长江上游中华纹胸鮡遗传多样性及结构研究
发布时间：2021-11-20 20:03
长江上游是生物多样性丰富区,也是长江特有鱼类栖息的生态敏感区。中华纹胸鮡属鲇形目（Siluriformes）、鮡科（Sisoridae）、纹胸鮡属（Glyptothorax）,是一种小型底栖鱼类,对生存环境有着高度依赖性和适应性,分布也较为广泛,既可生活在高山峡谷河流中,也可在平原湖泊及河流中,形成了不同的生态群,是研究生物地理学和环境适应性的良好对象。近年来长江上游水电梯级开发造成鱼类栖息地缩小和破碎化,对其生境及自然资源产生了重大影响,遗传多样性和遗传结构的研究有助于种质资源评估和保护措施的制定。根据中华纹胸鮡的分布,2017-2018年在长江上游干流[巴南（BN）、江津（JJ）、合江（HJ）、泸州（LZ）、南溪（NX）]、岷江[犍为（QW）]、金沙江中游[攀枝花（PZH）]、金沙江下游[巧家（QJ）]及支流黑水河[宁南（NN）]9个江段共采集341尾中华纹胸鮡,对中华纹胸鮡开展了群体遗传研究,主要研究结果如下:1. 采用cyt b和COI序列对长江上游、岷江、金沙江中游、金沙江下游及支流黑水河9个群体共341尾样本进行分析,结果显示:（1）遗传多样性:cyt b序列共检测到80个...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：56 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
中华纹胸鮡(长江水产研究所，2018)
上海海洋大学硕士学位论文9GGGCTCCGATCTCCGGATTACAAGAC-3ˊ[68]；COI基因扩增引物为FishR1：5ˊ-TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA-3ˊ以及FishF1：5ˊ-TCAACCAACCACAAAGACATTGGAC-3ˊ[69]。两个基因采用相同PCR扩增体系和反应程序，50μL的体系包含MasterMix酶(2，武汉天一辉远生物科技有限公司)25μL，10μmol/L引物各2μL，DNA模板2μL，灭菌去离子水补至50μL。图2-1中华纹胸鮡采样位点Fig.2-1SamplingsitesofG.sinensisPCR扩增反应程序如图2-2所示：图2-2PCR扩增反应程序Fig.2-2ProcedureofPCRamplificationreaction扩增产物用1%琼脂糖检测，将扩增效果良好的扩增产物送至武汉天一辉远生物科技有限公司进行双向测序，测序引物与PCR引物相同。
上海海洋大学硕士学位论文9GGGCTCCGATCTCCGGATTACAAGAC-3ˊ[68]；COI基因扩增引物为FishR1：5ˊ-TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA-3ˊ以及FishF1：5ˊ-TCAACCAACCACAAAGACATTGGAC-3ˊ[69]。两个基因采用相同PCR扩增体系和反应程序，50μL的体系包含MasterMix酶(2，武汉天一辉远生物科技有限公司)25μL，10μmol/L引物各2μL，DNA模板2μL，灭菌去离子水补至50μL。图2-1中华纹胸鮡采样位点Fig.2-1SamplingsitesofG.sinensisPCR扩增反应程序如图2-2所示：图2-2PCR扩增反应程序Fig.2-2ProcedureofPCRamplificationreaction扩增产物用1%琼脂糖检测，将扩增效果良好的扩增产物送至武汉天一辉远生物科技有限公司进行双向测序，测序引物与PCR引物相同。
【参考文献】：
期刊论文
[1]长江白鲟灭绝敲响生态警钟[J]. 张涛,杨丽. 生态经济. 2020(03)
[2]基于线粒体cytb序列的花斑蛇鲻种群遗传结构研究[J]. 李敏,黄梓荣,许友伟,陈作志. 南方水产科学. 2019(06)
[3]基于线粒体基因nd5对长江上游黑尾近红鲌遗传多样性分析[J]. 严太明,王雄延,罗杰,李松,张骞,何亮,张松培,何佳洋,何智. 四川农业大学学报. 2019(05)
