刺参不同群体遗传多样性分析

发布时间：2021-11-04 07:39

　　刺参（Apostichopus japonicus）隶属于棘皮动物门、游走亚门、海参纲、楯手目、刺参科，自然分布在西太平洋的中国、韩国、日本沿海，深受这些国家人民的喜爱。利用分子标记的方法研究刺参的遗传多样性是近些年发展起来的。本文利用SSR与COⅠ两种分子标记方法对大连自然刺参群体与养殖刺参群体进行遗传多样性研究和遗传结构比对分析。结果表明，SSR标记揭示了自然群体具有高度的遗传多样性。筛选获得33对引物，目的片段大小为67-306bp之间；每个引物检测出等位基因数3-8不等；有效等位基因平均为4.736个；期望杂合度He和观测杂合度Ho分别为0.270-0.8446和0.598-0.875；大连海域自然群体的多态信息含量平均数为0.732，说明遗传多样性丰富；共有23对引物符合哈迪温伯格平衡，被检测位点偏离Hardy–Weinberg平衡的现象普遍存在，我们认为这可能是由实验所采用的样本数量和规格大小有限或者是由于无效等位基因的存在。COⅠ序列对野生和养殖群体测序、比对和对位排列后的结果表明，有654个碱基具有同源序列，共四个群体选取49个体，40个个体发现变异位点（YSA9个、Y... 

【文章来源】：大连海洋大学辽宁省

【文章页数】：59 页

【学位级别】：硕士

【部分图文】：

普通方法提取刺参DNA1％琼脂糖电泳图（M=DL2000）

改进方法提取刺参DNA1％琼脂糖电泳图（M=DL2000）

退火温度60℃全部引物同一基因组PCR检测电泳图

【参考文献】：
期刊论文
[1]利用DNA条形码技术鉴定一批鳄鱼产品[J]. 郭凤娟,阳建春,胡诗佳,李咏施.  生物技术通报. 2013(08)
[2]基于COI基因序列的太湖新银鱼遗传多样性[J]. 张迪,雷光春,龚成,王忠锁.  湖泊科学. 2012(02)
[3]亚洲黑熊COI序列变异及其DNA条码的应用[J]. 鲁再丰,蒋国红,白素英.  东北林业大学学报. 2010(10)
[4]福建近海蓝圆鲹种群遗传多样性的AFLP分析[J]. 张丽艳,苏永全,丁少雄,牛素芳,刘东腾,王军.  水产学报. 2010(05)
[5]基于线粒体CO1基因的DNA条形码在石首鱼科（Sciaenidae）鱼类系统分类中的应用[J]. 柳淑芳,陈亮亮,戴芳群,庄志猛.  海洋与湖沼. 2010(02)
[6]舟山鮸鱼群体遗传多样性的AFLP研究[J]. 彭志兰,柳敏海,傅荣兵,罗海忠,夏枫峰,徐志进.  上海海洋大学学报. 2010(02)
[7]中国东海日本鳗鲡种群遗传结构的AFLP分析[J]. 张辛,许璞,许广平,刘培庭,仲霞铭,李旭光,徐健荣,丁亚平,许晓风.  水生态学杂志. 2010(01)
[8]三种蛏的遗传多样性分析[J]. 邵艳卿,陆荣茂,董迎辉,柴雪良,肖国强,林志华.  海洋科学. 2009(10)
[9]4种海参16S rRNA和COI基因片段序列比较及系统学研究[J]. 陈丽梅,李琪,李赟.  中国水产科学. 2008(06)
[10]单核苷酸多态性及其在水产动物遗传育种中的应用[J]. 刘福平,白俊杰.  中国水产科学. 2008(04)

博士论文
[1]仿刺参（Apostichopus japonicus）分子标记开发及应用[D]. 鄢婧婧.中国海洋大学 2013

硕士论文
[1]威海仿刺参野生种群遗传多样性分析[D]. 陶翠花.山东大学 2009



本文编号：3475297