miR-92b通过靶向IKK参与白氏文昌鱼先天免疫调控研究
发布时间：2021-10-23 18:11
动物的先天免疫中TLR（Toll-like receptor）信号通路在机体中起着举足轻重的作用。文昌鱼因拥有繁琐有序的先天免疫系统,同时兼有特异性免疫的雏形,逐渐成为研究动物免疫系统的模型。Micro RNA（mi RNA）是生物体内的一类具有调控功能的非编码小RNA,已有的报道显示mi R-92家族的多个成员均参与免疫调节。白氏文昌鱼mi RNA的研究主要尚处于通过高通量测序的方法筛选免疫相关的mi RNA阶段,亟待深入开展功能研究。结合文昌鱼特殊的进化地位,本论文围绕mi R-92家族参与文昌鱼TLR通路先天免疫调控开展研究,并进一步对mi R-92家族的进化进行分析,获得了以下的结果:1.本研究对mi R-92家族的系统进化进行了分析,以白氏文昌鱼的mi R-92家族为例,预测可能编码的前体mi RNA茎环结构的稳定性。对不同物种mi R-92家族序列比对发现,mi R-92a和mi R-92b在大部分物种中存在。海胆中存在的该家族成员最多,文昌鱼的bbe-mi R-92b与其它物种的保守性相比较要高于bbe-mi R-92b与物种内其他成员（bbe-mi R-92a、bbe-...
【文章来源】：南京师范大学江苏省 211工程院校
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
白氏文昌鱼拍摄于实验室Fig1.1Branchiostomabelcheriphotographedinthelaboratory
第一章绪论7等）和转录因子（如AP-1、NF-κB等）。TLR通路通过级联反应激活转录因子最终促进下游细胞因子的表达，进而参与机体抵御病原体的免疫反应[40,41]。图1.3人类TLR信号通路的示意图Fig1.3SchematicdiagramofthehumanTLRsignalingpathway[42]1.5.2IKK基因的功能作用机制IKK（InhibitorOfNuclearFactorKappa-BKinase）是经典免疫调控通路TLR通路里的关键基因。转录因子NF-κB通常由促炎信号因子激活来调节体内的炎症反应。NF-κB未被激活前，稳定的存在于细胞质中与I-κB形成复合物；当细胞受到刺激时，I-κB会被IKK复合物磷酸化而降解，从而暴露出NF-κB的核定位序列，进而进入细胞核内行使转录因子的调控作用。IKK复合物包含多个亚基，主要作用是使I-κB磷酸化，IKKα和IKKβ是两个序列高度相似的蛋白激酶，是NF-κB激活的大多数信号通路的汇聚点[43]。细胞内大部分IKKα和IKKβ分子都是IKK复合物的一部分，IKK复合物还包含一个名为IKKγ或NEMO（NF-κBessentialmodulator）的调节亚基。尽管有广泛的序列相似性，IKKα和IKKβ由于其不同的底物特性和调控模式，在很大程度上具有不同的功能。IKKβ(和IKKγ)是通过触发促炎反应(如TNFα或脂多糖(LPS))来快速激活NF-κB的关键。相比之下，IKKα在TNF家族成员的亚群中激活特定形式的NF-κB，也可能减弱IKKβ
第二章miR-92家族的生物信息学分析13图2.1白氏文昌鱼miR-92家族二级结构预测图Fig.2.1SecondarystructurepredictionofmiR-92familyinamphioxus.2.2.2miR-92家族在不同物种的分布基于物种的进化地位，选择了包括白氏文昌鱼（Branchiostomabelcheri）、斑马鱼（Daniorerio）、牛（Bostaurus）、大鼠（Rattusnorvegicus）、人（Homosapiens）、非洲爪蟾蜍（Xenopuslaevis）、佛罗里达文昌鱼（Branchiostomafloridae）、海七鳃鳗（Petromyzonmarinus）、玻璃海鞘（Cionaintestinalis）、猪（Susscrofa）、家犬（Canisfamiliaris）、马（Equuscaballus）和紫海胆（Strongylocentrotuspurpuratus）在内的13个物种（图2.2），对各物种中miR-92家族成员的分布情况进行了分析，结果如图2.3所示，发现miR-92家族成员在从棘皮动物到脊椎动物miR-92a中均有分布，其中miR-92a和miR-92b在除了七鳃鳗外的所有物种中均有分布；而miR-92c、miR-92d和miR-92e则只分布在无脊椎动物中，其中miR-92c存在于海胆、文昌鱼及海鞘中，而miR-92d和miR-92e仅在海胆和海鞘中存在。
【参考文献】：
期刊论文
[1]miR-92基因进化及在鸡不同发育时期组织表达谱和其功能预测分析[J]. 张蒙,李芳,蒋可人,李国喜,韩瑞丽,李转见,王彦彬,康相涛,孙桂荣. 家畜生态学报. 2016(10)
[2]文昌鱼分类学研究及展望[J]. 王义权,方少华. 动物学研究. 2005(06)