[4]基于微卫星标记的黄唇鱼遗传多样性研究[J]. 赵彦花,区又君,温久福,李加儿,周慧. 南方水产科学. 2019(04)
[5]5种类型鲤鱼线粒体DNA D-loop及邻近区段的遗传多样性分析[J]. 白云,王妍,胡莹,张兴华,金万昆,高永平,杨建新,董仕. 水产科学. 2019(04)
[6]基于CO I和Cytb DNA条形码在鲌属鱼类物种鉴定中的应用[J]. 王利华,罗相忠,王丹,李伟,李忠,邹桂伟,梁宏伟. 淡水渔业. 2019(04)
[7]DNA条形码在西藏水系裂腹鱼亚科鱼类鉴定中的研究[J]. 周建设,张驰,刘海平,马波,王万良,曾本和,牟振波. 淡水渔业. 2019(01)
[8]长江中上游圆筒吻鮈群体线粒体Cyt b遗传多样性分析[J]. 蒲艳,田辉伍,陈大庆,段辛斌,刘绍平,汪登强. 淡水渔业. 2019(01)
[9]微卫星标记及其在动物亲缘关系鉴定中的应用[J]. 张正义,邢秀梅,胡鹏飞,刘松啸,董依萌,鞠贵春. 基因组学与应用生物学. 2018(04)
[10]长江上游特有鱼类红唇薄鳅线粒体控制区遗传多样性研究[J]. 申绍祎,田辉伍,汪登强,陈大庆,刘绍平. 淡水渔业. 2017(04)
博士论文
[1]长江上游鮈亚科鱼类资源及生境选择策略研究[D]. 高天珩.西南大学 2016
[2]中国鮡科鱼类系统发育、生物地理及高原适应进化研究[D]. 马秀慧.西南大学 2015
[3]半滑舌鳎、牙鲆微卫星遗传连锁图谱的构建[D]. 宋文涛.上海海洋大学 2012
[4]黑斑原鮡遗传多样性分析及微卫星标记的开发[D]. 郭宝英.华中农业大学 2009
硕士论文
[1]中国光唇鱼属亲缘地理研究[D]. 侯晓静.上海海洋大学 2019
[2]华南及邻近地区不同群体大刺鳅的遗传多样性及亲缘地理研究[D]. 江小璐.广州大学 2018
[3]三种鮡科鱼类线粒体全基因组的测定及鮡科鱼类系统发育分析[D]. 李博.华中农业大学 2016
[4]长江上游寡鳞飘鱼和宜昌鳅鮀早期资源研究[D]. 王涵.西南大学 2016
[5]基于微卫星标记和线粒体cytb基因序列的鲇遗传多样性研究[D]. 徐丹丹.西南大学 2013
[6]美洲斑潜蝇多态性微卫星标记筛选及种群遗传结构研究[D]. 季岩.扬州大学 2013
[7]大眼华鳊遗传多样性和亲缘地理学研究[D]. 赵良杰.上海海洋大学 2012
[8]长江上游梯级水电开发对鱼类生物多样性影响的初探[D]. 李陈.华中科技大学 2012
[9]澜沧江老挝纹胸鮡遗传结构分析[D]. 金菊.华中农业大学 2011
[10]怒江扎那纹胸鮡遗传多样性研究[D]. 袁希平.华中农业大学 2009
本文编号：3508017
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：56 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
中华纹胸鮡(长江水产研究所，2018)
上海海洋大学硕士学位论文9GGGCTCCGATCTCCGGATTACAAGAC-3ˊ[68]；COI基因扩增引物为FishR1：5ˊ-TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA-3ˊ以及FishF1：5ˊ-TCAACCAACCACAAAGACATTGGAC-3ˊ[69]。两个基因采用相同PCR扩增体系和反应程序，50μL的体系包含MasterMix酶(2，武汉天一辉远生物科技有限公司)25μL，10μmol/L引物各2μL，DNA模板2μL，灭菌去离子水补至50μL。图2-1中华纹胸鮡采样位点Fig.2-1SamplingsitesofG.sinensisPCR扩增反应程序如图2-2所示：图2-2PCR扩增反应程序Fig.2-2ProcedureofPCRamplificationreaction扩增产物用1%琼脂糖检测，将扩增效果良好的扩增产物送至武汉天一辉远生物科技有限公司进行双向测序，测序引物与PCR引物相同。
