长江、黄河、辽河水系中华绒螯蟹野生群体遗传多样性的微卫星分析
发布时间：2022-01-11 08:21
与传统的遗传标记不同,分子标记可以从DNA水平上体现出物种的遗传多样性,其中微卫星DNA标记由于具备诸多优点,通常被认为是群体遗传多样性分析的理想标记。微卫星标记用于中华绒螯蟹（Eriocheir sinensis）群体遗传学分析的研究已有一些报道,然而之前报道由于采样时间较早、水域不同加之中华绒螯蟹（河蟹）野生群体的生存繁衍处在动态变化中,长江、黄河、辽河三个主产水系的遗传现状尚存在不确定性,进一步的种质评价工作有待进行。本研究针对中华绒螯蟹种群遗传多样性的微卫星分析这一目标,为更好的开展微卫星分子标记在河蟹种群遗传分析上的应用,首先从优化DNA提取方法入手,然后比较优选微卫星PCR产物分型技术,最后通过对长江、黄河和辽河三个水系野生河蟹种群的遗传结构加以分析,以期获得河蟹主产水系野生群体的当前的种质资源状况,对河蟹遗传育种工作提供基础资料。1.为优化中华绒螯蟹基因组DNA提取方法,本试验采用酚-氯仿法和吸附柱型试剂盒分别对中华绒螯蟹的鳃、肌肉、血淋巴液和刚毛4种组织进行DNA提取,并从纯度、浓度、片段完整性及微卫星标记PCR扩增效果共4个方面评价提取DNA的质量。结果显示:使用酚-...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：56 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图2-1两种方法对5种材料提取所得DNA电泳结果
图 2-2 两种提取方法下不同组织中 DNA 的微卫星 PCR 产物电泳图2 PAGE profile of PCR product from DNA extracted from 5 kinds of materialmethods
每两个加入了不同颜色荧光标记的位点的 PCR 产物混合后，使用甲酰胺变性，以 ROX-500 作为分子量内标，使用 ABI-3730XL 全自动 DNA 测序仪进行检测分析。GeneMaper-3.5 扫描峰图（见图 3-1），读取目标峰所代表的等位基因片段长度，将数据导入 Microsoft excel 中。
【参考文献】：
期刊论文
[1]中华绒螯蟹37个多态性微卫星标记在亲子遗传中的分离方式分析[J]. 熊良伟,刘志强,严银龙,邱高峰. 水产学报. 2015(02)
[2]中华绒螯蟹RXR基因全长cDNA克隆及表达分析[J]. 王瑶,杨志刚,郭子好,姚琴琴,曾奇韬,杨筱珍,成永旭. 水产学报. 2013(12)
[3]杉木育种群体SSR分子标记遗传多样性分析[J]. 欧阳磊,陈金慧,郑仁华,徐阳,林宇峰,黄金华,叶代全,方扬辉,施季森. 南京林业大学学报(自然科学版). 2014(01)
[4]SSR扩增产物检测方法比较及其实验操作注意事项[J]. 戴剑,张云辉. 种子. 2013(09)
[5]中华绒螯蟹遗传育种研究进展[J]. 张世勇,傅洪拓,乔慧,孙盛明. 中国农学通报. 2013(20)
[6]中华绒螯蟹3个育种基础群体遗传特征的微卫星分析[J]. 唐刘秀,许志强,葛家春,陈乙荣,赵沐子,杨家新. 南京师大学报(自然科学版). 2013(02)
[7]“光合1号”中华绒螯蟹微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J]. 田盛君,李晓东,姜玉声,刘胥,杨红威,原振政,郑岩. 大连海洋大学学报. 2013(03)
[8]酚/氯仿法和盐析法提取人类外周血基因组DNA方法的比较[J]. 宋洁云,刘芳宏,马军,陈远帆,王海俊. 中国实验诊断学. 2013(05)
[9]利用微卫星DNA分子标记分析中华绒螯蟹养殖群体遗传分化[J]. 熊良伟,李真,马克异,邱高峰. 农业生物技术学报. 2012(12)
