南海短尾大眼鲷（Priacanthus macracanthus）种群判别分析
发布时间：2021-10-16 04:37
鱼类种群是鱼类分类学的基本单位,鱼类资源变动研究也是以种群为单位,是鱼类生物学研究的基础。近年来,由于全球渔业捕捞能力过剩,海洋生态破坏和环境污染,很多鱼类都面临资源威胁,作为南海重要经济鱼种之一的短尾大眼鲷的资源量也正在下降,迫切需要加强资源的合理开发和与国内外的共同管理。本文以南海短尾大眼鲷（Priacanthus macracanthus）为研究对象,利用线粒体DNA序列分析方法判别南海北部和南部不同地理位点的短尾大眼鲷群体归属,为保护南海短尾大眼鲷资源及今后周边各国的共同开发和捕捞配额管理提供基本依据。主要研究内容如下:1.利用在南海北部陆架和南沙西南陆架采集的224尾短尾大眼鲷样品,采用线粒体控制区（mt DNA D-loop区）序列对其进行种群遗传结构分析,并探讨6个采样位点之间短尾大眼鲷种群归属关系。所得224条同源序列D-loop片段（729 bp）中碱基A、C、T、G的含量分别是31.8%、19.1%、34.1%和15.0%,A+T含量为65.9%,C+G含量为34.1%,显示明显的AT偏好和反G偏倚。检测到了101个突变位点和94个核苷酸多态位点,定义了172种单倍...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：54 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
短尾大眼鲷PriacanthusmacracanthusFig.1-1Priacanthusmacracanthus
14图 2-1 短尾大眼鲷标本采集地点图Fig.2-1 Map showing sample localities for Priacanthus macracanth2.1.2 DNA 提取与检测每个样品取背部肌肉 25 mg 左右，置于 1.5 mL 离心管内，使用工程股份有限公司的海洋动物组织 DNA 提取试剂盒提取总基因组 D骤如下：1.称取肌肉样品约 25mg 加入离心管中，加 200 μL GA 缓冲液，液呈浑浊，目测无成块肌肉组织；2.加入 20 μL 蛋白酶 K，涡旋混匀，简短离心后置于 55℃恒温水
Network 软件分析构建的南海海域短尾大眼鲷群体的单倍型网络(MJ)图(图 3)与其 NJ 系统发育树揭示了相似的结果，谱系发现大量的单倍型显示为明显的星状分布， Hap 10、Hap 29、Hap 39 是高频分布的优势单倍型。特有单倍型分散地分布在网络图中，未形成特有的进化枝。6 个短尾大眼鲷群体没有表现出明显的地理分布特征。
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于mtDNA COⅠ和Cytb基因序列对南中国海不同海域波纹唇鱼群体遗传多样性的研究[J]. 胡静,侯新远,尹绍武,祝斐,贾一何,王小军. 水生生物学报. 2014(06)
[2]内蒙古达里湖及岗更湖东北雅罗鱼D-loop基因序列及多样性研究[J]. 罗旭光,齐景伟,安晓萍,乌兰,姚珺,李蓓. 南方水产科学. 2014(02)
[3]基于线粒体Cyt b基因的黄鳍马面鲀种群分析[J]. 李玉芳,李永振,陈国宝,孙典荣,于杰,崔科. 水产学报. 2014(01)
[4]基于线粒体控制区全序列的鄱阳湖水系鲢增殖放流群体与野生群体的遗传多样性分析[J]. 陈文静,张燕萍,段辛斌,徐先栋,汪澄强. 中国农学通报. 2013(35)
[5]长吻养殖群体与野生群体遗传多样性分析[J]. 肖明松,崔峰,康健,马玉涵. 水生生物学报. 2013(01)
[6]二长棘犁齿鲷线粒体DNA控制区结构和进化[J]. 苏天凤,江世贵,马之明,李夏. 南方水产科学. 2012(06)
[7]福建近海蓝圆鲹群体遗传结构分析[J]. 牛素芳,苏永全,王军,张丽艳. 厦门大学学报(自然科学版). 2012(04)
[8]基于COI部分序列探讨南海鲳属鱼类系统进化与种群遗传结构[J]. 孙鹏,尹飞,施兆鸿,彭士明. 海洋科学. 2012(06)
[9]南海金线鱼属Nemipterus鱼类COⅠ和Cytb基因片段的比较分析[J]. 董丽娜,黄梓荣,李永振,陈国宝. 中国水产科学. 2012(02)
[10]北部湾3种金线鱼属鱼类COI基因序列的比较分析[J]. 董丽娜,黄梓荣,艾红,卢伟华,李希国,李娜娜,李夏,李永振. 中国水产科学. 2011(03)
硕士论文
