南海黄鳍马面鲀（Thamnaconus hypargyreus）种群分析
发布时间：2022-01-15 22:07
黄鳍马面鲀（Thamnaconus hypargyreus）是具有较高经济价值的鱼类，曾是南海最大宗的高产鱼种，是底拖网作业的主要捕捞对象。鲀形目（Tetraodontiformes）鱼类的分子系统学研究是国内外关注的热点，从种至目各分类阶元的系统发育研究中，多数是利用了部分或全部的线粒体基因组序列。为此，本研究通过设计15对引物进行PCR扩增并测序，首次获得了黄鳍马面鲀线粒体基因组DNA（MitochondrialDNA, mtDNA）全序列，并结合马面鲀属其它种类的mtDNA进行了线粒体全基因组水平的系统发育分析。黄鳍马面鲀mtDNA基因组序列全长16438bp，A+T含量为53.5%，其mtDNA由2个rRNA基因、13个蛋白质编码基因、22个tRNA基因和1段786bp非编码的控制区（D-loop）所组成。除COⅠ起始密码子为GTG以外，其余蛋白质编码基因均以ATG为起始密码子。除了COⅡ, ND4和Cyt b使用不完全密码子（T或TA）为终止密码子以外，其余均使用典型的终止密码子TAA或TAG。除ND6和tRNAGln、tRNAAla、tRNAAsn、tRNACys、tRNA...
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：77 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于黄鳍马面鲀等17种鱼类的线粒体基因组核苷酸全序列构建的分子系统树(a-NJ树；b-MP树)
图 3-1 黄鳍马面鲀样本采集地点示意图Figure 3-1 A sketch map of sampling sites of T. hypargyreus表3-1 黄鳍马面鲀样本采集信息Table 3-1 Sampling data of T. hypargyreus
图 3-2 黄鳍马面鲀单倍型的 MJ 网络图(圆圈面积表示单倍型的频率)Figure 3-2 Median-joining network of the 58 haplotypes of T. hypargyreus(Size of circle was proportional to haplotype frequency)为 H1~H10、H13、H19、H26 和 H27。单倍型 H1 分布最广，所有群体均有
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于线粒体Cyt b基因的黄鳍马面鲀种群分析[J]. 李玉芳,李永振,陈国宝,孙典荣,于杰,崔科. 水产学报. 2014(01)
[2]长江中下游5个湖泊黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）种群线粒体细胞色素b基因的遗传变异分析[J]. 钟立强,刘朋朋,潘建林,王明华,陈友明,秦钦,边文冀,陈校辉. 湖泊科学. 2013(02)
[3]南海金线鱼属Nemipterus鱼类COⅠ和Cytb基因片段的比较分析[J]. 董丽娜,黄梓荣,李永振,陈国宝. 中国水产科学. 2012(02)
[4]基于Cytb基因序列研究5个地理种群叉尾斗鱼的遗传变异[J]. 刘宏毅,黎明星,肖俊,甘西,张明. 水生生物学报. 2011(06)
[5]基于线粒体D-loop区比较分析野生与养殖斜带髭鲷种群的遗传多样性[J]. 陈竹,钟山,罗大极,杨国华,梁日深,邹记兴. 水生生物学报. 2011(05)
[6]瓦氏黄颡鱼线粒体全基因组序列分析及系统进化[J]. 李林,梁宏伟,李忠,罗相忠,呼光富,张志伟,朱媛媛,邹桂伟. 遗传. 2011(06)
[7]北部湾3种金线鱼属鱼类COI基因序列的比较分析[J]. 董丽娜,黄梓荣,艾红,卢伟华,李希国,李娜娜,李夏,李永振. 中国水产科学. 2011(03)
[8]条石鲷线粒体COⅠ和Cytb序列的遗传变异分析[J]. 孙鹏,尹飞,彭士明,施兆鸿. 水产学报. 2011(03)
[9]斑尾复虾虎鱼群体遗传多样性比较分析[J]. 宋娜,宋林,高天翔,孙希福. 水产学报. 2011(03)
