主养草鱼池塘微生物群落结构分析及嗜水气单胞菌拮抗菌筛选

发布时间：2021-10-19 13:38

　　微生物是水产养殖系统的重要组成部分,在水产养殖系统中的起着十分重要的作用。作为生产者,微生物可以利用光能或者无机物制造有机物,为水产养殖动物提供营养物质。作为分解者,微生物可以除去水产养殖环境中的残饵、粪便、动植物残体等,推动了水产养殖系统中的物质循环和能量流动。此外,水产养殖环境中也存在着许多致病微生物和诸多益生菌。所以,了解水产养殖系统中的微生物群落结构,可以为监测养殖系统的生态状况、开发新的微生物资源、养殖病害的防治提供理论基础。本研究首先采用平板菌落计数法分析了草鱼养殖水体异养细菌数量周年变化,结果表明,养殖水体中异养细菌数量呈季节性变化,6月份和8月份水体中异养细菌数量最高,10月份次之,4月份和12月份最低。其次采用高通量测序技术分析了草鱼养殖水体微生物群落结构,结果表明,草鱼养殖水体微生物群落结构也随季节发生变化,在门水平上,不同月份共有的优势菌为变形菌门（Proteobacteria）、放线菌门（Actinobacteria）、拟杆菌门（Bacteroidetes）、浮霉菌门（Planctomycetes）。厚壁菌门（Firmicutes）只在4月份和6月份出现,绿弯菌... 

【文章来源】：西南大学重庆市 211工程院校 教育部直属院校

【文章页数】：69 页

【学位级别】：硕士

【文章目录】：
摘要
Abstract
第1章 文献综述
    1.1 草鱼养殖现状
    1.2 微生物在水产养殖中的作用
        1.2.1 促进养殖动物生长
        1.2.2 净化养殖水质
        1.2.3 提高养殖动物免疫力
    1.3 微生物与养殖病害
    1.4 养殖环境微生物研究主要方法
        1.4.1 高通量测序技术
        1.4.2 变性梯度凝胶电泳技术
        1.4.3 Biolog技术
    1.5 嗜水气单胞菌
        1.5.1 嗜水气单胞菌的致病性
        1.5.2 嗜水气单胞菌的防治
    1.6 本论文的研究目的及意义
第2章 草鱼池塘微生物群落结构分析
    2.1 试验材料
        2.1.1 主要仪器
        2.1.2 培养基
        2.1.3 药品试剂
    2.2 试验方法
        2.2.1 样品采集
        2.2.2 水样理化指标测定
        2.2.3 水样的处理
        2.2.4 异养细菌计数
        2.2.5 水样宏基因组的提取
        2.2.6 细菌16S rDNA基因的PCR扩增
        2.2.7 测序数据处理
        2.2.8 细菌群落结构组成分析
        2.2.9 细菌多样性与丰富度分析
    2.3 结果
        2.3.1 水样的理化性质
        2.3.2 水体中异养细菌数量变化
        2.3.3 水体微生物宏基因组提取
        2.3.4 水体微生物群落结构组成
        2.3.5 多样性分析和丰富度分析
    2.4 讨论
    2.5 小结
第3章 嗜水气单胞菌拮抗菌的筛选及鉴定
    3.1 试验材料
        3.1.1 菌种来源
        3.1.2 实验仪器
        3.1.3 培养基
        3.1.4 试剂
    3.2 试验方法
        3.2.1 水样和泥样的采集
        3.2.2 样品细菌的分离
        3.2.3 嗜水气单胞菌拮抗菌的筛选
        3.2.4 拮抗菌鉴定
        3.2.5 生理生化实验
        3.2.6 分子生物学实验
    3.3 结果与分析
        3.3.1 拮抗菌筛选结果
        3.3.2 菌株WM-1的形态学观察
        3.3.3 菌株WM-1的生理生化特征
        3.3.4 菌株WM-1的16S rDNA分析
    3.4 讨论
    3.5 小结
第4章 拮抗菌株WM-1发酵条件优化
    4.1 试验材料
        4.1.1 供试菌种
        4.1.2 培养基
        4.1.3 主要仪器及试剂
    4.2 试验方法
        4.2.1 菌种活化
        4.2.2 菌株WM-1种龄确定
        4.2.3 种子液的制备
        4.2.4 无菌发酵液的制备
    4.3 抑菌活性测定
    4.4 菌株WM-1发酵培养基优化
        4.4.1 碳源试验
        4.4.2 氮源试验
        4.4.3 无机盐试验
        4.4.4 正交试验
    4.5 菌株WM-1发酵条件优化
        4.5.1 培养基初始pH值对发酵液抑菌活性的影响
        4.5.2 培养温度对发酵液抑菌活性的影响
        4.5.3 摇床转速对发酵液抑菌活性的影响
        4.5.4 装液量对发酵液抑菌活性的影响
        4.5.5 培养时间对发酵液抑菌活性的影响
    4.6 优化培养基和培养条件对菌株抑菌活性的影响
    4.7 数据处理
    4.8 结果与分析
        4.8.1 菌株WM-1种龄确定
        4.8.2 不同碳源对菌株WM-1发酵液抑菌活性的影响
        4.8.3 不同氮源对菌株WM-1发酵液抑菌活性的影响
        4.8.4 不同无机盐对菌株WM-1发酵液抑菌活性的影响
        4.8.5 培养基成分的正交试验
        4.8.6 培养基初始pH值对菌株WM-1发酵液抑菌活性的影响
        4.8.7 不同培养温度对菌株WM-1发酵液抑菌活性的影响
        4.8.8 不同装液量对菌株WM-1发酵液抑菌活性的影响
        4.8.9 摇床转速对菌株WM-1发酵液抑菌活性的影响
        4.8.10 培养时间对菌株WM-1发酵液抑菌活性的影响
    4.9 优化培养基和培养条件对菌株抑菌活性的影响
    4.10 讨论
    4.11 小结
第5章 结论与展望
    5.1 结论
    5.2 展望
参考文献
致谢
附录