上海海洋大学硕士学位论文9GGGCTCCGATCTCCGGATTACAAGAC-3ˊ[68]；COI基因扩增引物为FishR1：5ˊ-TAGACTTCTGGGTGGCCAAAGAATCA-3ˊ以及FishF1：5ˊ-TCAACCAACCACAAAGACATTGGAC-3ˊ[69]。两个基因采用相同PCR扩增体系和反应程序，50μL的体系包含MasterMix酶(2，武汉天一辉远生物科技有限公司)25μL，10μmol/L引物各2μL，DNA模板2μL，灭菌去离子水补至50μL。图2-1中华纹胸鮡采样位点Fig.2-1SamplingsitesofG.sinensisPCR扩增反应程序如图2-2所示：图2-2PCR扩增反应程序Fig.2-2ProcedureofPCRamplificationreaction扩增产物用1%琼脂糖检测，将扩增效果良好的扩增产物送至武汉天一辉远生物科技有限公司进行双向测序，测序引物与PCR引物相同。
【参考文献】：
期刊论文
[1]长江白鲟灭绝敲响生态警钟[J]. 张涛,杨丽. 生态经济. 2020(03)
[2]基于线粒体cytb序列的花斑蛇鲻种群遗传结构研究[J]. 李敏,黄梓荣,许友伟,陈作志. 南方水产科学. 2019(06)
[3]基于线粒体基因nd5对长江上游黑尾近红鲌遗传多样性分析[J]. 严太明,王雄延,罗杰,李松,张骞,何亮,张松培,何佳洋,何智. 四川农业大学学报. 2019(05)
[4]基于微卫星标记的黄唇鱼遗传多样性研究[J]. 赵彦花,区又君,温久福,李加儿,周慧. 南方水产科学. 2019(04)
[5]5种类型鲤鱼线粒体DNA D-loop及邻近区段的遗传多样性分析[J]. 白云,王妍,胡莹,张兴华,金万昆,高永平,杨建新,董仕. 水产科学. 2019(04)
[6]基于CO I和Cytb DNA条形码在鲌属鱼类物种鉴定中的应用[J]. 王利华,罗相忠,王丹,李伟,李忠,邹桂伟,梁宏伟. 淡水渔业. 2019(04)
[7]DNA条形码在西藏水系裂腹鱼亚科鱼类鉴定中的研究[J]. 周建设,张驰,刘海平,马波,王万良,曾本和,牟振波. 淡水渔业. 2019(01)
[8]长江中上游圆筒吻鮈群体线粒体Cyt b遗传多样性分析[J]. 蒲艳,田辉伍,陈大庆,段辛斌,刘绍平,汪登强. 淡水渔业. 2019(01)
[9]微卫星标记及其在动物亲缘关系鉴定中的应用[J]. 张正义,邢秀梅,胡鹏飞,刘松啸,董依萌,鞠贵春. 基因组学与应用生物学. 2018(04)
[10]长江上游特有鱼类红唇薄鳅线粒体控制区遗传多样性研究[J]. 申绍祎,田辉伍,汪登强,陈大庆,刘绍平. 淡水渔业. 2017(04)
博士论文
[1]长江上游鮈亚科鱼类资源及生境选择策略研究[D]. 高天珩.西南大学 2016
[2]中国鮡科鱼类系统发育、生物地理及高原适应进化研究[D]. 马秀慧.西南大学 2015
[3]半滑舌鳎、牙鲆微卫星遗传连锁图谱的构建[D]. 宋文涛.上海海洋大学 2012
[4]黑斑原鮡遗传多样性分析及微卫星标记的开发[D]. 郭宝英.华中农业大学 2009
硕士论文
[1]中国光唇鱼属亲缘地理研究[D]. 侯晓静.上海海洋大学 2019
[2]华南及邻近地区不同群体大刺鳅的遗传多样性及亲缘地理研究[D]. 江小璐.广州大学 2018
[3]三种鮡科鱼类线粒体全基因组的测定及鮡科鱼类系统发育分析[D]. 李博.华中农业大学 2016
[4]长江上游寡鳞飘鱼和宜昌鳅鮀早期资源研究[D]. 王涵.西南大学 2016
[5]基于微卫星标记和线粒体cytb基因序列的鲇遗传多样性研究[D]. 徐丹丹.西南大学 2013
[6]美洲斑潜蝇多态性微卫星标记筛选及种群遗传结构研究[D]. 季岩.扬州大学 2013
[7]大眼华鳊遗传多样性和亲缘地理学研究[D]. 赵良杰.上海海洋大学 2012
[8]长江上游梯级水电开发对鱼类生物多样性影响的初探[D]. 李陈.华中科技大学 2012
[9]澜沧江老挝纹胸鮡遗传结构分析[D]. 金菊.华中农业大学 2011
[10]怒江扎那纹胸鮡遗传多样性研究[D]. 袁希平.华中农业大学 2009
本文编号：3508017
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