隆线溞线粒体基因组序列的测定与分析
发布时间:2021-10-24 00:45
隆线溞(Daphnia carinata)为节肢动物门(Arthropoda)、甲壳纲(Crustacea)、鳃足亚纲(Branchiapoda)、枝角目(Clasocera)、溞科(Daphniidae)动物,在淡水生态系统中占有重要位置,绝大多数生活于池塘、湖泊以及江河中。溞属动物物种形态鉴定标准仍存在许多模糊不清之处,利用分子生物学手段可有效重估不同溞属动物形态型的分类地位,并揭示形态相似种群的真正变异。本文旨在测定隆线溞线粒体基因组序列,分析其基因组成和结构特征,进而为研究溞属动物的分子系统进化提供依据。本研究采用LA-PCR和普通PCR方法,获得隆线溞线粒体基因组序列,并对序列进行了组装和注释,拼接后得到了14747bp的隆线溞mtDNA序列。这段序列A、T、G、C碱基的含量分别为33.8%、36.5%、14.4%、15.3%, GC-Skew值为-0.009,AT-Skew值为-0.027。通过序列同源性和结构分析,鉴定了36个基因,包括13个蛋白编码基因、21个tRNA基因和2个rRNA,推测到未能扩增到的基因包括tRNAIle、tRNAMet以及控制区。在13个蛋白质编...
【文章来源】:淮北师范大学安徽省
【文章页数】:50 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
溞属雌体模式图
实验设计简图
隆线溞基因组DNA的提取M,λ-HindIIIdigestDNAMarker;1,基因组总DNAFig.3-1TheextractedgenomeDNAofD.carinata
【参考文献】:
期刊论文
[1]百宜黑鸡与兴义矮脚鸡线粒体DNA控制区遗传多样性分析[J]. 王文涛,陈彬,阳光远,傅筑荫. 中国畜牧兽医. 2011(06)
[2]百宜黑鸡与长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列分析[J]. 王文涛,阳光远,陈彬. 河南农业科学. 2011(05)
[3]贝叶斯推论及其在百合目分子系统学中的应用[J]. 陈士超,杨红,李珊,祝建,傅承新. 云南植物研究. 2007(02)
[4]线粒体基因组全序列研究与动物分子系统发生的关系[J]. 李耀东,邵嘉会. 青海医学院学报. 2006(01)
[5]扬子鳄的线粒体全基因组与鳄类系统发生[J]. 吴孝兵,王义权,周开亚,朱伟铨,聂继山,王朝林. 科学通报. 2003(18)
[6]四种臂尾轮虫线粒体COⅠ基因部分序列及系统发育关系[J]. 鲍蕾,牛翠娟,马蕊,李庆芬. 动物学研究. 2003(03)
[7]形目12种鸟类线粒体细胞色素b基因序列差异及其系统发育关系[J]. 陈晓芳,王翔,袁晓东,汤敏谦,李玉祥,郭玉梅,李庆伟. 遗传学报. 2003(05)
[8]家蚕线粒体基因组全序列测定与分析[J]. 鲁成,刘运强,廖顺尧,李斌,向仲怀,韩华,王学刚. 农业生物技术学报. 2002(02)
[9]分子进化树的构建[J]. 吕宝忠. 动物学研究. 1993(02)
[10]动物线粒体DNA多态性的研究概况[J]. 张亚平,施立明. 动物学研究. 1992(03)
硕士论文
[1]鲢、鳙鳃部寄生鲢中华鳋线粒体基因组研究[D]. 彭国祥.华中农业大学 2008
本文编号:3454239
【文章来源】:淮北师范大学安徽省
【文章页数】:50 页
【学位级别】:硕士
【部分图文】:
溞属雌体模式图
实验设计简图
隆线溞基因组DNA的提取M,λ-HindIIIdigestDNAMarker;1,基因组总DNAFig.3-1TheextractedgenomeDNAofD.carinata
【参考文献】:
期刊论文
[1]百宜黑鸡与兴义矮脚鸡线粒体DNA控制区遗传多样性分析[J]. 王文涛,陈彬,阳光远,傅筑荫. 中国畜牧兽医. 2011(06)
[2]百宜黑鸡与长顺绿壳蛋鸡线粒体DNA控制区全序列分析[J]. 王文涛,阳光远,陈彬. 河南农业科学. 2011(05)
[3]贝叶斯推论及其在百合目分子系统学中的应用[J]. 陈士超,杨红,李珊,祝建,傅承新. 云南植物研究. 2007(02)
[4]线粒体基因组全序列研究与动物分子系统发生的关系[J]. 李耀东,邵嘉会. 青海医学院学报. 2006(01)
[5]扬子鳄的线粒体全基因组与鳄类系统发生[J]. 吴孝兵,王义权,周开亚,朱伟铨,聂继山,王朝林. 科学通报. 2003(18)
[6]四种臂尾轮虫线粒体COⅠ基因部分序列及系统发育关系[J]. 鲍蕾,牛翠娟,马蕊,李庆芬. 动物学研究. 2003(03)
[7]形目12种鸟类线粒体细胞色素b基因序列差异及其系统发育关系[J]. 陈晓芳,王翔,袁晓东,汤敏谦,李玉祥,郭玉梅,李庆伟. 遗传学报. 2003(05)
[8]家蚕线粒体基因组全序列测定与分析[J]. 鲁成,刘运强,廖顺尧,李斌,向仲怀,韩华,王学刚. 农业生物技术学报. 2002(02)
[9]分子进化树的构建[J]. 吕宝忠. 动物学研究. 1993(02)
[10]动物线粒体DNA多态性的研究概况[J]. 张亚平,施立明. 动物学研究. 1992(03)
硕士论文
[1]鲢、鳙鳃部寄生鲢中华鳋线粒体基因组研究[D]. 彭国祥.华中农业大学 2008
本文编号:3454239
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