[10]竹筴鱼属鱼类线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析[J]. 苏天凤,江世贵. 南方水产科学. 2011(01)
博士论文
[1]暗纹东方鲀线粒体基因组全序列和CD8基因的克隆与表达特征分析[D]. 邵爱华.苏州大学 2012
[2]长江流域几种重要鱼类的分子标记筛选开发及群体遗传分析[D]. 廖小林.中国科学院研究生院（水生生物研究所） 2006
硕士论文
[1]南海北部陆架区金线鱼（Nemipterus virgatus）种群分子分析[D]. 董丽娜.上海海洋大学 2011
[2]分子生物学方法鉴定河豚鱼鱼种的研究[D]. 李文静.中国疾病预防控制中心 2009
本文编号：3591404
【文章来源】：上海海洋大学上海市
【文章页数】：77 页
【学位级别】：硕士
【部分图文】：
基于黄鳍马面鲀等17种鱼类的线粒体基因组核苷酸全序列构建的分子系统树(a-NJ树；b-MP树)
图 3-1 黄鳍马面鲀样本采集地点示意图Figure 3-1 A sketch map of sampling sites of T. hypargyreus表3-1 黄鳍马面鲀样本采集信息Table 3-1 Sampling data of T. hypargyreus
图 3-2 黄鳍马面鲀单倍型的 MJ 网络图(圆圈面积表示单倍型的频率)Figure 3-2 Median-joining network of the 58 haplotypes of T. hypargyreus(Size of circle was proportional to haplotype frequency)为 H1~H10、H13、H19、H26 和 H27。单倍型 H1 分布最广，所有群体均有
【参考文献】：
期刊论文
[1]基于线粒体Cyt b基因的黄鳍马面鲀种群分析[J]. 李玉芳,李永振,陈国宝,孙典荣,于杰,崔科. 水产学报. 2014(01)
[2]长江中下游5个湖泊黄颡鱼（Pelteobagrus fulvidraco）种群线粒体细胞色素b基因的遗传变异分析[J]. 钟立强,刘朋朋,潘建林,王明华,陈友明,秦钦,边文冀,陈校辉. 湖泊科学. 2013(02)
[3]南海金线鱼属Nemipterus鱼类COⅠ和Cytb基因片段的比较分析[J]. 董丽娜,黄梓荣,李永振,陈国宝. 中国水产科学. 2012(02)
[4]基于Cytb基因序列研究5个地理种群叉尾斗鱼的遗传变异[J]. 刘宏毅,黎明星,肖俊,甘西,张明. 水生生物学报. 2011(06)
[5]基于线粒体D-loop区比较分析野生与养殖斜带髭鲷种群的遗传多样性[J]. 陈竹,钟山,罗大极,杨国华,梁日深,邹记兴. 水生生物学报. 2011(05)
[6]瓦氏黄颡鱼线粒体全基因组序列分析及系统进化[J]. 李林,梁宏伟,李忠,罗相忠,呼光富,张志伟,朱媛媛,邹桂伟. 遗传. 2011(06)
[7]北部湾3种金线鱼属鱼类COI基因序列的比较分析[J]. 董丽娜,黄梓荣,艾红,卢伟华,李希国,李娜娜,李夏,李永振. 中国水产科学. 2011(03)
[8]条石鲷线粒体COⅠ和Cytb序列的遗传变异分析[J]. 孙鹏,尹飞,彭士明,施兆鸿. 水产学报. 2011(03)
[9]斑尾复虾虎鱼群体遗传多样性比较分析[J]. 宋娜,宋林,高天翔,孙希福. 水产学报. 2011(03)
[10]竹筴鱼属鱼类线粒体DNA控制区结构及其系统发育分析[J]. 苏天凤,江世贵. 南方水产科学. 2011(01)
博士论文
[1]暗纹东方鲀线粒体基因组全序列和CD8基因的克隆与表达特征分析[D]. 邵爱华.苏州大学 2012
[2]长江流域几种重要鱼类的分子标记筛选开发及群体遗传分析[D]. 廖小林.中国科学院研究生院（水生生物研究所） 2006
硕士论文
[1]南海北部陆架区金线鱼（Nemipterus virgatus）种群分子分析[D]. 董丽娜.上海海洋大学 2011
[2]分子生物学方法鉴定河豚鱼鱼种的研究[D]. 李文静.中国疾病预防控制中心 2009
本文编号：3591404
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