基于COI基因序列的中国东南沿海四指马鲅属鱼类的遗传多样性分析
发布时间:2021-10-19 11:23
四指马鲅属(Eleutheronoma)是广泛分布于印度-西太平洋的名贵海洋鱼类,也是东南亚地区各国重要的养殖对象。本文在对中国东南沿海10个地理群体194尾四指马鲅属鱼类进行形态鉴定的基础上,通过PCR扩增技术和DNA直接测序法测定鱼体线粒体COI基因序列,结合从GeneBank下载的印度洋、澳大利亚北部沿海以及中国西沙和南沙等海域的四指马鲅属鱼类DNA同源序列共207条基因序列,进行遗传分析,得到如下结果:1、四指马鲅属鱼类的分类地位四指马鲅属鱼类在NJ树中聚类为3个明显谱系,根据各谱系间的遗传距离、遗传分化指数(Fst值)以及外部形态特征鉴定结果,结合历史资料,确定中国东南沿海大多数四指马鲅属鱼类为多鳞四指马鲅(E.rhadinum);确定E. coecus Macleay为有效种,东兴大部分个体、福州少数个体与澳大利亚全部个体均为本种,且中国沿海和澳大利亚北部海域E.coecus群体间存在较大的遗传分化,或为不同的亚种。东兴个别样品与印度洋海域的四指马鲅属鱼类聚类,根据四指马鲅(E.tetradactylus)地模标本的地理分布情况,初步认为这个谱系为四指马鲅,考虑到广阔的印度...
【文章来源】:暨南大学广东省 211工程院校
【文章页数】:67 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
1-1鱼类线粒体基因结构图(Meyer,1994)
-1中国东南沿海四指马鲅属鱼类的采样地点分布示意图
聚群现象,分为 3 个明显的谱系,同时一共包含了 34 个单倍型,其中谱系 1 含有 2倍型,谱系 2 含有 11 个单倍型,谱系 3 只有 3 个单倍型。为了更清晰的显示各个谱马鲅属鱼类的单倍型分布情况,下面按谱系分别绘制 TCS 单倍型网络支系图。
【参考文献】:
期刊论文
[1]Genetic diversity and population structure of Eleutheronema rhadinum in the East and South China Seas revealed in mitochondrial COI sequences[J]. 孙鑫序,徐冬冬,楼宝,张涛,辛俭,郭垚示,马世磊. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2013(06)
[2]多鳞四指马鲅4个地理群体的形态差异[J]. 杨阳,庄平,张涛,侯俊利,赵峰,黄晓荣,汤滔. 上海海洋大学学报. 2013(06)
[3]应用AFLP技术分析多鳞四指马鲅不同地理群体的遗传多样性[J]. 杨阳,汤滔,张涛,侯俊利,宋超,王妤,张琴星,庄平. 海洋渔业. 2013(02)
[4]基于COⅠ序列分析东海区四指马鲅(Eleutheronema tetradactylum)的种群遗传结构[J]. 林少珍,王丹丽,王亚军,严小军. 海洋与湖沼. 2012(06)
[5]额尔齐斯河银鲫形态学及COI基因序列分析[J]. 孟玮,郭焱,海萨,杨天燕,高攀. 淡水渔业. 2010(05)
[6]四指马鲅人工繁殖技术[J]. 毛连环. 水产科技情报. 2009(06)
[7]长江口崇明东滩鱼类群落组成和生物多样性[J]. 张涛,庄平,刘健,章龙珍,冯广朋,侯俊利,赵峰,刘鉴毅. 生态学杂志. 2009(10)
[8]长江河口湿地鱼类的种类组成及多样性分析[J]. 张衡,朱国平,陆健健. 生物多样性. 2009(01)
[9]DNA分子标记技术在水生动物遗传多样性研究中的应用[J]. 王忠华,董西征,钱国英. 科技通报. 2008(05)
[10]长江口沿岸碎波带仔稚鱼的种类组成及其多样性特征[J]. 蒋日进,钟俊生,张冬良,傅萃长. 动物学研究. 2008(03)
硕士论文
[1]鄱阳湖水系青鱼、草鱼、鲢、鳙形态度量学分析[D]. 张希.南昌大学 2011
本文编号:3444775
【文章来源】:暨南大学广东省 211工程院校
【文章页数】:67 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
1-1鱼类线粒体基因结构图(Meyer,1994)
-1中国东南沿海四指马鲅属鱼类的采样地点分布示意图
聚群现象,分为 3 个明显的谱系,同时一共包含了 34 个单倍型,其中谱系 1 含有 2倍型,谱系 2 含有 11 个单倍型,谱系 3 只有 3 个单倍型。为了更清晰的显示各个谱马鲅属鱼类的单倍型分布情况,下面按谱系分别绘制 TCS 单倍型网络支系图。
【参考文献】:
期刊论文
[1]Genetic diversity and population structure of Eleutheronema rhadinum in the East and South China Seas revealed in mitochondrial COI sequences[J]. 孙鑫序,徐冬冬,楼宝,张涛,辛俭,郭垚示,马世磊. Chinese Journal of Oceanology and Limnology. 2013(06)
[2]多鳞四指马鲅4个地理群体的形态差异[J]. 杨阳,庄平,张涛,侯俊利,赵峰,黄晓荣,汤滔. 上海海洋大学学报. 2013(06)
[3]应用AFLP技术分析多鳞四指马鲅不同地理群体的遗传多样性[J]. 杨阳,汤滔,张涛,侯俊利,宋超,王妤,张琴星,庄平. 海洋渔业. 2013(02)
[4]基于COⅠ序列分析东海区四指马鲅(Eleutheronema tetradactylum)的种群遗传结构[J]. 林少珍,王丹丽,王亚军,严小军. 海洋与湖沼. 2012(06)
[5]额尔齐斯河银鲫形态学及COI基因序列分析[J]. 孟玮,郭焱,海萨,杨天燕,高攀. 淡水渔业. 2010(05)
[6]四指马鲅人工繁殖技术[J]. 毛连环. 水产科技情报. 2009(06)
[7]长江口崇明东滩鱼类群落组成和生物多样性[J]. 张涛,庄平,刘健,章龙珍,冯广朋,侯俊利,赵峰,刘鉴毅. 生态学杂志. 2009(10)
[8]长江河口湿地鱼类的种类组成及多样性分析[J]. 张衡,朱国平,陆健健. 生物多样性. 2009(01)
[9]DNA分子标记技术在水生动物遗传多样性研究中的应用[J]. 王忠华,董西征,钱国英. 科技通报. 2008(05)
[10]长江口沿岸碎波带仔稚鱼的种类组成及其多样性特征[J]. 蒋日进,钟俊生,张冬良,傅萃长. 动物学研究. 2008(03)
硕士论文
[1]鄱阳湖水系青鱼、草鱼、鲢、鳙形态度量学分析[D]. 张希.南昌大学 2011
本文编号:3444775
本文链接:https://www.wllwen.com/nykjlw/scyylw/3444775.html