.3 转录组高通量测序的验证
    3.4 差异表达基因GO（gene ontology）和KEGG（Kyoto Encyclopedia of Genesand Genomes）富集分析
        3.4.1 The forkhead box O信号传导通路（The forkhead box O signalingpathway，FoxO）
        3.4.2 类固醇生物合成通路（Steroid synthesis pathway）
        3.4.3 丝裂原活化蛋白激酶(mitogen-activated protein kinase,MAPK)
    3.5 基因共表达网络的构建
    3.6 生长相关模块的识别和功能注释
    3.7 Hub基因鉴定和网络构建
    3.8 半定量和实时荧光定量实验对关键基因表达模式分析
        3.8.1 同一时期不同组织中的半定量实验结果
        3.8.2 同一时期不同组织中的荧光定量实验结果
        3.8.3 同一组织不同发育时期性别表达模式的荧光定量实验结果
    3.9 基因染色体定位分析
        3.9.1 purb基因的染色体位置
        3.9.2 W染色体和14号染色体上purb基因的m RNA序列比对
        3.9.3 W染色体和14号染色体上purb基因的蛋白质序列比对
        3.9.4 nipbla基因的染色体位置
        3.9.5 W染色体和Z染色体上nipbla基因的m RNA序列比对
        3.9.6 W染色体和Z号染色体上nipbla基因的蛋白质序列比对
结论
致谢
参考文献
论文发表情况


【参考文献】：
期刊论文
[1]鱼类生长的神经内分泌调控[J]. 代向燕,张玮,卓子见,贺江燕,殷战.  中国科学:生命科学. 2014(12)
[2]半滑舌鳎性别特异微卫星标记的SCAR转化及其应用[J]. 刘洋,陈松林,高峰涛,孟亮,胡乔木,宋文涛,邵长伟,吕为群.  农业生物技术学报. 2014(06)
[3]神经内分泌因子调控鱼类生殖和生长的相互作用[J]. 林浩然.  动物学研究. 2000(01)
[4]促性腺激素释放激素类似物促进鱼类生长激素分泌和生长[J]. 林信伟,林浩然,张庆.  水产学报. 1993(04)



本文编号：3428066