[10]草鱼野生群体遗传变异的微卫星分析[J]. 傅建军,李家乐,沈玉帮,王荣泉,宣云峰,徐晓雁,陈勇. 遗传. 2013(02)
硕士论文
[1]三疣梭子蟹微卫星富集文库的构建及五个野生地理群的多样性分析[D]. 李晓萍.中国海洋大学 2010
[2]中华绒螯蟹经济性状相关的微卫星标记筛选[D]. 付春鹏.南京农业大学 2009
[3]六个马品种的SSR遗传多样性分析[D]. 布仁其其格.内蒙古农业大学 2007
[4]区域特色农业的培育研究[D]. 金旭辉.扬州大学 2004
本文编号：3582452
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：56 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
图2-1两种方法对5种材料提取所得DNA电泳结果
图 2-2 两种提取方法下不同组织中 DNA 的微卫星 PCR 产物电泳图2 PAGE profile of PCR product from DNA extracted from 5 kinds of materialmethods
每两个加入了不同颜色荧光标记的位点的 PCR 产物混合后，使用甲酰胺变性，以 ROX-500 作为分子量内标，使用 ABI-3730XL 全自动 DNA 测序仪进行检测分析。GeneMaper-3.5 扫描峰图（见图 3-1），读取目标峰所代表的等位基因片段长度，将数据导入 Microsoft excel 中。
【参考文献】：
期刊论文
[1]中华绒螯蟹37个多态性微卫星标记在亲子遗传中的分离方式分析[J]. 熊良伟,刘志强,严银龙,邱高峰. 水产学报. 2015(02)
[2]中华绒螯蟹RXR基因全长cDNA克隆及表达分析[J]. 王瑶,杨志刚,郭子好,姚琴琴,曾奇韬,杨筱珍,成永旭. 水产学报. 2013(12)
[3]杉木育种群体SSR分子标记遗传多样性分析[J]. 欧阳磊,陈金慧,郑仁华,徐阳,林宇峰,黄金华,叶代全,方扬辉,施季森. 南京林业大学学报(自然科学版). 2014(01)
[4]SSR扩增产物检测方法比较及其实验操作注意事项[J]. 戴剑,张云辉. 种子. 2013(09)
[5]中华绒螯蟹遗传育种研究进展[J]. 张世勇,傅洪拓,乔慧,孙盛明. 中国农学通报. 2013(20)
[6]中华绒螯蟹3个育种基础群体遗传特征的微卫星分析[J]. 唐刘秀,许志强,葛家春,陈乙荣,赵沐子,杨家新. 南京师大学报(自然科学版). 2013(02)
[7]“光合1号”中华绒螯蟹微卫星富集文库的构建与多态性标记的筛选[J]. 田盛君,李晓东,姜玉声,刘胥,杨红威,原振政,郑岩. 大连海洋大学学报. 2013(03)
[8]酚/氯仿法和盐析法提取人类外周血基因组DNA方法的比较[J]. 宋洁云,刘芳宏,马军,陈远帆,王海俊. 中国实验诊断学. 2013(05)
[9]利用微卫星DNA分子标记分析中华绒螯蟹养殖群体遗传分化[J]. 熊良伟,李真,马克异,邱高峰. 农业生物技术学报. 2012(12)
[10]草鱼野生群体遗传变异的微卫星分析[J]. 傅建军,李家乐,沈玉帮,王荣泉,宣云峰,徐晓雁,陈勇. 遗传. 2013(02)
硕士论文
[1]三疣梭子蟹微卫星富集文库的构建及五个野生地理群的多样性分析[D]. 李晓萍.中国海洋大学 2010
[2]中华绒螯蟹经济性状相关的微卫星标记筛选[D]. 付春鹏.南京农业大学 2009
[3]六个马品种的SSR遗传多样性分析[D]. 布仁其其格.内蒙古农业大学 2007
[4]区域特色农业的培育研究[D]. 金旭辉.扬州大学 2004
本文编号：3582452
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