基于线粒体COⅠ的南海北部长棘银鲈遗传多样性分析
发布时间:2021-11-13 05:14
为了解中国长棘银鲈(Gerres filamentosus)的遗传背景以更好地保护与开发利用种质资源,测定了南海北部7个群体线粒体COⅠ基因5′端序列,以分析其遗传多样性和遗传结构。结果发现,176尾长棘银鲈652 bp序列中有25个单倍型,155个变异位点。7个群体整体呈现较高的单倍型多样性(Hd=0.767±0.018)与较低的核苷酸多样性(π=0.055 0±0.003 7)。就遗传多样性指数而言,碣石群体(Hd=0.606±0.092,π=0.059 2±0.006 6)最高,次高为阳江群体(Hd=0.323±0.102,π=0.027 0±0.010 7);琼海群体(Hd=0.560±0.125,π=0.001 0±0.000 3)最低,次低为陵水群体(Hd=0.685±0.077,π=0.001 5±0.000 3)。群体遗传分化系数Fst显示,碣石、阳江群体与其他群体间存在高度(极显著)的遗传分化(Fst=0.517 1...
【文章来源】:海洋渔业. 2020,42(03)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
长棘银鲈单倍型网络图
表4 长棘银鲈中性检验和不对称分析Tab.4 Neutrality tests and mismatch analysisof G. filamentosus 群体Population Tajima’s D Fu’s Fs test SSD Rg JS 3.281 3 21.930 0.464 1*** 0.179 0 YJ -0.442 5 19.719 0.046 5* 0.476 1 QH -0.010 9 -0.072 1 0.024 4 0.191 0 LS -1.518 6* -3.293 6** 0.010 7 0.120 9 DF -2.590 6*** 9.479 7 0.025 0 0.162 1 XY -2.650 4*** 2.255 5 0.006 9 0.078 2 DX -1.429 9 -2.075 5 0.010 1 0.069 3 总体Total -0.765 9 6.849 1 0.084 0 0.182 4 注:JS:碣石;YJ:阳江;QH:琼海;LS:陵水;DF:东方;XY:新盈;DX:东兴。*:0.01<P<0.05;**:0.001<P<0.01; ***:P<0.001Note:JS:Jieshi;YJ:Yangjiang;QH:Qionghai;LS:Lingshui;DF:Dongfang;XY:Xinying;DX:Dongxing.*:0.01<P<0.05;**:0.001<P<0.01;***:P<0.0013 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于COI基因和D-loop区部分序列比较雷州半岛东、西岸湖栖鳍虾虎鱼群体的遗传多样性[J]. 廖健,龙水生,贺亮,郭昱嵩,刘楚吾,刘丽,王中铎. 海洋科学. 2017(02)
[2]浅地层剖面揭示琼州海峡的形成时代[J]. 倪玉根,夏真,马胜中. 海洋地质与第四纪地质. 2014(04)
[3]北部湾秋季底层鱼类多样性和优势种数量的变动趋势[J]. 王雪辉,邱永松,杜飞雁,林昭进,孙典荣,黄硕琳. 生态学报. 2012(02)
[4]一种高效快速的鱼类标本基因组DNA提取方法[J]. 乐小亮,章群,赵爽,范凤娟. 生物技术通报. 2010(02)
[5]琼州海峡成因与时代[J]. 赵焕庭,王丽荣,袁家义. 海洋地质与第四纪地质. 2007(02)
[6]北部湾主要经济鱼类资源变动分析及保护对策探讨[J]. 孙典荣,林昭进. 热带海洋学报. 2004(02)
[7]海南岛海岸环境特征[J]. 王颖. 海洋地质动态. 2002(03)
[8]数值分类法在中国银鲈属鱼种分类研究中的应用[J]. 刘静,田明诚. 海洋科学. 1997(01)
本文编号:3492392
【文章来源】:海洋渔业. 2020,42(03)北大核心CSCD
【文章页数】:9 页
【部分图文】:
长棘银鲈单倍型网络图
表4 长棘银鲈中性检验和不对称分析Tab.4 Neutrality tests and mismatch analysisof G. filamentosus 群体Population Tajima’s D Fu’s Fs test SSD Rg JS 3.281 3 21.930 0.464 1*** 0.179 0 YJ -0.442 5 19.719 0.046 5* 0.476 1 QH -0.010 9 -0.072 1 0.024 4 0.191 0 LS -1.518 6* -3.293 6** 0.010 7 0.120 9 DF -2.590 6*** 9.479 7 0.025 0 0.162 1 XY -2.650 4*** 2.255 5 0.006 9 0.078 2 DX -1.429 9 -2.075 5 0.010 1 0.069 3 总体Total -0.765 9 6.849 1 0.084 0 0.182 4 注:JS:碣石;YJ:阳江;QH:琼海;LS:陵水;DF:东方;XY:新盈;DX:东兴。*:0.01<P<0.05;**:0.001<P<0.01; ***:P<0.001Note:JS:Jieshi;YJ:Yangjiang;QH:Qionghai;LS:Lingshui;DF:Dongfang;XY:Xinying;DX:Dongxing.*:0.01<P<0.05;**:0.001<P<0.01;***:P<0.0013 讨论
【参考文献】:
期刊论文
[1]基于COI基因和D-loop区部分序列比较雷州半岛东、西岸湖栖鳍虾虎鱼群体的遗传多样性[J]. 廖健,龙水生,贺亮,郭昱嵩,刘楚吾,刘丽,王中铎. 海洋科学. 2017(02)
[2]浅地层剖面揭示琼州海峡的形成时代[J]. 倪玉根,夏真,马胜中. 海洋地质与第四纪地质. 2014(04)
[3]北部湾秋季底层鱼类多样性和优势种数量的变动趋势[J]. 王雪辉,邱永松,杜飞雁,林昭进,孙典荣,黄硕琳. 生态学报. 2012(02)
[4]一种高效快速的鱼类标本基因组DNA提取方法[J]. 乐小亮,章群,赵爽,范凤娟. 生物技术通报. 2010(02)
[5]琼州海峡成因与时代[J]. 赵焕庭,王丽荣,袁家义. 海洋地质与第四纪地质. 2007(02)
[6]北部湾主要经济鱼类资源变动分析及保护对策探讨[J]. 孙典荣,林昭进. 热带海洋学报. 2004(02)
[7]海南岛海岸环境特征[J]. 王颖. 海洋地质动态. 2002(03)
[8]数值分类法在中国银鲈属鱼种分类研究中的应用[J]. 刘静,田明诚. 海洋科学. 1997(01)
本文编号:3492392
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