[3]活化石文昌鱼[J]. 曾昭爽. 海洋世界. 2002(02)
[4]文昌鱼──研究脊椎动物起源和进化的模式动物[J]. 张士璀,袁金铎,李红岩. 生命科学. 2001(05)
[5]从文昌鱼个体发生谈脊椎动物起源[J]. 张士璀,吴贤汉. 海洋科学. 1995(04)
[6]国家二级动物文昌鱼受到保护[J]. 本刊编辑部. 福建水产. 1991(03)
[7]厦门文昌鱼性腺发育的周年变化[J]. 方永强,齐襄,梁苹,洪桂英. 海洋学报(中文版). 1990(05)
本文编号：3453655
【文章来源】：南京师范大学江苏省 211工程院校
【文章页数】：60 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
白氏文昌鱼拍摄于实验室Fig1.1Branchiostomabelcheriphotographedinthelaboratory
第一章绪论7等）和转录因子（如AP-1、NF-κB等）。TLR通路通过级联反应激活转录因子最终促进下游细胞因子的表达，进而参与机体抵御病原体的免疫反应[40,41]。图1.3人类TLR信号通路的示意图Fig1.3SchematicdiagramofthehumanTLRsignalingpathway[42]1.5.2IKK基因的功能作用机制IKK（InhibitorOfNuclearFactorKappa-BKinase）是经典免疫调控通路TLR通路里的关键基因。转录因子NF-κB通常由促炎信号因子激活来调节体内的炎症反应。NF-κB未被激活前，稳定的存在于细胞质中与I-κB形成复合物；当细胞受到刺激时，I-κB会被IKK复合物磷酸化而降解，从而暴露出NF-κB的核定位序列，进而进入细胞核内行使转录因子的调控作用。IKK复合物包含多个亚基，主要作用是使I-κB磷酸化，IKKα和IKKβ是两个序列高度相似的蛋白激酶，是NF-κB激活的大多数信号通路的汇聚点[43]。细胞内大部分IKKα和IKKβ分子都是IKK复合物的一部分，IKK复合物还包含一个名为IKKγ或NEMO（NF-κBessentialmodulator）的调节亚基。尽管有广泛的序列相似性，IKKα和IKKβ由于其不同的底物特性和调控模式，在很大程度上具有不同的功能。IKKβ(和IKKγ)是通过触发促炎反应(如TNFα或脂多糖(LPS))来快速激活NF-κB的关键。相比之下，IKKα在TNF家族成员的亚群中激活特定形式的NF-κB，也可能减弱IKKβ
第二章miR-92家族的生物信息学分析13图2.1白氏文昌鱼miR-92家族二级结构预测图Fig.2.1SecondarystructurepredictionofmiR-92familyinamphioxus.2.2.2miR-92家族在不同物种的分布基于物种的进化地位，选择了包括白氏文昌鱼（Branchiostomabelcheri）、斑马鱼（Daniorerio）、牛（Bostaurus）、大鼠（Rattusnorvegicus）、人（Homosapiens）、非洲爪蟾蜍（Xenopuslaevis）、佛罗里达文昌鱼（Branchiostomafloridae）、海七鳃鳗（Petromyzonmarinus）、玻璃海鞘（Cionaintestinalis）、猪（Susscrofa）、家犬（Canisfamiliaris）、马（Equuscaballus）和紫海胆（Strongylocentrotuspurpuratus）在内的13个物种（图2.2），对各物种中miR-92家族成员的分布情况进行了分析，结果如图2.3所示，发现miR-92家族成员在从棘皮动物到脊椎动物miR-92a中均有分布，其中miR-92a和miR-92b在除了七鳃鳗外的所有物种中均有分布；而miR-92c、miR-92d和miR-92e则只分布在无脊椎动物中，其中miR-92c存在于海胆、文昌鱼及海鞘中，而miR-92d和miR-92e仅在海胆和海鞘中存在。
【参考文献】：
期刊论文
[1]miR-92基因进化及在鸡不同发育时期组织表达谱和其功能预测分析[J]. 张蒙,李芳,蒋可人,李国喜,韩瑞丽,李转见,王彦彬,康相涛,孙桂荣. 家畜生态学报. 2016(10)
[2]文昌鱼分类学研究及展望[J]. 王义权,方少华. 动物学研究. 2005(06)
[3]活化石文昌鱼[J]. 曾昭爽. 海洋世界. 2002(02)
[4]文昌鱼──研究脊椎动物起源和进化的模式动物[J]. 张士璀,袁金铎,李红岩. 生命科学. 2001(05)
[5]从文昌鱼个体发生谈脊椎动物起源[J]. 张士璀,吴贤汉. 海洋科学. 1995(04)
[6]国家二级动物文昌鱼受到保护[J]. 本刊编辑部. 福建水产. 1991(03)
[7]厦门文昌鱼性腺发育的周年变化[J]. 方永强,齐襄,梁苹,洪桂英. 海洋学报(中文版). 1990(05)
本文编号：3453655
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