[1]南海黄鳍马面鲀（Thamnaconus hypargyreus）种群分析[D]. 李玉芳.上海海洋大学 2014
[2]太平洋中部黄鳍金枪鱼种群遗传多样性研究[D]. 李伟文.上海海洋大学 2014
[3]棘头梅童鱼的遗传多样性与种群遗传结构研究[D]. 殷丽娜.中国海洋大学 2013
[4]中国野生乌鳢（Channa argus）遗传多样性分析[D]. 高志远.暨南大学 2013
[5]南海北部陆架区金线鱼（Nemipterus virgatus）种群分子分析[D]. 董丽娜.上海海洋大学 2011
本文编号：3439161
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：54 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
短尾大眼鲷PriacanthusmacracanthusFig.1-1Priacanthusmacracanthus
14图 2-1 短尾大眼鲷标本采集地点图Fig.2-1 Map showing sample localities for Priacanthus macracanth2.1.2 DNA 提取与检测每个样品取背部肌肉 25 mg 左右，置于 1.5 mL 离心管内，使用工程股份有限公司的海洋动物组织 DNA 提取试剂盒提取总基因组 D骤如下：1.称取肌肉样品约 25mg 加入离心管中，加 200 μL GA 缓冲液，液呈浑浊，目测无成块肌肉组织；2.加入 20 μL 蛋白酶 K，涡旋混匀，简短离心后置于 55℃恒温水
Network 软件分析构建的南海海域短尾大眼鲷群体的单倍型网络(MJ)图(图 3)与其 NJ 系统发育树揭示了相似的结果，谱系发现大量的单倍型显示为明显的星状分布， Hap 10、Hap 29、Hap 39 是高频分布的优势单倍型。特有单倍型分散地分布在网络图中，未形成特有的进化枝。6 个短尾大眼鲷群体没有表现出明显的地理分布特征。
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于mtDNA COⅠ和Cytb基因序列对南中国海不同海域波纹唇鱼群体遗传多样性的研究[J]. 胡静,侯新远,尹绍武,祝斐,贾一何,王小军. 水生生物学报. 2014(06)
[2]内蒙古达里湖及岗更湖东北雅罗鱼D-loop基因序列及多样性研究[J]. 罗旭光,齐景伟,安晓萍,乌兰,姚珺,李蓓. 南方水产科学. 2014(02)
[3]基于线粒体Cyt b基因的黄鳍马面鲀种群分析[J]. 李玉芳,李永振,陈国宝,孙典荣,于杰,崔科. 水产学报. 2014(01)
[4]基于线粒体控制区全序列的鄱阳湖水系鲢增殖放流群体与野生群体的遗传多样性分析[J]. 陈文静,张燕萍,段辛斌,徐先栋,汪澄强. 中国农学通报. 2013(35)
[5]长吻养殖群体与野生群体遗传多样性分析[J]. 肖明松,崔峰,康健,马玉涵. 水生生物学报. 2013(01)
[6]二长棘犁齿鲷线粒体DNA控制区结构和进化[J]. 苏天凤,江世贵,马之明,李夏. 南方水产科学. 2012(06)
[7]福建近海蓝圆鲹群体遗传结构分析[J]. 牛素芳,苏永全,王军,张丽艳. 厦门大学学报(自然科学版). 2012(04)
[8]基于COI部分序列探讨南海鲳属鱼类系统进化与种群遗传结构[J]. 孙鹏,尹飞,施兆鸿,彭士明. 海洋科学. 2012(06)
[9]南海金线鱼属Nemipterus鱼类COⅠ和Cytb基因片段的比较分析[J]. 董丽娜,黄梓荣,李永振,陈国宝. 中国水产科学. 2012(02)
[10]北部湾3种金线鱼属鱼类COI基因序列的比较分析[J]. 董丽娜,黄梓荣,艾红,卢伟华,李希国,李娜娜,李夏,李永振. 中国水产科学. 2011(03)
硕士论文
[1]南海黄鳍马面鲀（Thamnaconus hypargyreus）种群分析[D]. 李玉芳.上海海洋大学 2014
[2]太平洋中部黄鳍金枪鱼种群遗传多样性研究[D]. 李伟文.上海海洋大学 2014
[3]棘头梅童鱼的遗传多样性与种群遗传结构研究[D]. 殷丽娜.中国海洋大学 2013
[4]中国野生乌鳢（Channa argus）遗传多样性分析[D]. 高志远.暨南大学 2013
[5]南海北部陆架区金线鱼（Nemipterus virgatus）种群分子分析[D]. 董丽娜.上海海洋大学 2011
本文编号：3439161
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