【参考文献】：
期刊论文
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[3]抗嗜水气单胞菌NJ-1感染的乳酸菌筛选及其免疫调节作用[J]. 王彦波,任真真,张岩,傅玲琳.  水产学报. 2016(03)
[4]高通量测序在食品微生物生态学研究中的应用[J]. 米其利,李雪梅,管莹,高茜,桂永发,朱洲海,夭建华.  食品科学. 2016(23)
[5]基于高通量测序的石斑鱼循环水养殖生物滤池微生物群落分析[J]. 黄志涛,宋协法,李勋,万荣,董登攀,石蓉蓉,翟介明.  农业工程学报. 2016(S1)
[6]芽孢杆菌类生物杀菌剂的研发与应用[J]. 陈志谊.  中国生物防治学报. 2015(05)
[7]鱼源乳酸菌对水产病原菌的抑制作用研究[J]. 苟小兰,苏艳秋,石锐,顾继锐,罗国强,王利.  水产科学. 2015(09)
[8]青石斑鱼海水循环水养殖水体的细菌群落特征[J]. 侯婷婷,钟志平,刘缨,刘志培.  微生物学报. 2016(02)
[9]Illumina高通量测序技术检测医院内空气中微生物[J]. 李燕明,佟训靓,许宏涛,田埂,郎继东,肖飞,蔡虻.  温州医科大学学报. 2015(06)
[10]基于高通量测序的浓香型白酒窖池细菌群落结构分析[J]. 邓杰,黄治国,卫春会,罗惠波,杜礼泉,苟云凌.  现代食品科技. 2015(07)

硕士论文
[1]饲料中补充益生菌对凡纳滨对虾生长、抗病力及其肠道微生物组成的影响[D]. 刘文亮.上海海洋大学 2016
[2]感染嗜水气单胞菌草鱼肠道菌群结构研究[D]. 李东亮.西北农林科技大学 2016
[3]水雍菜浮床养殖模式下黄颡鱼肠道及环境微生物多样性的研究[D]. 石焱.华中农业大学 2015
[4]玉米茎基腐病拮抗菌（48SJ7-1）鉴定、培养条件优化及应用的研究[D]. 耿肖兵.东北农业大学 2015
[5]甘肃省番茄细菌性叶斑病的研究[D]. 王玉琴.甘肃农业大学 2015
[6]皱纹盘鲍养殖水体及其消化道中细菌动态变化特征研究[D]. 杨宝丽.上海海洋大学 2015
[7]养殖环境微生物群落的动态变化及与水环境的互作[D]. 张皓.苏州大学 2015
[8]虾蟹养殖水体中微生物群落多样性分析[D]. 吕宁.中国海洋大学 2014
[9]团头鲂池塘养殖系统菌群结构及组成多样性研究[D]. 李晓.南京农业大学 2014
[10]甜瓜枯萎病病原拮抗菌的筛选及利用响应面法优化发酵条件[D]. 邹立飞.海南大学 2013



本文编号：3444976